В биологии таксономический ранг (который некоторые авторы предпочитают называть номенклатурным рангом [1], поскольку ранжирование является частью номенклатуры, а не собственно таксономии, согласно некоторым определениям этих терминов) — это относительный или абсолютный уровень группы организмов ( таксона ) в иерархии , которая отражает эволюционные отношения. Таким образом, наиболее инклюзивные клады (такие как Eukarya и Opisthokonta ) имеют самые высокие ранги, тогда как наименее инклюзивные (такие как Homo sapiens или Bufo bufo ) имеют самые низкие ранги. Ранги могут быть как относительными и обозначаться таксономией с отступом, в которой уровень отступа отражает ранг, так и абсолютными, в которых различные термины, такие как вид , род , семейство , отряд , класс , тип , царство и домен обозначают ранг. На этой странице особое внимание уделяется абсолютным рангам, и коды на основе рангов ( Зоологический код , Ботанический код , Код культурных растений , Прокариотический код и Код вирусов) требуют их. Однако абсолютные ранги не требуются во всех номенклатурных системах для таксономистов; например, PhyloCode [ 2] код филогенетической номенклатуры не требует абсолютных рангов.
Таксоны представляют собой иерархические группы организмов, и их ранги описывают их положение в этой иерархии. Высокоранговые таксоны (например, те, которые считаются доменами или царствами) включают больше подтаксонов, чем низкоранговые таксоны (например, те, которые считаются родами, видами или подвидами). Ранг этих таксонов отражает наследование признаков или молекулярных особенностей от общих предков. Название любого вида и рода являются базовыми ; это означает, что для идентификации конкретного организма обычно не нужно указывать названия в рангах, отличных от этих первых двух, в пределах набора таксонов, охватываемых данным ранговым кодом. [3] Однако это неверно в глобальном масштабе, поскольку большинство ранговых кодов независимы друг от друга, поэтому существует много межкодовых омонимов (одно и то же название, используемое для разных организмов, часто для животного и для таксона, охватываемого ботаническим кодом). По этой причине были предприняты попытки создать Биокод , который бы регулировал все названия таксонов, [4] но эта попытка пока не увенчалась успехом [5] из-за прочно укоренившихся традиций в каждом сообществе. [6]
Рассмотрим конкретный вид, рыжую лисицу , Vulpes vulpes : в контексте Зоологического кодекса видовой эпитет vulpes (маленькая v ) идентифицирует конкретный вид в роде Vulpes (большая V ), который включает всех «истинных» лисиц. Все их близкие родственники принадлежат к семейству Canidae , которое включает собак, волков, шакалов и всех лисиц; следующий более высокий основной таксон, Carnivora (считающийся отрядом), включает псовых (медведей, тюленей, ласок, скунсов, енотов и всех упомянутых выше) и кошачьих (кошки, циветты, гиены, мангусты). Хищные — это одна из групп мохнатых, теплокровных, кормящих грудью членов класса Mammalia , которые классифицируются среди животных с хордой в типе Chordata , и вместе с ними среди всех животных в царстве Animalia . Наконец, на самом высоком уровне все они объединены со всеми другими организмами, обладающими клеточными ядрами, в домене Эукариоты .
Международный кодекс зоологической номенклатуры определяет ранг как: «Уровень таксона в таксономической иерархии для номенклатурных целей (например, все семейства для номенклатурных целей находятся в одном и том же ранге, который находится между надсемейством и подсемейством)». [7] Обратите внимание, что обсуждения на этой странице обычно предполагают, что таксоны являются кладами ( монофилетическими группами организмов), но этого не требуют ни Международный кодекс зоологической номенклатуры , ни Ботанический кодекс , и некоторые эксперты по биологической номенклатуре не считают, что это должно быть обязательным, [8] и в этом случае иерархия таксонов (следовательно, их ранги) не обязательно отражает иерархию клад .
История
В то время как старые подходы к таксономической классификации были феноменологическими, формируя группы на основе сходства внешнего вида, органической структуры и поведения, два важных новых метода, разработанных во второй половине 20-го века, радикально изменили таксономическую практику. Одним из них является появление кладистики , которая возникла из работ немецкого энтомолога Вилли Хеннига . [9] Кладистика - это метод классификации форм жизни в соответствии с долей общих характеристик (называемых синапоморфиями ). Предполагается, что чем выше доля общих характеристик двух организмов, тем позже они оба произошли от общего предка. Вторым методом является молекулярная систематика, основанная на генетическом анализе , который может предоставить много дополнительных данных, которые оказываются особенно полезными, когда несколько фенотипических признаков могут разрешить отношения, как, например, у многих вирусов , бактерий [10] и архей , или разрешить отношения между таксонами, которые возникли в результате быстрой эволюционной радиации, произошедшей давно, например, основные таксоны плацентарных млекопитающих . [11]
Главные ряды
В своих знаковых работах, таких как Systema Naturae , Карл Линней использовал шкалу ранжирования, ограниченную царством, классом, отрядом, родом, видом и одним рангом ниже вида. Сегодня номенклатура регулируется номенклатурными кодексами . Существует семь основных таксономических рангов: царство, тип или отдел, класс, отряд, семейство, род и вид. Кроме того, домен (предложенный Карлом Вёзе ) теперь широко используется в качестве фундаментального ранга, хотя он не упоминается ни в одном из номенклатурных кодексов и является синонимом доминиона ( лат . dominium ), введенного Муром в 1974 году. [12] [13]
Таксону обычно присваивается ранг, когда ему дается его официальное название. Основные ранги — вид и род. Когда организму дается название вида, он присваивается роду, а название рода является частью названия вида.
Видовое название также называется биномиальным , то есть двучленным названием. Например, зоологическое название человеческого вида — Homo sapiens . Обычно оно выделяется курсивом в печати или подчеркивается, когда курсив недоступен. В этом случае Homo — это родовое название, и оно пишется с заглавной буквы; sapiens указывает на вид, и оно не пишется с заглавной буквы. Хотя это не всегда используется, некоторые виды включают подвидовой эпитет. Например, современные люди — Homo sapiens sapiens или H. sapiens sapiens .
В зоологической номенклатуре названия высших таксонов обычно не выделяются курсивом, однако Ботанический кодекс , Прокариотический кодекс , Кодекс вирусов, проект Биокода [4] и Филокод [2] рекомендуют выделять курсивом все названия таксонов (всех рангов).
Звания по зоологии
В Международном кодексе зоологической номенклатуры действуют правила, применяемые к следующим таксономическим рангам : надсемейство, семейство, подсемейство, триба, подтриба, род, подрод, вид, подвид. [14]
Международный кодекс зоологической номенклатуры делит названия на «названия групп семейств», «названия групп родов» и «названия групп видов». В Кодексе четко указаны следующие ранги для этих категорий: [14] : §29–31
Правила Кодекса применяются к рангам от надсемейства до подвида, и только в некоторой степени к тем, кто выше ранга надсемейства. Среди «названий родовой группы» и «названий видовой группы» официально не допускаются дальнейшие ранги, что создает проблемы при наименовании таксонов в этих группах в кладах видов, таких как Rana . [15] Зоологи иногда используют дополнительные термины, такие как группа видов , подгруппа видов , комплекс видов и надвиды для удобства в качестве дополнительных, но неофициальных, рангов между уровнями подрода и вида в таксонах со многими видами, например, род Drosophila . (Обратите внимание на потенциально запутанное использование термина «видовая группа» как категории рангов, так и самого неофициального ранга. По этой причине Ален Дюбуа использует альтернативные выражения «номинальная серия», «семейная серия», «родовая серия» и «видовая серия» (среди прочих) по крайней мере с 2000 года. [16] [15] )
На более высоких рангах (семейство и выше) более низкий уровень может быть обозначен добавлением префикса « инфра », означающего «ниже », к рангу. Например, инфраотряд (ниже подотряда) или инфрасемейство (ниже подсемейства).
Названия зоологических таксонов
Таксон рангом выше вида имеет научное название, состоящее из одной части (одноименное название).
Вид имеет название, как правило, состоящее из двух частей (биномиальное название или биномен ): родовое название + видовое название ; например, Canis lupus . Иногда название подрода (в скобках) может быть вставлено между названием рода и видовым эпитетом, что дает трехчленное название, которое не следует путать с названием подвида. Примером является Lithobates (Aquarana) catesbeianus , которое обозначает вид, принадлежащий к роду Lithobates и подроду Aquarana . [15]
Подвид имеет название, состоящее из трех частей (триномен или триномен ): родовое название + видовое название + подвидовое название ; например, Canis lupus italicus . Поскольку ниже вида может быть только один возможный ранг, соединительный термин для указания ранга не нужен и не используется.
Звания в ботанике
Ботанические ранги классифицируют организмы на основе (часто) их взаимоотношений ( монофилия не требуется для этой клады, в которой даже не упоминается это слово, как и слово « клада »). Они начинаются с Царства, затем переходят к Разделу (или Типу), [17] Классу, Порядку, Семейству, Роду и Виду. Таксоны в каждом ранге обычно обладают общими характеристиками и эволюционной историей. Понимание этих рангов помогает в таксономии и изучении биоразнообразия.
Правила МКБ применяются в первую очередь к рангам семейства и ниже и только в некоторой степени к рангам выше семейства. (См. также описательное ботаническое название .)
Названия ботанических таксонов
Таксоны в ранге рода и выше имеют ботаническое название из одной части (унитарное название); таксоны в ранге вида и выше (но ниже рода) имеют ботаническое название из двух частей ( бинарное название ); все таксоны ниже ранга вида имеют ботаническое название из трех частей ( внутривидовое название ). Для указания ранга внутривидового названия необходим «соединительный термин». Так, Poa secunda subsp. juncifolia , где «subsp.» — сокращение от «subspecies», является названием подвида Poa secunda . [19]
Гибриды могут быть определены либо «гибридной формулой», которая определяет происхождение, либо им может быть дано имя. Для гибридов, получающих гибридное имя , применяются те же ранги, с префиксом notho (греч.: «ублюдок»), с nothogenus в качестве наивысшего разрешенного ранга. [20]
Устаревшие названия ботанических рангов
Если в старой публикации использовался другой термин для обозначения ранга, но намерение ясно, ботаническая номенклатура указывает определенные замены: [ необходима ссылка ]
Если названия «предназначались как названия отрядов, но были опубликованы с обозначением их ранга таким термином, как» «cohors» [лат. «когорта»; [21] см. также когортное исследование для использования термина в экологии], «nixus», «alliance» или «Reihe» вместо «отряда» (статья 17.2), то они рассматриваются как названия отрядов.
«Семья» заменяется на «порядок» (ordo) или «естественный порядок» (ordo naturalis) при определенных условиях, когда современное значение слова «порядок» не подразумевалось. (Статья 18.2)
«Подсемейство» заменяется на «подотряд» (subordo) при определенных условиях, когда современное значение «подотряда» не подразумевалось. (Статья 19.2)
Если в публикации до 1 января 1890 года используется только один внутривидовой ранг, он считается рангом разновидности. (Статья 37.4) Это обычно относится к публикациям, в которых внутривидовые таксоны обозначены греческими буквами α, β, γ, ...
Примеры
Далее следуют классификации пяти видов: плодовая мушка , известная в генетических лабораториях ( Drosophila melanogaster ), человек ( Homo sapiens ), горох , который Грегор Мендель использовал в своем открытии генетики ( Pisum sativum ), гриб-мухомор Amanita muscaria и бактерия Escherichia coli . Восемь основных рангов выделены жирным шрифтом; также приведен выбор второстепенных рангов.
Заметки к таблице
Чтобы сохранить компактность таблицы и избежать спорных технических деталей, некоторые общие и необычные промежуточные ранги опущены. Например, млекопитающие Европы, Африки и верхней части Северной Америки [a] находятся в классе Mammalia , легионе Cladotheria , подлегионе Zatheria , инфралегионе Tribosphenida , подклассе Theria , кладе Eutheria , кладе Placentalia – но в таблице присутствуют только Mammalia и Theria. Законные аргументы могут возникнуть, если бы были включены оба обычно используемых клада Eutheria и Placentalia, над которым стоит ранг «инфракласса» и каким должен быть ранг другого, или являются ли эти два названия синонимами.
Ранги более высоких таксонов, особенно промежуточных, склонны к пересмотру по мере обнаружения новой информации о взаимоотношениях. Например, цветковые растения были понижены с отдела (Magnoliophyta) до подкласса (Magnoliidae), а надотряд стал рангом, который отличает основные группы цветковых растений. [23] Традиционная классификация приматов (класс Mammalia, подкласс Theria, инфракласс Eutheria, отряд Primates) была изменена новыми классификациями, такими как Маккенна и Белл (класс Mammalia, подкласс Theriformes, инфракласс Holotheria), при этом Theria и Eutheria были назначены более низкие ранги между инфраклассом и отрядом Primates. ( Подробнее см. в классификации млекопитающих .) Эти различия возникают из-за того, что в ископаемой летописи мало доступных рангов и много точек ветвления.
Внутри вида могут быть распознаны дополнительные единицы. Животные могут быть классифицированы на подвиды (например, Homo sapiens sapiens , современные люди) или морфы (например, Corvus corax varius morpha leucophaeus , пегий ворон). Растения могут быть классифицированы на подвиды (например, Pisum sativum subsp. sativum , садовый горошек) или разновидности (например, Pisum sativum var. macrocarpon , снежный горошек), при этом культурные растения получают название сорта (например, Pisum sativum var. macrocarpon 'Snowbird'). Бактерии могут быть классифицированы по штаммам (например, Escherichia coli O157:H7 , штамм, который может вызвать пищевое отравление ).
Окончания имен
Таксоны выше уровня рода часто получают названия, основанные на типовом роде , со стандартным окончанием. Окончания, используемые при формировании этих названий, зависят от царства (а иногда и от типа и класса), как указано в таблице ниже.
Приведенные произношения являются наиболее англицированными . Также распространены более латинские произношения, в частности / ɑː / вместо / eɪ / для ударного a .
Заметки к таблице
В ботанике и микологии названия в ранге семейства и ниже основаны на названии рода, иногда называемого типовым родом этого таксона, со стандартным окончанием. Например, семейство розовых, Rosaceae , названо в честь рода Rosa , со стандартным окончанием "-aceae" для семейства. Названия выше ранга семейства также образованы от родового названия или являются описательными (например, Gymnospermae или Fungi ).
Для животных существуют стандартные суффиксы для таксонов только до ранга надсемейства. [30] Единый суффикс был предложен (но не рекомендован) в AAAS [31] как -ida / ɪ d ə / для отрядов, например; протозоологи, похоже, принимают эту систему. Многие отряды метазоа (высшие животные) также имеют такой суффикс, например Hyolithida и Nectaspida (Naraoiida).
Образование имени на основе родового имени может быть непростым. Например, у homo родительный падеж hominis , поэтому род Homo (человек) находится в Hominidae , а не "Homidae".
Ранги эписемейства, инфрасемейства и инфратрибы (у животных) используются там, где сложность филетического ветвления требует более тонких, чем обычно, различий. Хотя они и находятся ниже ранга надсемейства, они не регулируются Международным кодексом зоологической номенклатуры и, следовательно, не имеют формальных стандартных окончаний. Перечисленные здесь суффиксы являются регулярными, но неформальными. [32]
В вирусологии формальные окончания для таксонов вироидов , сателлитных нуклеиновых кислот и вириформов похожи на вирусы, только -vir- заменяется на -viroid- , -satellit- и -viriform- . [24] Дополнительные уровни области и подобласти заканчиваются на -viria и -vira соответственно. [24]
Все ранги
Существует неопределенное количество рангов, так как таксономист может придумать новый ранг по своему желанию, в любое время, если он сочтет это необходимым. При этом существуют некоторые ограничения, которые будут различаться в зависимости от применяемого номенклатурного кода . [ необходима цитата ]
Ниже приведен искусственный синтез, исключительно в целях демонстрации абсолютного ранга (но см. примечания), от наиболее общего к наиболее частному: [33]
Ранги присваиваются на основе субъективного различия и не полностью отражают градационную природу изменчивости в природе. Эти проблемы уже были выявлены Вилли Хеннигом , который выступал за их отмену в 1969 году, [38] и эта позиция получила поддержку Грэма CD Гриффитса всего несколько лет спустя. [39] Фактически, эти ранги были предложены в фиксистском контексте, и наступление эволюции подорвало основы этой системы, как было признано давно; введение Кодекса номенклатуры и контрольного списка североамериканских птиц, принятого Американским союзом орнитологов, опубликованного в 1886 году, гласит: «Похоже, никто не подозревал в 1842 году [когда был составлен кодекс Стрикленда], что система Линнея не была постоянным наследием науки, или что через несколько лет теория эволюции должна была подорвать самые ее основы, радикально изменив человеческие представления о тех вещах, которым должны были быть даны названия». [40] Такие ранги используются просто потому, что они требуются кодами, основанными на рангах; из-за этого некоторые систематики предпочитают называть их номенклатурными рангами . [1] [6] В большинстве случаев более высокие таксономические группировки возникают позже во времени, просто потому, что наиболее инклюзивные таксоны обязательно появились первыми. [41] Более того, разнообразие некоторых основных таксонов (таких как позвоночные и покрытосеменные ) изучено лучше, чем других (таких как грибы , членистоногие и нематоды ) не потому, что они более разнообразны, чем другие таксоны, а потому, что их легче отбирать и изучать, чем другие таксоны, или потому, что они привлекают больше интереса и финансирования для исследований. [42] [43]
Из этих многочисленных рангов многие систематики считают, что наиболее основным (или важным) является вид, но это мнение не является общепринятым. [44] [45] [46] Таким образом, виды не обязательно более четко определены, чем таксоны любого другого ранга, и фактически, учитывая фенотипические пробелы, созданные вымиранием, на практике часто происходит обратное. [6] В идеале таксон должен представлять кладу , то есть филогению обсуждаемых организмов, но это не является требованием зоологических и ботанических кодексов. [6]
Классификация, в которой все таксоны имеют формальные ранги, не может адекватно отражать знания о филогении. Поскольку названия таксонов зависят от рангов в номенклатуре, основанной на рангах (Линнеевской), таксонам без рангов нельзя давать названия. Альтернативные подходы, такие как филогенетическая номенклатура , [47] [48], реализованная в соответствии с PhyloCode и поддерживаемая Международным обществом филогенетической номенклатуры , [49] или использование объемных названий , позволяют избежать этой проблемы. [50] [51] Теоретическая трудность с наложением таксономических рангов на эволюционные деревья проявляется как парадокс границ , который может быть проиллюстрирован дарвиновскими эволюционными моделями.
Нет никаких правил относительно того, сколько видов должно составлять род, семейство или любой другой более высокий таксон (то есть таксон в категории выше уровня вида). [52] [53] Это должна быть естественная группа (то есть неискусственная, неполифилетическая ) , как ее оценивает биолог, использующий всю доступную ему информацию. Равноранговые более высокие таксоны в разных типах не обязательно эквивалентны с точки зрения времени происхождения, фенотипической отличительности или количества включенных более низких таксонов (например, неверно предполагать, что семейства насекомых каким-то образом эволюционно сопоставимы с семействами моллюсков). [53] [54] [6] Из всех критериев, которые предлагались для ранжирования таксонов, возраст происхождения был наиболее часто предлагаемым. Вилли Хенниг предложил его в 1966 году, [9] но в 1969 году [38] он пришел к выводу , что эта система неработоспособна, и предложил отказаться от абсолютных рангов. Однако идея ранжирования таксонов с использованием возраста происхождения (либо как единственного критерия, либо как одного из основных) сохраняется под названием временного зонирования и по-прежнему отстаивается несколькими авторами. [55] [56] [57] [58] Для животных, по крайней мере, ранг типа обычно связан с определенным планом тела , что также, однако, является произвольным критерием. [ необходима ссылка ]
Загадочные таксоны
Загадочные таксоны — это таксономические группы, более широкие связи которых неизвестны или не определены. [59] (См. Incertae sedis .)
Мнемонический
Существует несколько аббревиатур, призванных помочь запомнить таксономическую иерархию, например, «Король Филипп приехал за отличными спагетти». [60] (См. Мнемонику таксономии .)
^ ab Dubois, Alain (2007). «Филогения, таксономия и номенклатура: проблема таксономических категорий и номенклатурных рангов». Zootaxa . 1519 : 27–68. doi :10.11646/zootaxa.1519.1.3.
^ аб Кантино, Филип Д.; де Кейрос, Кевин (2020). Филокод. Бока-Ратон, Флорида: CRC Press. ISBN978-0429821356.
^ «Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений – Мельбурнский кодекс». IAPT-Taxon.org . 2012. Статьи 2 и 3. Архивировано из оригинала 10 июня 2019 г. Получено 28 апреля 2013 г.
^ Лабеда, Дэвид П.; Орен, Аарон (2008). «Международный комитет по систематике прокариот; XI Международный (IUMS) конгресс по бактериологии и прикладной микробиологии». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (7): 1746–1752. doi : 10.1099/ijs.0.2008/005082-0 . ISSN 1466-5034.
^ abcde Лорен, Мишель (3 августа 2023 г.). Появление PhyloCode: продолжающаяся эволюция биологической номенклатуры. CRC Press. ISBN978-1-000-91257-9.
^ Международная комиссия по зоологической номенклатуре (1999), Международный кодекс зоологической номенклатуры. Четвертое издание, International Trust for Zoological Nomenclature, архивировано из оригинала 21 мая 2019 г. , извлечено 12 апреля 2015 г.
^ Павлинов, Игорь Я (2021). Таксономическая номенклатура: что в имени: история и теория (Первое изд.). Бока-Ратон: CRC Press. ISBN978-1003182535.
^ ab Hennig, Willi (1966). Филогенетическая систематика. Издательство Иллинойсского университета. ISBN978-0-252-06814-0.
^ Мартинес-Гутьеррес, Каролина А.; Эйлвард, Фрэнк О. (26 августа 2021 г.). «Филогенетический сигнал, конгруэнтность и неопределенность у бактерий и архей». Молекулярная биология и эволюция . 38 (12): 5514–5527. doi :10.1093/molbev/msab254. ISSN 1537–1719. PMC 8662615 .
^ Tarver, James E.; dos Reis, Mario; Mirarab, Siavash; Moran, Raymond J.; Parker, Sean; O'Reilly, Joseph E.; King, Benjamin L.; O'Connell, Mary J.; Asher, Robert J.; Warnow, Tandy; Peterson, Kevin J.; Donoghue, Philip CJ; Pisani, Davide (5 января 2016 г.). «Взаимоотношения плацентарных млекопитающих и пределы филогенетического вывода». Genome Biology and Evolution . 8 (2): 330–344. doi :10.1093/gbe/evv261. hdl : 1983/64d6e437-3320-480d-a16c-2e5b2e6b61d4 . ISSN 1759-6653.
^ Мур, РТ (1974). «Предложение о признании суперрангов» (PDF) . Таксон . 23 (4): 650–652. doi :10.2307/1218807. JSTOR 1218807. Архивировано (PDF) из оригинала 6 октября 2016 г. . Получено 5 октября 2016 г. .
^ Лукета, С. (2012). «Новые взгляды на мегаклассификацию жизни» (PDF) . Протистология . 7 (4): 218–237. Архивировано из оригинала (PDF) 2 апреля 2015 г.
^ ab Международная комиссия по зоологической номенклатуре (1999). "Глоссарий". Международный кодекс зоологической номенклатуры. Лондон: Международный траст зоологической номенклатуры. ISBN0-85301-006-4. Архивировано из оригинала 3 сентября 2021 г. . Получено 10 ноября 2023 г. .
^ abc Dubois, Alain (1 февраля 2007 г.). «Название таксонов по кладограммам: предостерегающая история». Молекулярная филогенетика и эволюция . 42 (2): 317–330. doi :10.1016/j.ympev.2006.06.007. ISSN 1055-7903.
^ Дюбуа, Ален (2000). «Синонимии и связанные с ними списки в зоологии: общие предложения с примерами из герпетологии». Dumerilia . 4 (2): 33–98.
^ jibran, jibran. "Войти ‹ Информация metBotanical Ranks: Understanding Taxonomic Classification" Мета-описание: Изучите иерархическую структуру ботанической классификации, от царства до вида, необходимую для понимания разнообразия и эволюции растений. описание — WordPress". dev-information-meta-descrition.pantheonsite.io . Получено 7 мая 2024 г.
^ «Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений – Мельбурнский кодекс». IAPT-Taxon.org . 2012. Архивировано из оригинала 10 октября 2020 г. Получено 28 апреля 2013 г.
^ "Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений – Мельбурнский кодекс". IAPT-Taxon.org . 2012. Статьи 4.2 и 24.1. Архивировано из оригинала 3 августа 2018 г. Получено 3 августа 2018 г.
^ "Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений – Мельбурнский кодекс". IAPT-Taxon.org . 2012. Статья 3.2 и Приложение 1, статьи H.1–3. Архивировано из оригинала 10 октября 2020 г. Получено 28 апреля 2013 г.
^ Stearn, WT 1992. Ботаническая латынь: история, грамматика, синтаксис, терминология и словарь, четвертое издание . Дэвид и Чарльз.
^ Göker, Markus; Oren, Aharon (22 января 2024 г.). «Действительная публикация названий двух доменов и семи царств прокариот». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 74 (1). Society for General Microbiology. doi : 10.1099/ijsem.0.006242. ISSN 1466-5034. PMID 38252124. Получено 7 июня 2024 г.
^ Чейз, М. В.; Ривил, Дж. Л. (2009), «Филогенетическая классификация наземных растений, сопровождающая APG III», Ботанический журнал Линнеевского общества , 161 (2): 122–127, doi : 10.1111/j.1095-8339.2009.01002.x
^ abcde "ICTV Code. Раздел 3.IV, § 3.23; раздел 3.V, §§ 3.27-3.28." Международный комитет по таксономии вирусов . Октябрь 2018 г. Архивировано из оригинала 6 июля 2022 г. Получено 28 ноября 2018 г.
^ Орен, Аарон (1 ноября 2023 г.). «Поправка к Принципу 8, Правилам 5b, 8, 15, 33a и Приложению 7 Международного кодекса номенклатуры прокариот с целью включения категорий царства и домена». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 73 (11). doi :10.1099/ijsem.0.006123. PMID 37909283.
^ Уитмен, Уильям Б.; Орен, Аарон; Чувочина, Мария; да Коста, Милтон С.; Гаррити, Джордж М.; Рейни, Фред А.; Росселло-Мора, Рамон; Шинк, Бернхард; Сатклифф, Иэн; Трухильо, Марта Э.; Вентура, Стефано (1 марта 2018 г.). «Предложение о суффиксе –ota для обозначения фил. Приложение к «Предложению о включении ранга филума в Международный кодекс номенклатуры прокариот». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 68 (3): 967–969. doi : 10.1099/ijsem.0.002593 . ISSN 1466-5034. PMID 29458499.
^ ab "Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений (Шэньчжэньский кодекс)". IAPT-Taxon.org . 2018. Статья 16. Архивировано из оригинала 19 декабря 2018 г. Получено 19 декабря 2018 г.
^ Например, черепаховые инфрасемейства Chelodd (Gaffney & Meylan 1988: 169) и Baenodd ( там же , 176).
^ МКЗН статья 29.2
^ Pearse, AS (1936) Зоологические названия. Список типов, классов и отрядов, подготовленный для раздела F, Американская ассоциация содействия развитию науки. Архивировано 15 ноября 2021 г. в Wayback Machine Американская ассоциация содействия развитию науки, стр. 4
↑ По материалам Gaffney & Meylan (1988).
^ Для общего использования зоологических рангов между уровнями типа и семейства, включая множество интеркалярных рангов, см. Carroll (1988). Для дополнительных интеркалярных рангов в зоологии см., в частности, Gaffney & Meylan (1988); McKenna & Bell (1997); Milner (1988); Novacek (1986, цит. в Carroll 1988: 499, 629); и классификацию птицетазовых динозавров Пола Серено 1986 года , как описано в Lambert (1990: 149, 159). Для ботанических рангов, включая множество интеркалярных рангов, см. Willis & McElwain (2002).
^ abcd Это подвижные ранги, чаще всего вставляемые между классом и легионом или когортой. Тем не менее, их расположение в зоологической иерархии может быть предметом широких вариаций. Для примеров см. классификацию позвоночных Бентона, архивированная 16 января 2019 года в Wayback Machine (2005).
^ abcd В зоологической классификации когорта и связанная с ней группа рангов вставляются между группой класса и порядковой группой. Когорта также использовалась между инфраотрядом и семейством у ящеротазовых динозавров (Benton Архивировано 16 января 2019 г. в Wayback Machine 2005). В ботанической классификации группа когорт иногда вставлялась между группой подразделения (филума) и группой класса: см. Willis & McElwain (2002: 100–101), или иногда использовалась в ранге отряда и теперь считается устаревшим названием для отряда: см. Международный кодекс номенклатуры водорослей, грибов и растений, Мельбурнский кодекс 2012 г., статья 17.2.
^ abcde Надпорядковая последовательность гигаотряд–мегаотряд–капаксатряд–гиперотряд (и микроотряд, примерно в той позиции, которую чаще всего относят к парвотряду) использовалась по крайней мере у черепах (Gaffney & Meylan 1988), в то время как параллельная последовательность магноотряд–грандотряд–зеркотряд фигурирует в недавних влиятельных классификациях млекопитающих. Из источников неясно, как эти две последовательности должны быть скоординированы (или переплетены) в единой зоологической иерархии рангов. Ранее Новачек (1986) и Маккенна-Белл (1997) вставляли зеркалотряды и грандотряды между отрядом и надотрядом, но Бентон (2005) теперь помещает оба этих ранга выше надотряда.
^ Кроме того, термины биовар , морфовар , фаговар и серовар обозначают штаммы бактерий (генетические варианты), которые физиологически или биохимически отличаются. Это не таксономические ранги, а группировки различных видов, которые могут определять подвид бактерий.
^ аб Хенниг, Вилли (1969). Die Stammesgeschichte der Insekten . Франкфурт-на-Майне: Крамер. п. 436.
^ Гриффитс, Грэм CD (декабрь 1973 г.). «Некоторые фундаментальные проблемы биологической классификации». Систематическая зоология . 22 (4): 338–343. doi :10.2307/2412942. ISSN 0039-7989. JSTOR 2412942.
^ Американский союз орнитологов (1886). Кодекс номенклатуры и контрольный список североамериканских птиц, принятый Американским союзом орнитологов; Отчет Комитета союза по классификации и номенклатуре. С. viii + 392.
^ Джинджерич, PD (1987). «Эволюция и палеонтологическая летопись: закономерности, темпы и процессы». Канадский журнал зоологии . 65 (5): 1053–1060. doi :10.1139/z87-169.
^ Blaxter, Mark; Mann, Jenna; Chapman, Tom; Thomas, Fran; Whitton, Claire; Floyd, Robin; Abebe, Eyualem (29 октября 2005 г.). «Определение операционных таксономических единиц с использованием данных ДНК-штрихкода». Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 360 (1462): 1935–1943. doi :10.1098/rstb.2005.1725. hdl : 1842/4732 . ISSN 0962-8436.
^ Хиббетт, Дэвид С.; Нильссон, Р. Хенрик; Снайдер, Марк; Фонсека, Марио; Костанцо, Джанин; Шонфельд, Моран (1 августа 2005 г.). «Автоматизированная филогенетическая таксономия: пример гомобазидиомицетов (грибов-образующих грибов)». Systematic Biology . 54 (4): 660–668. doi :10.1080/10635150590947104. ISSN 1063-5157.
^ Мишлер, Брент Д.; Донохью, Майкл Дж. (1982). «Концепции видов: случай плюрализма». Систематическая зоология . 31 (4): 491–503. doi :10.2307/2413371. ISSN 0039-7989. JSTOR 2413371.
^ Мишлер, Брент Д. (9 июля 1999 г.). «Избавление от видов?». Виды . Издательство MIT: 307–316. doi :10.7551/mitpress/6396.003.0020. ISBN978-0-262-28635-0.
^ Эрешефски, Марк (сентябрь 2002 г.). «Ряды Линнея: остатки ушедшей эпохи». Философия науки . 69 (S3): S305–S315. doi :10.1086/341854. ISSN 0031-8248.
^ де Кейрос, Кевин; Готье, Жак (декабрь 1990 г.). «Филогения как центральный принцип таксономии: филогенетические определения названий таксонов». Систематическая зоология . 39 (4): 307. doi :10.2307/2992353. ISSN 0039-7989. JSTOR 2992353.
^ Серено, Пол К. (1 июня 1999 г.). «Определения в филогенетической таксономии: критика и обоснование». Systematic Biology . 48 (2): 329–351. doi :10.1080/106351599260328. ISSN 1076-836X.
^ Лорен, Мишель; Кантино, Филип Д. (сентябрь 2004 г.). «Первое международное совещание по филогенетической номенклатуре: отчет». Zoologica Scripta . 33 (5): 475–479. doi :10.1111/j.0300-3256.2004.00176.x. ISSN 0300-3256.
^ Клюге, Н. Дж. (1999). «Система альтернативных номенклатур надвидовых таксонов. Линнеевские и постлиннеевские принципы систематики». Entomological Review . 79 (2): 133–147.
^ Клюге, Нью-Джерси (2010). «Окружные названия высших таксонов Hexapoda». Bionomina . 1 (1): 15–55. doi : 10.11646/bionomina.1.1.3 .
^ Stuessy, TF (2009). Таксономия растений: систематическая оценка сравнительных данных. 2-е изд. Columbia University Press, стр. 175.
^ Дюбуа, Ален; Олер, Аннемари; Пирон, Р. Александр (26 февраля 2021 г.). «Новые концепции и методы филогенетической таксономии и номенклатуры в зоологии, на примере новой ранжированной кладономии современных амфибий (Lissamphibia)». Megataxa . 5 (1): 1–738. doi : 10.11646/megataxa.5.1.1 . ISSN 2703-3090.
^ Avise, John C.; Johns, Glenn C. (22 июня 1999 г.). «Предложение о стандартизированной временной схеме биологической классификации существующих видов». Труды Национальной академии наук . 96 (13): 7358–7363. doi : 10.1073/pnas.96.13.7358 . ISSN 0027-8424. PMC 22090 .
^ Avise, John C.; Mitchell, Dale (1 февраля 2007 г.). «Время стандартизировать таксономии». Systematic Biology . 56 (1): 130–133. doi :10.1080/10635150601145365. ISSN 1076-836X.
^ Чжао, Жуй-Линь; Чжоу, Цзюнь-Лян; Чэнь, Цзе; Маргаритеску, Симона; Санчес-Рамирес, Сантьяго; Хайд, Кевин Д.; Каллак, Филипп; Парра, Луис А.; Ли, Го-Цзе; Монкальво, Жан-Марк (1 мая 2016 г.). «На пути к стандартизации таксономических рангов с использованием времени расхождения — исследование случая реконструкции таксономической системы Agaricus». Fungal Diversity . 78 (1): 239–292. doi :10.1007/s13225-016-0357-x. ISSN 1878-9129.
^ Lücking, R. (4 мая 2019 г.). «Прекратите злоупотреблять временем! Строгое временное разделение — не будущее ранговых классификаций грибов (включая лишайники) и других организмов». Critical Reviews in Plant Sciences . 38 (3): 199–253. doi : 10.1080/07352689.2019.1650517. ISSN 0735-2689.
^ Эванс, Род Л. (2007). Каждый хороший мальчик заслуживает подделки: Книга мнемонических приемов. Penguin. ISBN978-1-4406-2207-6. Архивировано из оригинала 23 ноября 2023 г. . Получено 23 ноября 2023 г. .
Гаффни, Юджин С .; Мейлан, Питер А. (1988). «Филогения черепах». В Бентоне, М. Дж. (ред.). Филогения и классификация четвероногих . Том 1: Амфибии, рептилии, птицы. Оксфорд: Clarendon Press. С. 157–219.
Ламберт, Дэвид (1990). Книга данных о динозаврах . Оксфорд: Факты в деле / Британский музей (Естественная история. ISBN 0816024316.
Маккенна, Малкольм С.; Белл, Сьюзен К., ред. (1997). Классификация млекопитающих выше уровня вида . Нью-Йорк: Columbia University Press. ISBN 0231110138.
Милнер, Эндрю (1988). «Взаимоотношения и происхождение ныне живущих амфибий». В Бентоне, М. Дж. (ред.). Филогения и классификация четвероногих . Т. 1: Амфибии, рептилии, птицы. Оксфорд: Clarendon Press. С. 59–102.
Новачек, Майкл Дж. (1986). «Череп лептиктидных насекомоядных и классификация плацентарных млекопитающих более высокого уровня». Бюллетень Американского музея естественной истории (183): 1–112.
Серено, Пол К. (1986). «Филогения птицетазовых динозавров (отряд Ornithischia)». National Geographic Research . 2 : 234–256.
Уиллис, К. Дж.; МакЭлвейн, Дж. К. (2002). Эволюция растений . Oxford University Press. ISBN 0198500653.