В молекулярной биологии линкерная ДНК — это двухцепочечная ДНК (длиной 38–53 пар оснований ) между двумя ядрами нуклеосом , которая в сочетании с гистоном H1 удерживает ядра вместе. Линкерная ДНК рассматривается как струна в «модели бусин и струн», которая создается с использованием ионного раствора на хроматине . Линкерная ДНК соединяется с гистоном H1, а гистон H1 располагается на ядре нуклеосомы. Нуклеосома технически представляет собой объединение ядра нуклеосомы и одной смежной линкерной ДНК; однако термин «нуклеосома» свободно используется только для обозначения ядра. Линкерная ДНК может разрушаться эндонуклеазами . [ 1]
Линкеры представляют собой короткие двухцепочечные сегменты ДНК, которые образованы из олигонуклеотидов . Они содержат целевые сайты для действия одного или нескольких рестриктаз . Линкеры могут быть синтезированы химически и могут быть лигированы с тупым концом чужеродной ДНК или векторной ДНК . Затем они обрабатываются ферментом рестриктазой для получения липких концов фрагментов ДНК. Обычно используемыми линкерами являются EcoRI-линкеры и sal-I-линкеры.