stringtranslate.com

Некробиом

Некробиом определяется как сообщество видов , связанных с разлагающимися останками после смерти организма. [1] Процесс разложения сложен. Микробы разлагают трупы , но другие организмы, включая грибки , нематоды , насекомых и более крупных животных- падальщиков , также вносят свой вклад. [2] Как только иммунная система перестает быть активной, микробы, колонизирующие кишечник и легкие, разлагают свои соответствующие ткани , а затем перемещаются по всему телу через кровеносную и лимфатическую системы, чтобы разрушить другие ткани и кости . [3] Во время этого процесса в качестве побочного продукта выделяются газы , которые накапливаются, вызывая вздутие живота . [4] В конце концов газы просачиваются через раны тела и естественные отверстия , предоставляя некоторым микробам возможность выйти изнутри трупа и поселиться снаружи. [3] Микробные сообщества, колонизирующие внутренние органы трупа, называются танатомикробиомом . [5] Область за пределами трупа, которая подвергается воздействию внешней среды, называется эпинекротическими микробными сообществами некробиома, [6] [7] [5] и особенно важна при определении времени и места смерти человека. [6] Различные микробы играют определенную роль на каждом этапе процесса разложения. Микробы, которые колонизируют труп, и скорость их активности определяются самим трупом и окружающими его условиями окружающей среды. [7]

История

Существуют текстовые свидетельства того, что человеческие трупы впервые были изучены около третьего века до нашей эры, чтобы получить представление об анатомии человека . [8] Многие из первых исследований человеческих трупов проводились в Италии , где самая ранняя запись об определении причины смерти по человеческому трупу датируется 1286 годом. [8] Однако понимание человеческого тела прогрессировало медленно, отчасти потому, что распространение христианства и других религиозных верований привело к тому, что вскрытие людей стало незаконным. [8]

Только нечеловеческие животные подвергались анатомическому препарированию до 13-го века, когда чиновники поняли, что человеческие трупы необходимы для лучшего понимания человеческого тела. [8] Только в 1676 году Антони ван Левенгук разработал линзу , которая позволила визуализировать микробов, [9] и только в конце 18-го века микробы стали считаться полезными для изучения тела после смерти. [10]

Некробиом на трупе свиньи
Некробиом на трупе свиньи

В наше время человеческие трупы используются для исследований , но другие модели животных могут обеспечить более крупные размеры выборки и производить более контролируемые исследования . [11] [12] Микробная колонизация между людьми и некоторыми нечеловеческими животными настолько схожа, что эти модели можно использовать для понимания процесса разложения людей. [13] Свиньи неоднократно использовались для понимания процесса разложения человека в наземных условиях. [14] [15] Свиньи подходят для изучения разложения человека из-за их размера, редких волос и похожих бактерий, обнаруженных в их желудочно-кишечном тракте . [16] Туши свиней также сводят к минимуму проблему вариации, которая существует при использовании человеческих трупов в качестве объектов исследования. [17]

Сложные молекулярные методы позволили идентифицировать микробные сообщества, которые обитают в трупах и разлагают их; однако это исследование является довольно новым. [5] Изучение некробиома становится все более полезным для определения времени и причины смерти, [7] [5], что полезно при расследовании преступлений. [18]

Применение в криминалистике

Микробная криминалистика

Поскольку некробиом имеет дело с различными сообществами бактерий и других организмов, которые катализируют разложение растений и животных, этот конкретный биом становится все более важной частью судебной экспертизы . Микробы, занимающие пространство под и вокруг разлагающегося тела, уникальны для него — подобно тому, как отпечатки пальцев являются исключительно уникальными только для одного человека. [19] Используя эту дифференциацию, судебные следователи на месте преступления могут различать места захоронения , а также получать конкретную фактическую информацию о том, как долго тело находилось там, и о прогнозируемой области, в которой могла произойти смерть. [20]

Судебные микробиологи исследуют способы определения времени и места смерти, анализируя микробы, присутствующие на трупе. [21] Микробная шкала времени разложения тела известна как микробные часы . Она оценивает, как долго тело находилось в определенном месте, на основе присутствующих или отсутствующих микробов. [22] Последовательность видов бактерий, заселяющих тело после четырехдневного периода, является индикатором минимального времени с момента смерти. [23] Недавно были проведены исследования, чтобы определить, могут ли бактерии сами по себе определять интервал после смерти. [11] Бактерии, ответственные за разложение трупов, может быть трудно изучать, поскольку бактерии, обнаруженные на трупе, различаются и быстро изменяются. [24] [11] Бактерии могут быть занесены на труп падальщиками, воздухом или водой. [25] Другие факторы окружающей среды, такие как температура и почва, могут влиять на микробы, обнаруженные на трупе. [25]

Время смерти можно оценить не только по типу и количеству бактерий на трупе, но и по химическим соединениям, вырабатываемым этими бактериями. Судебный антрополог Арпад Васс определил на основе исследований, которые он провел в 1990-х годах, что три типа жирных кислот , вырабатываемых, когда бактерии расщепляют жировые ткани , мышцы и остатки пищи в желудке , полезны для прогнозирования времени с момента смерти во время судебно-медицинских расследований. [26]

Судебная энтомология

Судебная энтомология , изучение насекомых ( членистоногих ), обнаруженных в разлагающихся телах людей, полезна для определения посмертного интервала по прошествии 3-4 дней с момента смерти. [27] Различные виды мух обычно притягиваются к трупу и обычно откладывают там свои яйца. [26] Таким образом, как стадии развития одного вида мух , так и последовательность различных видов могут дать оценку того, как давно человек умер. Поскольку присутствие и жизненный цикл насекомых различаются в зависимости от температуры и условий окружающей среды, этот тип анализа не может дать фактическое время смерти, а дает только минимальное время с момента смерти. Умерший не мог быть мертв дольше, чем самая старая найденная личинка . [27]

Активность насекомых также может указывать на причину смерти. Мясные мухи обычно откладывают яйца в естественные полости тела, которые легко доступны, но также защищены. Если характер активности личинок проявляется в другом месте, это может указывать на травму , например, колотую рану , даже если окружающая ткань разложилась. В случае смерти, вызванной ядом , следы токсина могли быть потреблены личинками, не причинив им вреда. [27]

Поскольку виды насекомых, как правило, имеют определенные географические ареалы и известные предпочтения в отношении среды обитания , судебные энтомологи могут определить, было ли тело перемещено после смерти. Анализ насекомых в некробиоме может указать, произошла ли смерть в иной экологической или географической среде, чем та, где был найден труп. [27]

Исследовать

Человеческие трупы

Разложение человеческих тел изучается в исследовательских учреждениях, известных как фермы тел . Такие учреждения находятся в семи учебных заведениях в Соединенных Штатах : Университет Теннесси в Ноксвилле , Университет Западной Каролины , Техасский государственный университет , Университет штата Сэм Хьюстон , Университет Южного Иллинойса , Университет Колорадо Меса и Университет Южной Флориды . Эти учреждения изучают разложение трупов всеми возможными способами распада, в том числе в открытой или замороженной среде, захоронение под землей или внутри автомобилей. [28] Изучая трупы, эксперты изучают микробную временную шкалу и документируют, что типично для каждой стадии в различных местах, где находится каждое тело. [28]

В 2013 году в Юго-восточном техасском центре прикладной судебной экспертизы в Университете Сэма Хьюстона исследователи задокументировали рост бактерий в двух разлагающихся трупах, помещенных в естественную внешнюю среду. Их внимание было сосредоточено на стадии вздутия, когда сероводород и метан, вырабатываемые бактериями, накапливаются и раздувают труп. Они обнаружили, что «к концу периода вздутия... анаэробные бактерии, такие как Clostridia, стали доминирующими», а мазки из ротовой полости «показали сдвиг в сторону Firmicutes , группы бактерий, включающей Clostridia». [26]

К 2019 году Дженнифер Печаль, исследователь в области судебной медицины в Университете штата Мичиган , работала с микробами на почти 2000 человеческих останках в самых разных условиях. Она предложила модель некробиома, которая совпадает с данными ученых из Италии, Австрии и Франции. Они обнаружили, что «большой, последовательный сдвиг в микробном сообществе» происходит примерно через 48 часов после смерти, что позволяет «довольно легко определить, было ли тело мертво более или менее 2 дней». Печаль также надеется, что микробные тесты можно будет использовать в будущем, чтобы помочь патологоанатомам определять недиагностированные заболевания, которые стали причиной смерти. [26]

Нечеловеческие останки

Исследование 2019 года в Университете Хаддерсфилда в Западном Йоркшире , Соединенное Королевство, было направлено на изучение влияния меха на некробиом кроликов . В эксперименте участвовали шесть мертвых кроликов, купленных у компании по производству кормов для домашних животных Kiezebrink. Мех был удален с туловищ трех испытуемых. Все шесть образцов были помещены на «стерильный песок в чистые пластиковые контейнеры». [29] Крышки, закрывающие контейнеры, не позволяли птицам и другим падальщикам получить доступ к тушам , в то время как небольшие отверстия, просверленные в боковых стенках контейнеров, обеспечивали поток воздуха и активность насекомых, пока контейнеры находились на крыше университетского здания. Образцы собирали из внутренней части рта, верхней части кожи туловища, подвергавшейся воздействию воздушной среды, и нижней части кожи туловища, контактировавшей с песком. Наиболее многочисленными были протеобактерии , за которыми следовали Firmicutes, Bacteroidetes и Actinobacteria во время активной стадии разложения. На поздней стадии разложения количество Proteobacteria снизилось с 99,4% до 81,6% в полости рта, но было наиболее многочисленным в образцах без меха. Firmicutes были наиболее многочисленными в образцах кожи как в образцах с мехом, так и без меха. Наконец, Proteobacteria была наиболее многочисленной в почвенном интерфейсе в начале разложения как в образцах с мехом, так и без меха. Исследователи также отметили, что количество Actinobacteria было наименее многочисленным в активной стадии и еще больше уменьшилось во время сухой стадии. Вывод эксперимента состоял в том, что хотя бактериальные сообщества изменились в ходе разложения, наиболее значительная вариация приписывается различным анатомическим областям, «но независимо от наличия меха». [29]

Технологии и методики

Методы анализа некробиома включают анализ жирных кислот фосфолипидов (PLFA), [17] общие метиловые эфиры жирных кислот почвы , [17] и профилирование ДНК . [17] Эта технология используется для упрощения сбора образцов в последовательности, которые могут читать ученые. Упрощенная последовательность некробиома пропускается через банк данных, чтобы соответствовать его названию. Из-за отсутствия универсальной технологии алгоритмов существует пробел в знаниях на различных платформах в разных регионах мира. Чтобы закрыть этот пробел, необходимо расширение технологии. Однако есть несколько препятствий, включая определение потребностей, исследования, разработку прототипа, принятие и внедрение. [30]

Исследователи работают над алгоритмом для прогнозирования времени с момента смерти с точностью до двух дней, что будет улучшением по сравнению с временными рамками, которые дает судебная энтомология. [31] Дженнифер Печаль утверждает, что эти компьютерные модели должны «быть протестированы на телах с известным временем смерти, чтобы убедиться в их точности». По состоянию на 2020 год эта технология все еще будет доступна через 5–10 лет. [26]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Benbow ME, Lewis AJ, Tomberlin JK, Pechal JL (март 2013 г.). «Сезонная сборка сообщества насекомых-некрофагов во время разложения падали позвоночных». Журнал медицинской энтомологии . 50 (2): 440–50. doi : 10.1603/me12194 . PMID  23540134. S2CID  2244448.
  2. ^ Yong E (2015-12-10). «Познакомьтесь с некробиомом: микробы, которые съедят ваш труп». The Atlantic . Получено 28.04.2020 .
  3. ^ ab Janaway RC (1996). «Распад захороненных человеческих останков и связанных с ними материалов». В Hunter J, Roberts C, Martin A (ред.). Исследования в области преступности: введение в судебную археологию . Лондон: Batsford. стр. 58–85.
  4. ^ Vass AA, Barshick SA, Sega G, Caton J, Skeen JT, Love JC, Synstelien JA (май 2002 г.). «Химия разложения человеческих останков: новая методология определения посмертного интервала». Журнал судебной экспертизы . 47 (3): 542–53. doi :10.1520/JFS15294J. PMID  12051334.
  5. ^ abcd Ventura Spagnolo E, Stassi C, Mondello C, Zerbo S, Milone L, Argo A (февраль 2019 г.). «Приложения судебной микробиологии: систематический обзор». Юридическая медицина . 36 : 73–80. doi :10.1016/j.legalmed.2018.11.002. PMID  30419494. S2CID  53293516.
  6. ^ ab Zhou W, Bian Y (2018-04-03). «Профилирование состава танатомикробиома как инструмент для судебно-медицинского расследования». Forensic Sciences Research . 3 (2): 105–110. doi :10.1080/20961790.2018.1466430. PMC 6197100. PMID  30483658 . 
  7. ^ abc Javan GT, Finley SJ, Can I, Wilkinson JE, Hanson JD, Tarone AM (июль 2016 г.). "Human Thanatomicrobiome Succession and Time Since Death". Scientific Reports . 6 (1): 29598. Bibcode :2016NatSR...629598J. doi :10.1038/srep29598. PMC 4944132 . PMID  27412051. 
  8. ^ abcd Ghosh SK (сентябрь 2015 г.). «Вскрытие трупа человека: исторический отчет от Древней Греции до современной эпохи». Anatomy & Cell Biology . 48 (3): 153–69. doi :10.5115/acb.2015.48.3.153. PMC 4582158 . PMID  26417475. 
  9. ^ Young E (2016). Я содержу множество: микробы внутри нас и более грандиозный взгляд на жизнь . Нью-Йорк: HarperCollins Publishers. ISBN 978-0-06-236860-7.
  10. ^ Ридель С. (апрель 2014 г.). «Значение культур микробиологии после смерти». Журнал клинической микробиологии . 52 (4): 1028–33. doi :10.1128/JCM.03102-13. PMC 3993482. PMID  24403308 . 
  11. ^ abc Hyde ER, Metcalf JL, Bucheli SR, Lynne AM, Knight R (2017). «Микробные сообщества, связанные с разлагающимися трупами». Судебная микробиология . John Wiley & Sons, Ltd: 245–273. doi :10.1002/9781119062585.ch10. ISBN 978-1-119-06258-5.
  12. ^ Finley SJ, Benbow ME, Javan GT (май 2015 г.). «Микробные сообщества, связанные с разложением человека, и их потенциальное использование в качестве посмертных часов». International Journal of Legal Medicine . 129 (3): 623–32. doi :10.1007/s00414-014-1059-0. PMID  25129823. S2CID  7939775.
  13. ^ Burcham ZM, Hood JA, Pechal JL, Krausz KL, Bose JL, Schmidt CJ и др. (Июль 2016 г.). «Флуоресцентно маркированные бактерии дают представление о посмертной микробной трансмиграции». Forensic Science International . 264 : 63–9. doi : 10.1016/j.forsciint.2016.03.019 . PMID  27032615.
  14. ^ Carter DO, Metcalf JL, Bibat A, Knight R (июнь 2015 г.). «Сезонная изменчивость посмертных микробных сообществ». Судебная медицина, медицина и патология . 11 (2): 202–7. doi :10.1007/s12024-015-9667-7. PMC 9636889. PMID 25737335.  S2CID 23968523  . 
  15. ^ Pechal JL, Crippen TL, Tarone AM, Lewis AJ, Tomberlin JK, Benbow ME (2013-11-12). "Функциональное изменение микробного сообщества во время разложения падали позвоночных". PLOS ONE . ​​8 (11): e79035. Bibcode :2013PLoSO...879035P. doi : 10.1371/journal.pone.0079035 . PMC 3827085 . PMID  24265741. 
  16. ^ Schoenly KG, Haskell NH, Mills DK, Bieme-Ndi C, Larsen K, Lee Y (2006-09-01). «Воссоздание акра смерти на школьном дворе: использование свиных туш в качестве модельных трупов для обучения концепциям судебной энтомологии и экологической сукцессии». Американский учитель биологии . 68 (7): 402–410. doi :10.2307/4452028. JSTOR  4452028.
  17. ^ abcd Parkinson RA, Dias KR, Horswell J, Greenwood P, Banning N, Tibbett M, Vass AA (2009). "Анализ микробного сообщества разложения человека на почве". Криминальная и экологическая судебная экспертиза почвы . Дордрехт: Springer. стр. 379–394. doi :10.1007/978-1-4020-9204-6_24. ISBN 978-1-4020-9203-9.
  18. ^ Фу, Сяолян; Го, Цзюаньцзюань; Финкельбергс, Дмитрийс; Хэ, Цзин; Чжа, Лагабайила; Го, Ядун; Цай, Цзифэн (сентябрь 2019 г.). «Грибная сукцессия во время разложения трупа млекопитающего и потенциальные судебно-медицинские последствия». Scientific Reports . 9 (12907): 12907. Bibcode :2019NatSR...912907F. doi : 10.1038/s41598-019-49361-0 . PMC 6733900 . PMID  31501472. 
  19. ^ Franzosa EA, Huang K, Meadow JF, Gevers D, Lemon KP, Bohannan BJ, Huttenhower C (июнь 2015 г.). «Идентификация персональных микробиомов с использованием метагеномных кодов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (22): E2930-8. Bibcode : 2015PNAS..112E2930F. doi : 10.1073/pnas.1423854112 . PMC 4460507. PMID  25964341 . 
  20. ^ Benbow ME, Lewis AJ, Tomberlin JK, Pechal JL (март 2013 г.). «Сезонная сборка сообщества насекомых-некрофагов во время разложения падали позвоночных». Журнал медицинской энтомологии . 50 (2): 440–50. doi : 10.1603/me12194 . PMID  23540134. S2CID  2244448.
  21. ^ Lehman DC (апрель 2014 г.). «Судебная микробиология». Информационный бюллетень клинической микробиологии . 36 (7): 49–54. doi :10.1016/j.clinmicnews.2014.03.001.
  22. ^ Джессика Л. Меткалф; Лора Вегенер Парфри ; Антонио Гонсалес и др. (15 октября 2013 г.). «Микробные часы дают точную оценку посмертного интервала в мышиной модельной системе». eLife . 2 : e01104. doi : 10.7554/ELIFE.01104 . ISSN  2050-084X. PMC 3796315. PMID 24137541.  Wikidata Q35020251  . 
  23. ^ Hauther KA, Cobaugh KL, Jantz LM, Sparer TE, DeBruyn JM (сентябрь 2015 г.). «Оценка времени с момента смерти по посмертным микробным сообществам кишечника человека». Журнал судебной экспертизы . 60 (5): 1234–40. doi :10.1111/1556-4029.12828. PMID  26096156. S2CID  28321113.
  24. ^ Васс А. (2001). «За пределами могилы — понимание разложения человека». Микробиология сегодня . 28 (28): 190–192.
  25. ^ ab Hyde ER, Haarmann DP, Lynne AM, Bucheli SR, Petrosino JF (2013-10-30). "Живые мертвецы: структура бактериального сообщества трупа в начале и конце стадии разложения вздутия". PLOS ONE . ​​8 (10): e77733. Bibcode :2013PLoSO...877733H. doi : 10.1371/journal.pone.0077733 . PMC 3813760 . PMID  24204941. 
  26. ^ abcde Энгельхаупт, Эрика (2020). Кровавые подробности: приключения с темной стороны науки . Вашингтон, округ Колумбия: National Geographic Partners, LLC. ISBN 978-1-4262-2098-2.
  27. ^ abcd Erzinçlioglu Z (1 января 2003 г.). «Судебная энтомология». Клиническая медицина . 3 (1): 74–6. doi :10.7861/clinmedicine.3-1-74. PMC 4953364. PMID  12617420 . 
  28. ^ ab Wallman JF (декабрь 2017 г.). «Фермы тел». Судебная медицина, медицина и патология . 13 (4): 487–489. doi :10.1007/s12024-017-9932-z. PMID  29075978. S2CID  28905230.
  29. ^ ab Tuccia F, Zurgani E, Bortolini S, Vanin S (сентябрь 2019 г.). «Экспериментальная оценка применимости анализа некробиома в судебной ветеринарии». MicrobiologyOpen . 8 (9): e00828. doi :10.1002/mbo3.828. PMC 6741123 . PMID  30861327. 
  30. ^ Metcalf JL (январь 2019 г.). «Оценка посмертного интервала с использованием микробов: пробелы в знаниях и путь к внедрению технологий». Forensic Science International. Генетика . 38 : 211–218. doi : 10.1016/j.fsigen.2018.11.004 . PMID  30448529.
  31. ^ Джонсон HR, Тринидад DD, Гузман S, Хан Z, Парзиале JV, ДеБрюн JM, Ленц NH (2016). «Подход машинного обучения к использованию микробиома кожи после смерти для оценки интервала между смертью». PLOS ONE . 11 (12): e0167370. Bibcode : 2016PLoSO..1167370J. doi : 10.1371/journal.pone.0167370 . PMC 5179130. PMID  28005908 .