Myoviridae — семейство бактериофагов отряда Caudovirales . Естественными хозяевами служат бактерии и археи . В этом семействе насчитывается 625 видов, отнесенных к восьми подсемействам и 217 родам. [1] [2]
Подсемейство Tevenvirinae (синоним: Tequatrovirinae ) названо в честь типового вида Enterobacteria, фага T4 . Члены этого подсемейства морфологически неотличимы и имеют умеренно удлиненные головки длиной около 110 нанометров (нм), длинные хвосты с воротником длиной 114 нм, базовые пластинки с короткими шипами и шесть длинных извитых хвостовых волокон. Роды в этом подсемействе делятся на основе морфологии головки: род Tequatrovirus (Предварительное название: T4virus ) имеет длину головки 137 нм, а род Schizot4virus - 111 нм. Внутри родов на основании гомологии белков виды разделены на ряд групп.
Подсемейство Peduovirinae имеет вирионы с головками диаметром 60 нм и хвостами 135 × 18 нм. Эти фаги легко идентифицировать, поскольку сморщенные оболочки имеют тенденцию соскальзывать с ядра хвоста. Фаг Р" является типовым видом.
Все подсемейство Spounavirinae представляют собой вирулентные фаги с широким диапазоном хозяев, которые заражают представителей Bacillota . Они обладают изометрическими головками диаметром 87–94 нм и заметными капсомерами , полосатыми длинными хвостами длиной 140–219 нм и двойной базовой пластиной. На кончике хвоста расположены шаровидные структуры, которые теперь известны как шипы базовой пластины и короткие изогнутые волокна хвоста с шестикратной симметрией. Представители этой группы обычно обладают большими (127–142 т.п.н.) неперестановочными геномами с концевыми избыточностями 3,1–20 т.п.н. Название этого подсемейства происходит от SPO plus una (один латинский).
Галовирусы HF1 и HF2 принадлежат к одному и тому же роду, но, поскольку они инфицируют архей, а не бактерии, их, скорее всего, будут выделены в отдельный род после того, как будет установлена их классификация. [3]
Группа карликов была предложена на морфологических и геномных основаниях. В эту группу входят фаги Aeromonas Salmonicida фаг 56, фаги Vibrio cholerae 138 и CP-T1, фаг Bdellovibrio φ1422 и фаг Pectobacterium carotovorum ZF40. [4] Их общие характеристики включают идентичную морфологию вирионов, обычно характеризующиеся короткими сократительными хвостами, и все они имеют размеры генома примерно 45 килобаз. Порядок генов в структурной единице генома следующий: терминаза — портал — головка — хвост — базовая пластинка — хвостовые волокна.
Вирусы Myoviridae не имеют оболочки, имеют форму «голова-хвост» (с шеей). Геномы представляют собой линейную двухцепочечную ДНК длиной около 33–244 КБ. Геном кодирует от 40 до 415 белков. [1] Он имеет окончательно избыточные последовательности. Содержание GC составляет ~35%. Геном кодирует 200–300 белков, которые транскрибируются в опероны. В геноме может присутствовать 5-гидроксиметилцитозин (вместо тимидина ).
Трубчатый хвост имеет спиральную симметрию и имеет диаметр 16-20 нм. Он состоит из центральной трубки, сократительной оболочки, воротника, опорной пластинки, шести хвостовых штифтов и шести длинных волокон. Он похож на Tectiviridae , но отличается тем, что хвост у миовируса постоянный.
Сокращения хвоста требуют АТФ . При сокращении оболочки субъединицы оболочки скользят друг по другу, и хвост укорачивается до 10–15 нм в длину.
Прикрепляясь к клетке-хозяину, вирус использует свою сократительную оболочку как шприц, прокалывая клеточную стенку центральной трубкой и вводя генетический материал в хозяина. Введенная ДНК берет на себя механизмы транскрипции и трансляции клетки-хозяина и начинает производить новые вирусы. Репликация следует модели репликативной транспозиции. Транскрипция с использованием шаблона ДНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит посредством сдвига рамки рибосомы -1 . Вирус покидает клетку-хозяина путем лизиса белков холина / эндолизина / спанина . Естественным хозяином служат бактерии и археи . Путь передачи – пассивная диффузия . [1]
Хотя миовирусы в целом литические и лишены генов, необходимых для лизогенности , известен ряд видов, обитающих в умеренном поясе .
Поскольку большинство Myoviridae являются литическими, а не умеренными фагами, некоторые исследователи исследовали их использование в качестве терапии бактериальных заболеваний у людей и других животных. [6]
Признаны следующие восемь подсемейств: [2]
Кроме того, следующие роды не отнесены к подсемейству: [2]
