stringtranslate.com

Нуклеоплазма

Протоплазматический материал ядра, включая ядрышко, обозначается как нуклеоплазма.

Нуклеоплазма , также известная как кариоплазма , [1] является типом протоплазмы , которая составляет ядро ​​клетки , наиболее заметную органеллу эукариотической клетки . Она заключена в ядерную оболочку , также известную как ядерная мембрана. [2] Нуклеоплазма напоминает цитоплазму эукариотической клетки тем, что она представляет собой гелеобразное вещество, находящееся внутри мембраны, хотя нуклеоплазма только заполняет пространство в ядре и имеет свои собственные уникальные функции. Нуклеоплазма подвешивает структуры внутри ядра, которые не связаны с мембраной, и отвечает за поддержание формы ядра. [2] Структуры, подвешенные в нуклеоплазме, включают хромосомы , различные белки , ядерные тельца , ядрышко , нуклеопорины , нуклеотиды и ядерные спеклы . [2]

Растворимая жидкая часть нуклеоплазмы называется кариолимфой [ 3] , нуклеозолем [4] или ядерной гиалоплазмой .

История

альтернативный текст
Польско - немецкий ботаник и ученый, определяющий нуклеоплазму, Эдуард Страсбургер .

Существование ядра, включая нуклеоплазму, было впервые задокументировано еще в 1682 году голландским микроскопистом Левенгуком, а позднее было описано и зарисовано Францем Бауэром . [5] Однако клеточное ядро ​​не было названо и подробно описано до презентации Роберта Брауна Линнеевскому обществу в 1831 году. [6] Нуклеоплазма, хотя и была описана Бауэром и Брауном, не была специально выделена как отдельная сущность до ее названия в 1882 году польско - немецким ученым Эдуардом Страсбургером , одним из самых известных ботаников 19 века и первым человеком, открывшим митоз у растений. [7]

Роль

Многие важные функции клетки происходят в ядре, а точнее в нуклеоплазме. Основная функция нуклеоплазмы — обеспечивать надлежащую среду для основных процессов, происходящих в ядре, служить суспензионным веществом для всех органелл внутри ядра и хранить структуры, которые используются в этих процессах. [2] 34% белков, закодированных в геноме человека , локализуются в нуклеоплазме. [2] Эти белки принимают участие в транскрипции РНК и регуляции генов в нуклеоплазме. [2] Белки, расположенные в нуклеоплазме, участвуют в активации генов, которые используются в клеточном цикле. [8] Некоторые нуклеопорины, которые обычно составляют ядерную пору , могут быть подвижными и участвовать в регуляции экспрессии генов в нуклеоплазме. [8] [9] Ядерная пора — это место, где молекулы перемещаются из нуклеоплазмы в цитоплазму и наоборот. [9] Нуклеоплазма также является маршрутом для перемещения многих молекул. [9] Более мелкие молекулы способны свободно проходить через ядерную пору, чтобы попасть в нуклеоплазму и выйти из нее, в то время как более крупные белки нуждаются в помощи рецепторов на поверхности ядерной оболочки. [9] Также считается, что ядерный матрикс содержится в нуклеоплазме, где он функционирует для поддержания размера и формы ядра, в роли, аналогичной роли цитоскелета, обнаруженного в цитоплазме. [10] Однако существование и точная функция ядерного матрикса остаются неясными и активно обсуждаются.

Состав

Нуклеоплазма — это высоковязкая жидкость, окруженная ядерной мембраной и состоящая в основном из воды, белков, растворенных ионов и множества других веществ, включая нуклеиновые кислоты и минералы.

Белки

Было обнаружено, что почти треть генов, кодирующих человеческие белки (6784 гена) [2], локализуются в нуклеоплазме посредством нацеливания последовательностью ядерной локализации (NLS). Цитозольные белки, известные как импортины , действуют как рецепторы для NLS, сопровождая белок в комплекс ядерной поры для транспортировки в нуклеоплазму. [11] Белки в нуклеоплазме в основном отвечают за участие и регулирование клеточных функций, которые зависят от ДНК, включая транскрипцию, сплайсинг РНК , репарацию ДНК , репликацию ДНК и различные метаболические процессы. [2] Эти белки делятся на гистоновые белки, класс белков, которые связываются с ДНК и придают хромосомам их форму и регулируют активность генов, [12] и негистоновые белки.

Нуклеоплазма содержит множество ферментов, которые играют важную роль в синтезе ДНК и РНК, включая ДНК-полимеразу и РНК-полимеразу , которые функционируют в репликации ДНК и транскрипции РНК соответственно. Кроме того, нуклеоплазма является хозяином многих ферментов, которые играют существенную роль в клеточном метаболизме . НАД+-синтаза хранится в нуклеоплазме и функционирует в переносе электронов и окислительно-восстановительных реакциях, связанных с цепью переноса электронов и синтезом аденозинтрифосфата (АТФ). [13] Пируваткиназа также обнаружена в нуклеоплазме в значительных количествах; этот фермент участвует в заключительном этапе гликолиза , катализируя превращение фосфоенолпирувата (ФЕП) в пируват вместе с фосфорилированием аденозиндифосфата (АДФ) в АТФ. [14] Важно отметить, что нуклеоплазма содержит кофакторы и коферменты, включая ацетил-КоА , который играет важную роль в цикле лимонной кислоты , [15] и АТФ, который участвует в хранении и передаче энергии.

Ионы

альтернативный текст
Пример натрий-калиевого насоса , АТФазы P-типа , которая контролирует ионный градиент через клеточную мембрану и ядерную оболочку , а также ионный состав нуклеоплазмы посредством избирательной перекачки ионов натрия и калия .

Ионный состав нуклеоплазмы имеет решающее значение для поддержания гомеостаза внутри клетки и организма в целом. Ионы, которые были зарегистрированы в нуклеоплазме, включают натрий , калий , кальций , фосфор и магний . Эти ионы играют ключевую роль в различных биологических функциях. Натрий и калий играют ключевую роль в натрий-калиевом насосе , трансмембранной АТФазе , которая выкачивает три иона натрия из клетки на каждые два иона калия, которые она закачивает в клетку, создавая ионный градиент. [16] Хотя этот насос обычно считается белком плазматической мембраны , его присутствие было зафиксировано в ядерной оболочке, контролируя ионный градиент между цитоплазмой и нуклеоплазмой клетки и способствуя гомеостазу кальция внутри клетки. [17] Эти ионы также определяют градиент концентрации, который существует между цитоплазмой и нуклеоплазмой, служа для управления потоком ионов через ядерную оболочку. [18] Они важны для поддержания осмолярности нуклеоплазмы, что, в свою очередь, обеспечивает структурную целостность ядерной оболочки, а также органелл, взвешенных в плотной нуклеоплазме.

Сходство с цитоплазмой

Нуклеоплазма очень похожа на цитоплазму, с основным отличием в том, что нуклеоплазма находится внутри ядра, в то время как цитоплазма находится внутри клетки, снаружи ядра. Их ионный состав почти идентичен из-за ионных насосов и проницаемости ядерной оболочки, однако белки в этих двух жидкостях сильно различаются. Белки в цитоплазме называются цитозольными белками, которые производятся свободными рибосомами , в то время как белки, которые локализуются в нуклеоплазме, должны пройти процессинг в эндоплазматическом ретикулуме и аппарате Гольджи, прежде чем быть доставленными в нуклеоплазму в рамках секреторного пути . Эти белки также различаются по функциям, поскольку белки, которые локализуются в нуклеоплазме, в значительной степени участвуют в ДНК-зависимых процессах, включая деление клеток и регуляцию генов, в то время как цитозольные белки в основном участвуют в модификации белков, деградации мРНК, метаболических процессах, передаче сигналов и гибели клеток. [19]

Цитоплазма и нуклеоплазма представляют собой высокостуденистые структуры, окруженные мембранными структурами — плазматической мембраной и ядерной оболочкой соответственно. Однако, в то время как цитоплазма заключена в одну липидную бислойную мембрану, ядерная оболочка, которая разделяет нуклеоплазму, состоит из двух отдельных липидных бислоев — внешней мембраны и внутренней мембраны. [20] Цитоплазма также обнаружена во всех известных клетках, в то время как нуклеоплазма обнаружена только в эукариотических клетках, поскольку прокариотические клетки не имеют четко определенного ядра и связанных с мембраной органелл. Кроме того, во время деления клетки цитоплазма делится во время цитокинеза , в то время как нуклеоплазма высвобождается с растворением ядерной оболочки, заполняясь только после реформирования ядерной оболочки.

Органеллы и другие структуры внутри цитоплазмы и нуклеоплазмы организованы белковыми нитями в соответствующих им отсеках. Цитоплазма содержит цитоскелет, сеть белковых нитей, обнаруженную во всех клетках, в то время как нуклеоплазма, как полагают, содержит ядерный матрикс, гипотетически аналогичную сеть нитей, которая организует органеллы и генетическую информацию внутри ядра. Хотя структура и функция цитоскелета были хорошо документированы, точная функция и даже наличие ядерного матрикса оспариваются. [21] Хотя точный состав ядерного матрикса не был подтвержден, промежуточные филаменты типа V , известные как ядерные ламины, были задокументированы в нуклеоплазме, функционируя в структурной поддержке ядра, а также в регуляции репликации ДНК, транскрипции и организации хроматина. [22] Цитоплазматический поток , круговой поток цитоплазмы, управляемый цитоскелетом, был хорошо задокументирован в цитоплазме, способствуя внутриклеточному транспорту, но этот процесс не был задокументирован в нуклеоплазме.

Ссылки

  1. ^ "кариоплазма". Collins English Dictionary . Получено 2 декабря 2022 г.
  2. ^ abcdefgh "Человеческая клетка в нуклеоплазме". Атлас белков человека .
  3. ^ "кариолимфа". Collins English Dictionary . Получено 2 декабря 2022 г.
  4. ^ Кюн, Т; Ихалайнен, ТО; Хивалуома, Дж.; Дросс, Н; Уиллман, Сан-Франциско; Ланговски, Дж; Вихинен-Ранта, М; Тимонен, Дж (2011). «Диффузия белков в цитоплазме клеток млекопитающих». ПЛОС ОДИН . 6 (8): e22962. дои : 10.1371/journal.pone.0022962 . ПМК 3158749 . ПМИД  21886771. 
  5. ^ Харрис Х (1999). Рождение клетки . Нью-Хейвен: Издательство Йельского университета. ISBN 978-0-300-07384-3.
  6. ^ Браун Р. (1866). «Об органах и способах оплодотворения Orchidex и Asclepiadea». Разные ботанические труды I : 511–514.
  7. ^ "Страсбургер, Эдуард Адольф". Универсиум . 2010 . Проверено 31 октября 2022 г.
  8. ^ ab Kalverda, Bernike; Pickersgill, Helen; Shloma, Victor V.; Fornerod, Maarten (2010). «Нуклеопорины напрямую стимулируют экспрессию генов развития и клеточного цикла внутри нуклеоплазмы». Cell . 140 (3): 306–383. doi : 10.1016/j.cell.2010.01.011 . PMID  20144760. S2CID  17260209.
  9. ^ abcd Хан, Асмат Улла; Цюй, Ронгмей; Оуян, Джун; Дай, Цзинсин (2020-04-03). «Роль нуклеопоринов и транспортных рецепторов в дифференцировке клеток». Frontiers in Physiology . 11 : 239. doi : 10.3389/fphys.2020.00239 . PMC 7145948. PMID  32308628 . 
  10. ^ Хед, Грир (6 октября 2022 г.). «Что такое нуклеоплазма?». wisegeek . Получено 28 октября 2022 г. .
  11. ^ Casem, Merri Lynn (2016). Исследования случаев в клеточной биологии . Elsevier. стр. 73–103. ISBN 978-0-12-801394-6.
  12. ^ Stein; Thrall, CL (1973). «Доказательства присутствия негистоновых хромосомных белков в нуклеоплазме клеток HeLa S3». FEBS Letters . 32 (1): 41–45. doi : 10.1016/0014-5793(73)80732-X . PMID  4715686. S2CID  20285491.
  13. ^ Houtkooper; Cantó, C.; Wanders, RJ; Auwerx, J. (2010). «Тайная жизнь NAD+: старый метаболит, контролирующий новые метаболические сигнальные пути». Endocrine Reviews . 31 (2): 194–223. doi :10.1210/er.2009-0026. PMC 2852209 . PMID  20007326. 
  14. ^ Israelsen; Vander Heiden, MG (2015). «Пируваткиназа: функция, регуляция и роль при раке». Семинары по клеточной и эволюционной биологии . 43 : 43–51. doi :10.1016/j.semcdb.2015.08.004. PMC 4662905. PMID  26277545 . 
  15. ^ Falcón; Chen, S.; Wood, MS; Aris, JP (2010). «Ацетил-коэнзим А синтетаза 2 — это ядерный белок, необходимый для репликативной долговечности Saccharomyces cerevisiae». Молекулярная и клеточная биохимия . 333 (1–2): 99–108. doi :10.1007/s11010-009-0209-z. PMC 3618671. PMID  19618123 . 
  16. ^ Гудселл, Дэвид (октябрь 2009 г.). «Молекула месяца: натрий-калиевый насос». PDB-101 . doi :10.2210/rcsb_pdb/mom_2009_10 . Получено 30 октября 2022 г. .
  17. ^ Гальва, Чарита; Артигас, Пабло; Гатто, Крейг (декабрь 2012 г.). «Ядерная Na+/K+-АТФаза играет активную роль в нуклеоплазматическом гомеостазе Ca2+». Журнал клеточной науки . 125 (24): 6137–6147. дои : 10.1242/jcs.114959. ПМЦ 3585523 . ПМИД  23077175. 
  18. ^ Wu, Yufei; Pegoraro, Adrian; Weitz, David; Janmey, Paul; Sun, Sean (февраль 2022 г.). «Корреляция между размером клетки и ядра объясняется моделью роста эукариотических клеток». PLOS Computational Biology . 18 (2): e1009400. doi : 10.1371/journal.pcbi.1009400 . PMC 8893647. PMID  35180215 . 
  19. ^ "Человеческая клетка в цитоплазме". Атлас белков человека .
  20. ^ "Ядерная мембрана". Национальный институт исследований генома человека .
  21. ^ Педерсон, Тору (март 2000 г.). «Полвека «Ядерной матрицы»». Молекулярная биология клетки . 11 (3): 799–805. doi : 10.1091/mbc.11.3.799. PMC 14811. PMID  10712500. 
  22. ^ Дечат, Томас; Адам, Стивен А.; Таймень, Пекка; Шими, Такеши; Голдман, Роберт Д. (ноябрь 2010 г.). «Ядерные ламины». Cold Spring Harbor Perspectives in Biology . 2 (11): a000547. doi :10.1101/cshperspect.a000547. PMC 2964183. PMID  20826548 .