Виды вируса
Ксенотропный вирус лейкемии мышей ( XMRV ) — это ретровирус , который был впервые описан в 2006 году как, по-видимому, новый человеческий патоген, обнаруженный в образцах тканей мужчин с раком предстательной железы . [1] [2] Первоначальные сообщения ошибочно связывали вирус с раком предстательной железы, а затем с синдромом хронической усталости (СХУ), что привело к значительному интересу в научных и пациентских сообществах, исследованию XMRV как потенциальной причины множества заболеваний и обеспокоенности общественного здравоохранения относительно безопасности донорской крови . [3] [4] [5]
Ксенотропные вирусы реплицируются или размножаются в клетках, отличных от клеток вида-хозяина. [6] Мышиный относится к семейству грызунов Muridae , которое включает обычных домашних крыс и мышей. [7]
Последующие исследования установили, что XMRV на самом деле был лабораторным загрязнителем, а не новым патогеном [4] [5] и был непреднамеренно создан в лаборатории посредством генетической рекомбинации между двумя мышиными ретровирусами во время размножения линии клеток рака простаты в середине 1990-х годов. [3] [4] [5] Эти результаты подняли серьезные вопросы относительно результатов исследований, связанных с XMRV, которые якобы обнаружили связь между XMRV и заболеваниями человека. [8] По состоянию на 2022 год [обновлять]нет никаких доказательств того, что XMRV заражает людей, или что XMRV связан с какими-либо заболеваниями человека или вызывает их. [9] [10] [11]
Классификация и геном
XMRV — вирус лейкемии мышей (MLV), который образовался в результате рекомбинации геномов двух родительских MLV, известных как preXMRV-1 и preXMRV-2. [12] MLV принадлежат к семейству вирусов Retroviridae и роду gammaretrovirus и имеют одноцепочечный РНК- геном , который реплицируется через промежуточное звено ДНК . Название XMRV было дано потому, что первооткрыватели вируса изначально считали, что это новый потенциальный патоген человека, связанный с MLV, но отличающийся от них. Частица XMRV имеет приблизительно сферическую форму и диаметр от 80 до 100 нм. [ необходима цитата ] На сегодняшний день опубликовано несколько геномных последовательностей XMRV. Эти последовательности почти идентичны, что является необычным открытием [13], поскольку ретровирусы реплицируют свои геномы с относительно низкой точностью, что приводит к расхождению вирусных последовательностей в одном организме-хозяине. [13] [14] В 2010 году результаты филогенетического анализа XMRV и родственных мышиных ретровирусов привели группу исследователей к выводу, что XMRV «может не быть настоящим человеческим патогеном». [15] [8] Ксенотропные вирусы (xenos Gr. чужеродный; tropos Gr. поворачивающийся) были первоначально обнаружены у новозеландских черных мышей (NZB), а затем были обнаружены у многих других линий мышей, включая диких мышей. [16] [17]
Открытие
XMRV был обнаружен в лабораториях Джозефа ДеРизи в Калифорнийском университете в Сан-Франциско , а также Роберта Сильвермана и Эрика Кляйна из Кливлендской клиники . Сильверман ранее клонировал и исследовал фермент рибонуклеазу L (РНКазу L), часть естественной защиты клетки от вирусов. При активации РНКаза L разрушает клеточную и вирусную РНК , чтобы остановить репликацию вируса. В 2002 году локус «наследственный рак простаты 1» (HPC1) был сопоставлен с геном РНКазы L, что указывает на его причастность к развитию рака простаты. [18] Связанная с раком мутация «R462Q» приводит к появлению глутамина вместо аргинина в позиции 462 фермента РНКазы L, что снижает его каталитическую активность. У человека с двумя копиями этой мутации риск рака простаты увеличивается вдвое; одна копия повышает риск на 50%. [19] Кляйн и Сильверман выдвинули гипотезу, что «предполагаемая связь изменений РНКазы L с HPC может отражать повышенную восприимчивость к вирусному агенту», и провели вирусный скрининг образцов рака предстательной железы, [19] что привело к открытию XMRV.
Исследования ассоциаций с заболеваниями
рак простаты
Об обнаружении XMRV сообщалось в нескольких статьях. [2] [20] Однако последующие исследования и опровержения поставили под сомнение эти результаты. [21] [22]
Другие условия
В одном исследовании XMRV был обнаружен у небольшого процента пациентов с ослабленной иммунной системой [23] , но другие исследования не обнаружили никаких доказательств присутствия XMRV в иммуносупрессии. [24] [25]
Споры и происхождение
Возникли опасения, поскольку многочисленные последующие исследования не смогли воспроизвести положительные результаты XMRV в крови пациентов с СХУ, раком предстательной железы и другими заболеваниями. [26] [8] [27] [28]
Помимо этих опасений, были высказаны опасения по поводу возможности передачи XMRV через переливание крови , поскольку вирус был выделен из лимфоцитов (белых кровяных клеток). [29] XMRV тесно связан с несколькими известными ксенотропными вирусами мышей, которые могут распознавать и проникать в клетки негрызунов (включая людей) с помощью ксенотропного и политропного ретровирусного рецептора 1 на клеточной поверхности (XPR1). [30] В результате AABB (ранее Американская ассоциация банков крови) создала целевую группу для определения распространенности XMRV в поставках донорской крови в Соединенных Штатах и пригодности различных методов обнаружения. [29]
В сентябре 2011 года Научно-исследовательская рабочая группа (SRWG), подразделение целевой группы AABB, опубликовала свои выводы о том, что текущие анализы не могут надежно идентифицировать XMRV в образцах человеческой крови, которые ранее были протестированы как XMRV/MLV-положительные; единственные две лаборатории, которые сообщили о положительных результатах XMRV в образцах, которые ранее были объявлены положительными (лаборатории WPI и NCI/Ruscetti), также сообщили о положительных результатах в образцах, которые были известны как XMRV-отрицательные. [31]
Многочисленные современные исследования пришли к выводу, что XMRV, скорее всего, является результатом случайной рекомбинации вирусов мышей во время исследований рака простаты в 1990-х годах. Положительные результаты вируса, вероятно, были вызваны загрязнением, а не истинным присутствием вируса у людей. [8] [3] [5] [4] Последующий анализ также показал, что праймеры, используемые для обнаружения и репликации следов XMRV в ПЦР- тестировании, на самом деле не являются ни селективными , ни специфичными для XMRV и фактически будут реагировать на различные не-XMRV последовательности, естественным образом встречающиеся в геномах млекопитающих. [32] Тем временем, многочисленным другим исследованиям также не удалось найти никакой связи между XMRV и СХУ или раком простаты. [33] [34] [35] В результате многие из ключевых публикаций, которые действительно заявляли о связи, были добровольно отозваны. [2] [36] [21] Это включало первоначальное исследование, которое связывало XMRV с СХУ, которое было отозвано по просьбе Сильвермана; Один из соавторов, Джуди Миковиц , также была обвинена в научной недобросовестности . [37] [38] [39]
Ссылки
- ^ "XMRV (Xenotropic Murine Leukemia Virus-related Virus) | CDC". Центры по контролю и профилактике заболеваний . Архивировано из оригинала 18 апреля 2018 года . Получено 17 апреля 2018 года .
- ^ abc Урисман, А.; Молинаро, Р.Дж.; Фишер, Н.; Пламмер, С.Дж.; Кейси, Дж.; Кляйн, Э.А.; Малати, К.; Маги-Галлуцци, К.; Таббс, Р.Р.; Ганем, Д. (2006). «Идентификация нового гаммаретровируса в опухолях простаты у пациентов, гомозиготных по варианту R462Q RNASEL». ПЛОС Патог . 2 (3): е25. дои : 10.1371/journal.ppat.0020025 . ПМЦ 1434790 . ПМИД 16609730. (Отозвано, см. doi :10.1371/annotation/7e2efc01-2e9b-4e9b-aef0-87ab0e4e4732, PMID 23028303, Retraction Watch)
- ^ abc "Происхождение XMRV расшифровано, подрывая утверждения о его роли в болезнях человека", Национальный институт рака (NCI) , 31 мая 2011 г., архивировано из оригинала 2015-11-17 , извлечено 16 ноября 2015 г.
- ^ abcd "Винай К. Патхак из NCI о "открытии" связи ретровирусов и заболеваний", Science Watch , Fast Breaking Papers, 2012 , получено 16 ноября 2015 г.
- ^ abcd Paprotka T, Delviks-Frankenberry KA, Cingöz O, Martinez A, Hsing-Jien K, Tepper CG, Wei-Shau H, Fivash Jr MJ, Coffin JM, Pathak VK (1 июля 2011 г.). "Рекомбинантное происхождение ретровируса XMRV". Science . 333 (6038): 97–101. Bibcode :2011Sci...333...97P. doi :10.1126/science.1205292. ISSN 0036-8075. PMC 3278917 . PMID 21628392. через вход в систему EBSCO
- ^ "Определение ксенотропного". Merriam-Webster . Получено 2020-05-06 .
- ^ "Определение мышиного". Merriam-Webster . Получено 2020-05-06 .
- ^ abcd Smith RA (декабрь 2010 г.). «Загрязнение клинических образцов нуклеиновыми кислотами, кодирующими MLV: последствия для XMRV и других потенциальных человеческих ретровирусов» (PDF) . Retrovirology . 7 (1): 112. doi : 10.1186/1742-4690-7-112 . PMC 3022688 . PMID 21171980.
- ^ Ариас М, Фань Х (январь 2014 г.). «Сага о XMRV: вирусе, который заражает клетки человека, но не является человеческим вирусом». Emerging Microbes & Infections . 3 (1): e. doi :10.1038/emi.2014.25. PMC 4008767. PMID 26038516 .
- ^ "XMRV (Xenotropic Murine Leukemia Virus-related Virus) Updates". Центры по контролю и профилактике заболеваний . 23 августа 2010 г. Архивировано из оригинала 27 июня 2018 г. Получено 5 марта 2023 г.
- ^ "Вирус, родственный ксенотропному вирусу лейкемии мышей (XMRV) и другие политропные вирусы лейкемии мышей (pMLV)" (PDF) . AABB . Октябрь 2012 г. Архивировано из оригинала (PDF) 6 июля 2022 г. Получено 5 марта 2023 г.
- ^ Cingöz, O; Paprotka, T; Delviks-Frankenberry, KA; Wildt, S; Hu, WS; Pathak, VK; Coffin, JM (2012). «Характеристика, картирование и распределение двух родительских провирусов XMRV». Журнал вирусологии . 86 (1): 328–38. doi :10.1128/JVI.06022-11. PMC 3255884. PMID 22031947 .
- ^ ab Lee K, Jones KS (февраль 2010 г.). «Пройденный путь: использование ретровирусов млекопитающих для руководства исследованиями XMRV». Molecular Interventions . 10 (1): 20–4. doi :10.1124/mi.10.1.5. PMC 2895355 . PMID 20124560.
- ^ Voisin V, Rassart E (май 2007 г.). «Полные геномные последовательности двух вирусных вариантов Graffi MuLV: филогенетическая связь с другими ретровирусами лейкемии мышей». Вирусология . 361 (2): 335–47. doi : 10.1016/j.virol.2006.10.045 . PMID 17208267.
- ^ Hué, S; Gray, ER; Gall, A; Katzourakis, A; Tan, CP; Houldcroft, CJ; McLaren, S; Pillay, D; et al. (2010). «Последовательности XMRV, связанные с заболеваниями, согласуются с лабораторным загрязнением». Retrovirology . 7 (1): 111. doi : 10.1186/1742-4690-7-111 . PMC 3018392 . PMID 21171979.
- ^ Levy JA (14 декабря 1973 г.). «Ксенотропные вирусы: вирусы лейкемии мышей, связанные с штаммами NIH Swiss, NZB и другими мышами». Science . 182 (4117): 1151–1153. Bibcode :1973Sci...182.1151L. doi :10.1126/science.182.4117.1151. PMID 4356281. S2CID 22929896.
- ^ Levy JA (1978). «Ксенотропные вирусы типа C». Современные аспекты электрохимии . Т. 79. С. 111–213. doi :10.1007/978-3-642-66853-1_4. ISBN 978-1-4612-9003-2. PMID 77206.
- ^ Carpten J, Nupponen N, Isaacs S и др. (февраль 2002 г.). «Мутации зародышевой линии в гене рибонуклеазы L в семьях, демонстрирующих связь с HPC1». Nature Genetics . 30 (2): 181–4. doi :10.1038/ng823. PMID 11799394. S2CID 2922306.
- ^ ab Silverman RH (2007). «Научное путешествие по системе 2-5A/RNase L». Обзоры цитокинов и факторов роста . 18 (5–6): 381–8. doi :10.1016/j.cytogfr.2007.06.012. PMC 2075094. PMID 17681844 .
- ^ Арнольд, RS; Макарова, NV; Осункойя, AO; Суппиа, S; Скотт, TA; Джонсон, NA; Бхосле, SM; Лиотта, D; и др. (2010). «Инфекция XMRV у пациентов с раком простаты: новый серологический анализ и корреляция с ПЦР и FISH». Урология . 75 (4): 755–61. doi :10.1016/j.urology.2010.01.038. PMID 20371060.
- ^ ab Schlaberg, R; Choe, DJ; Brown, KR; Thaker, HM; Singh, IR (22 сентября 2009 г.). «XMRV присутствует в злокачественном эпителии простаты и связан с раком простаты, особенно с опухолями высокой степени злокачественности». PNAS . 106 (38): 16351–16356. Bibcode :2009PNAS..10616351S. doi : 10.1073/pnas.0906922106 . PMC 2739868 . PMID 19805305. (Отозвано, см. doi :10.1073/pnas.1409186111, PMID 25114258, Retraction Watch)
- ^ Lee D, Das Gupta J, Gaughan C, Steffen I, Tang N, Luk KC, Qiu X, Urisman A, Fischer N, Molinaro R, Broz M, Schochetman G, Klein EA, Ganem D, DeRisi JL, Simmons G, Hackett J, Silverman RH, Chiu CY (18 сентября 2012 г.). «Углубленное исследование архивных и проспективно собранных образцов не выявило никаких доказательств заражения XMRV при раке простаты». PLoS ONE . 7 (9): e44954. Bibcode : 2012PLoSO...744954L. doi : 10.1371/journal.pone.0044954 . PMC 3445615. PMID 23028701 .
- ^ Fischer N, Schulz C, Stieler K, Hohn O, Lange C, Drosten C, Aepfelbacher M (июнь 2010 г.). «Ксенотропный мышиный лейкоз-связанный гаммаретровирус в дыхательных путях». Emerg Infect Dis . 16 (6): 1000–2. doi :10.3201/eid1606.100066. PMC 3086240. PMID 20507757 . PDF: https://www.cdc.gov/eid/content/16/6/pdfs/1000.pdf Архивировано 13 июня 2010 г. на Wayback Machine
- ^ Henrich, TJ; Li, JZ; Felsenstein, D; Kotton, CN; Plenge, RM; Pereyra, F; Marty, FM; Lin, NH; et al. (2010). «Распространенность вируса, связанного с ксенотропным мышиным лейкозом, у пациентов с синдромом хронической усталости или хроническими иммуномодулирующими состояниями». Журнал инфекционных заболеваний . 202 (10): 1478–81. doi :10.1086/657168. PMC 2957553. PMID 20936980 .
- ^ Barnes, E ; Flanagan, P; Brown, A; Robinson, N; Brown, H; McClure, M; Oxenius, A ; Collier, J; et al. (2010). «Неспособность обнаружить ксенотропный вирус мышиного лейкоза, связанный с вирусом, в крови лиц с высоким риском вирусных инфекций, передающихся через кровь». Журнал инфекционных заболеваний . 202 (10): 1482–5. doi : 10.1086/657167 . hdl : 20.500.11850/24494 . PMID 20936982.
- ^ van der Kuyl AC, Cornelissen M, Berkhout B (2011). «О мышах и людях: о происхождении XMRV». Frontiers in Microbiology . 1 : 147. doi : 10.3389/fmicb.2010.00147 . PMC 3109487. PMID 21687768 .
- ^ "Опубликованные исследования результатов XMRV и pMLV при заболеваниях человека и населения в целом" (PDF) . AABB . Сентябрь 2012 г. Архивировано из оригинала (PDF) 27 мая 2022 г. Получено 5 марта 2023 г.
- ^ Dodd, RY (декабрь 2011 г.). «XMRV и безопасность крови: пример науки и общественного давления: XMRV и безопасность крови». ISBT Science Series . 6 (2): 446–448. doi : 10.1111/j.1751-2824.2011.01538.x .
- ^ ab Klein HG, Dodd RY, Hollinger FB, Katz LM, Kleinman S, McCleary KK, Silverman RH, Stramer SL, Межорганизационная целевая группа AABB по XMRV (2011). "Вирус, связанный с ксенотропным мышиным лейкозом (XMRV) и переливание крови: отчет межорганизационной целевой группы AABB по XMRV". Transfusion . 51 (3): 654–61. doi : 10.1111/j.1537-2995.2010.03012.x . PMID 21235597. S2CID 31115745.
- ^ Козак, CA (2010). «Мышиные «ксенотропные» гаммаретровирусы и их рецептор XPR1». Ретровирусология . 7 : 101. doi : 10.1186/1742-4690-7-101 . PMC 3009702. PMID 21118532 .
- ^ Simmons G, Glynn SA, Komaroff AL, Mikovits JA, Tobler LH, Hackett J, Tang N, Switzer WM, Heneine W, Hewlett IK, Zhao J, Lo SC, Alter HJ, Linnen JM, Gao K, Coffin JM, Kearney MF, Ruscetti FW, Pfost MA, Bethel J, Kleinman S, Holmberg JA, Busch MP (11 ноября 2011 г.). «Невозможность подтвердить наличие XMRV/MLV в крови пациентов с синдромом хронической усталости: многолабораторное исследование». Science . 334 (6057): 814–817. Bibcode :2011Sci...334..814S. doi :10.1126/science.1213841. PMC 3299483. PMID 21940862 .
- ^ Panelli S, Lorusso L, Balestrieri A, Lupo G, Capelli E (22 мая 2017 г.). «XMRV и общественное здравоохранение: ретровирусный геном не является подходящим шаблоном для диагностической ПЦР, а его связь с миалгическим энцефаломиелитом/синдромом хронической усталости представляется ненадежной». Frontiers in Public Health . 5 : 108. doi : 10.3389/fpubh.2017.00108 . PMC 5439170 . PMID 28589117.
- ^ Robinson MJ, Erlwein O, McClure MO (ноябрь 2011 г.). «Ксенотропный вирус, связанный с вирусом лейкемии мышей (XMRV), не вызывает хронической усталости». Trends in Microbiology . 19 (11): 525–529. doi :10.1016/j.tim.2011.08.005. PMID 21978843.
- ^ Альтер Х.Дж., Миковиц Дж.А., Свитцер В.М., Рускетти Ф.В., Ло СК, Климас Н., Комарофф А.Л., Монтойя Дж.Г., Бэйтман Л., Левин С., Петерсон Д., Левин Б., Хансон М.Р., Генфи А., Бхат М., Чжэн Х., Ван Р., Ли Б, Хунг Г.К., Ли ЛЛ, Самерофф С., Хенейн В., Коффин Дж., Хорниг М., Липкин В.И. (ноябрь 2012 г.). «Многоцентровый слепой анализ не указывает на отсутствие связи между синдромом хронической усталости/миалгическим энцефаломиелитом и вирусом ксенотропного мышиного лейкоза или вирусом политропного мышиного лейкоза». мБио . 3 (5): e00266–12. doi : 10.1128/mBio.00266-12. PMC 3448165. PMID 22991430 .
- ^ Sfanos KS, Aloia AL, De Marzo AM, Rein A (февраль 2012 г.). «XMRV и рак простаты — „окончательная“ перспектива». Nature Reviews Urology . 9 (2): 111–118. doi :10.1038/nrurol.2011.225. PMC 4029112. PMID 22231291 .
- ^ Lo, SC; Pripuzova, N; Li, B; Komaroff, AL; Hung, GC; Wang, R; Alter, HJ (7 сентября 2010 г.). «Обнаружение последовательностей генов вируса, связанных с MLV, в крови пациентов с синдромом хронической усталости и здоровых доноров крови». PNAS . 107 (36): 15874–9. Bibcode :2010PNAS..10715874L. doi : 10.1073/pnas.1006901107 . PMC 2936598 . PMID 20798047. (Отозвано, см. doi :10.1073/pnas.1119641109, PMID 22203980, Retraction Watch)
- ^ Lombardi VC, Ruscetti FW, Das Gupta J, Pfost MA, Hagen KS, Peterson DL, Ruscetti SK, Bagni RK, Petrow-Sadowski C, Gold B, Dean M, Silverman RH, Mikovits JA (23 октября 2009 г.). «Обнаружение инфекционного ретровируса XMRV в клетках крови пациентов с синдромом хронической усталости». Science . 326 (5952): 585–589. Bibcode :2009Sci...326..585L. doi : 10.1126/science.1179052 . PMID 19815723.(Отозвано, см. doi :10.1126/science.334.6063.1636-a, PMID 22194552, Retraction Watch)
- ^ Коэн, Джон (22 декабря 2011 г.). «ОБНОВЛЕНО: в редком случае наука без согласия авторов отзывает статью, которая связывала вирус мышей с синдромом хронической усталости». Science . Архивировано из оригинала 16 ноября 2022 г. . Получено 5 марта 2023 г. .
- ^ Tsouderos, Trine (3 октября 2011 г.). «Манипуляция, предположительно связанная с вирусом, синдромом хронической усталости». Chicago Tribune . Архивировано из оригинала 28 октября 2022 г.
Внешние ссылки
- Информационный листок XMRV, AABB.org (ранее Американская ассоциация банков крови) (архив), обновлено 18 июня 2010 г.
- Центр по контролю и профилактике заболеваний: архивная информация XMRV