Сезон 2005–06 стал 103-м в истории Южной лиги — английского футбольного турнира, в котором участвуют полупрофессиональные и любительские клубы из Юго-Запада, Южного Центра, Мидлендса Англии и Южного Уэльса .
В конце сезона Восточный и Западный дивизионы были реструктурированы после того, как единый Дивизион Один Истмийской лиги был разделен на Дивизион Один Север и Дивизион Один Юг, в то время как большое количество клубов ушло в Истмийскую лигу. На следующий сезон региональные дивизионы были переименованы в Дивизион Один Мидлендс и Дивизион Один Юг и Запад.
В Премьер-дивизион вошло 22 клуба, включая 16 клубов прошлого сезона и шесть новых клубов:
Salisbury City выиграл дивизион и был повышен до конференции вместе с победителем плей-офф Bedford Town, оба клуба сделали это впервые в своей истории. Aylesbury United, Chesham United и Evesham United были переведены в первый дивизион.
Восточный дивизион состоял из 22 клубов, включая 15 клубов прошлого сезона и семь новых клубов:
Boreham Wood выиграл дивизион и вернулся в Премьер-дивизион Истмийской лиги после вылета в 2003 году. Занявшие второе место Corby Town и победители плей-офф Stamford перешли в Премьер-дивизион. В конце сезона единый Первый дивизион Истмийской лиги был разделен на Первый дивизион Север и Первый дивизион Юг. Пятнадцать клубов Восточного дивизиона покинули Южную лигу и присоединились к новым дивизионам, в то время как Восточный и Западный дивизионы были переименованы в Первый дивизион Мидлендс и Первый дивизион Юг и Запад.
* после дополнительного времени
Западный дивизион состоял из 22 клубов, включая 15 клубов прошлого сезона и семь новых клубов:
Clevedon Town выиграл титул и был повышен до Премьер-дивизиона вместе с победителями плей-офф Hemel Hempstead Town, вернувшимися после вылета в 2004 году. Занявшие второе место Ashford Town были повышены и переведены в Премьер-дивизион Истмийской лиги. Thame United занял последнее место и был единственным клубом Южной лиги, вылетевшим из лиги. Оставшиеся клубы были разделены между недавно сформированными Division One Midlands и Division One South & West.