stringtranslate.com

Набор данных по цветку ириса

Диаграмма рассеяния набора данных

Набор данных по цветкам ириса или набор данных по ирису Фишера — это многомерный набор данных , который использовал и прославил британский статистик и биолог Рональд Фишер в своей статье 1936 года « Использование множественных измерений в таксономических задачах» в качестве примера линейного дискриминантного анализа . [1] Иногда его называют набором данных по ирису Андерсона , поскольку Эдгар Андерсон собрал данные для количественной оценки морфологических вариаций цветков ириса трех родственных видов. [2] Два из трех видов были собраны на полуострове Гаспе «все с одного пастбища, собраны в один день и измерены в одно и то же время одним и тем же человеком с помощью одного и того же прибора». [3]

Набор данных состоит из 50 образцов каждого из трех видов ириса ( Iris setosa , Iris virginica и Iris versicolor ). Четыре характеристики были измерены для каждого образца: длина и ширина чашелистиков и лепестков в сантиметрах. На основе комбинации этих четырех характеристик Фишер разработал линейную дискриминантную модель для различения каждого вида. Статья Фишера была опубликована в Annals of Eugenics (сегодня Annals of Human Genetics ). [1]

Использование набора данных

Неудовлетворительная кластеризация k-средних (данные не могут быть сгруппированы в известные классы) и фактические виды, визуализированные с помощью ELKI
Пример так называемой «карты метро» для набора данных Iris [4] Только небольшая часть Iris-virginica смешана с Iris-versicolor . Все остальные образцы различных видов Iris принадлежат к разным узлам.

Первоначально он использовался в качестве примера набора данных, к которому был применен линейный дискриминантный анализ Фишера , но впоследствии стал типичным тестовым случаем для многих статистических методов классификации в машинном обучении, таких как машины опорных векторов . [5]

Однако использование этого набора данных в кластерном анализе не является обычным, поскольку набор данных содержит только два кластера с довольно очевидным разделением. Один из кластеров содержит Iris setosa , в то время как другой кластер содержит как Iris virginica , так и Iris versicolor и не может быть разделен без информации о виде, которую использовал Фишер. Это делает набор данных хорошим примером для объяснения разницы между контролируемыми и неконтролируемыми методами в добыче данных : линейная дискриминантная модель Фишера может быть получена только тогда, когда известны виды объектов: метки классов и кластеры не обязательно совпадают. [6]

Тем не менее, все три вида Iris разделимы в проекции на нелинейный и ветвящийся главный компонент. [7] Набор данных аппроксимируется ближайшим деревом с некоторым штрафом за чрезмерное количество узлов, изгибы и растяжения. Затем строится так называемая «карта метро». [4] Точки данных проецируются в ближайший узел. Для каждого узла подготавливается круговая диаграмма проецируемых точек. Площадь круговой диаграммы пропорциональна количеству проецируемых точек. Из диаграммы (слева) ясно, что абсолютное большинство образцов различных видов Iris принадлежат к разным узлам. Только небольшая часть Iris-virginica смешана с Iris-versicolor (смешанные сине-зеленые узлы на диаграмме). Таким образом, три вида Iris ( Iris setosa , Iris virginica и Iris versicolor ) разделимы неконтролируемыми процедурами нелинейного анализа главных компонент . Чтобы различить их, достаточно просто выбрать соответствующие узлы на главном дереве.

Набор данных

Ирис щетинистый

Набор данных содержит 150 записей по пяти атрибутам: длина чашелистика, ширина чашелистика, длина лепестка, ширина лепестка и вид.

Ирис разноцветный
Ирис виргинский
Спектральная карта двух участков набора данных радужной оболочки глаза Фишера

Набор данных iris широко используется в качестве набора данных для начинающих в целях машинного обучения. Набор данных включен в R base и Python в библиотеку машинного обучения scikit-learn , так что пользователи могут получить к нему доступ без необходимости искать его источник.

Было опубликовано несколько версий набора данных. [8]

Ркод, иллюстрирующий использование

Приведенный ниже пример кода R воспроизводит диаграмму рассеяния, представленную в верхней части этой статьи:

# Показать набор данных iris # Показать страницу справки с информацией о наборе данных ? iris# Создать диаграммы рассеяния всех парных комбинаций 4 переменных в наборе данных pairs ( iris [ 1 : 4 ], main = "Iris Data (red=setosa,green=versicolor,blue=virginica)" , pch = 21 , bg = c ( "red" , "green3" , "blue" )[ unclass ( iris $ Species )])   

Питонкод, иллюстрирующий использование

из  sklearn.datasets  импортировать  load_irisирис  =  load_iris () ирис

Этот код дает:

{ 'data' :  array ([[ 5.1 ,  3.5 ,  1.4 ,  0.2 ],  [ 4.9 ,  3. ,  1.4 ,  0.2 ],  [ 4.7 ,  3.2 ,  1.3 ,  0.2 ],  [ 4.6 ,  3.1 ,  1.5 ,  0.2 ], ... 'target' :  array ([ 0 ,  0 ,  0 ,  ...  1 ,  1 ,  1 ,  ...  2 ,  2 ,  2 ,  ... 'target_names' :  array ([ 'setosa' ,  'versicolor' ,  'virginica' ],  dtype = '<U10' ), ... }

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ ab RA Fisher (1936). «Использование множественных измерений в таксономических проблемах». Annals of Eugenics . 7 (2): 179–188. doi :10.1111/j.1469-1809.1936.tb02137.x. hdl : 2440/15227 .
  2. ^ Эдгар Андерсон (1936). «Проблема видов в Iris». Annals of the Missouri Botanical Garden . 23 (3): 457–509. doi :10.2307/2394164. JSTOR  2394164.
  3. Эдгар Андерсон (1935). «Ирисы полуострова Гаспе». Бюллетень Американского общества ирисоводов . 59 : 2–5.
  4. ^ ab Горбань, АН ; Зиновьев, А. (2010). «Главные многообразия и графы на практике: от молекулярной биологии до динамических систем». International Journal of Neural Systems . 20 (3): 219–232. arXiv : 1001.1122 .
  5. ^ "Репозиторий машинного обучения UCI: набор данных Iris". archive.ics.uci.edu . Получено 01.12.2017 .
  6. ^ Инес Фэрбер; Стефан Гюннеманн; Ханс-Петер Кригель ; Пир Крёгер; Эммануэль Мюллер; Эрих Шуберт; Томас Зайдль; Артур Зимек (2010). «Об использовании меток классов при оценке кластеризации» (PDF) . В Xiaoli Z. Fern; Ян Дэвидсон; Дженнифер Дай (ред.). MultiClust: обнаружение, суммирование и использование множественной кластеризации . ACM SIGKDD .
  7. ^ Горбань, AN; Самнер, NR; Зиновьев, AY (2007). «Топологические грамматики для аппроксимации данных». Applied Mathematics Letters . 20 (4): 382–386.
  8. ^ Bezdek, JC; Keller, JM; Krishnapuram, R.; Kuncheva, LI ; Pal, NR (1999). «Пожалуйста, поднимите реальные данные по радужной оболочке глаза?». IEEE Transactions on Fuzzy Systems . 7 (3): 368–369. doi :10.1109/91.771092.

Внешние ссылки