stringtranslate.com

Полимерная основа

Определение ИЮПАК основной цепи (основной цепи) в химии полимеров

В науке о полимерах полимерная цепь или просто основная цепь полимера является основной цепью полимера. Полимеры часто классифицируют по элементам в основных цепях. Характер основной цепи, т.е. ее гибкость, определяет свойства полимера (например, температуру стеклования ). Например, в полисилоксанах (силиконе) основная цепь очень гибкая, что приводит к очень низкой температуре стеклования - -123 ° C (-189 ° F; 150 К). [1] Полимеры с жесткой основой склонны к кристаллизации (например, политиофены ) в тонких пленках и растворах . Кристаллизация, в свою очередь, влияет на оптические свойства полимеров, их оптическую запрещенную зону и электронные уровни. [2]

Органические полимеры

Образование полистирола, полимера с органической основой.

Обычные синтетические полимеры имеют основные цепи, состоящие из углерода, т.е. CCCC... Примеры включают полиолефины , такие как полиэтилен ((CH 2 CH 2 ) n ) и множество замещенных производных ((CH 2 CH(R)) n ), таких как полистирол ( R = C 6 H 5 ), полипропилен (R = CH 3 ) и акрилаты (R = CO 2 R').

Другими основными классами органических полимеров являются полиэфиры и полиамиды . В их основной цепи помимо углеродных цепей имеются соответственно группы -C(O)-O- и -C(O)-NH-. Основными коммерческими продуктами являются полиэтилентерефталат («ПЭТ») ((C 6 H 4 CO 2 C 2 H 4 OC(O)) n ) и нейлон-6 ((NH(CH 2 ) 5 C(O)) n ).

Неорганические полимеры

Полидиметилсилоксан классифицируется как « неорганический полимер », поскольку в его основной цепи отсутствует углерод.

Силоксаны являются ярким примером неорганического полимера, хотя они имеют большое количество органических заместителей. Их основная связь состоит из чередующихся атомов кремния и кислорода, т. е. Si-O-Si-O... Атомы кремния несут два заместителя, обычно метил, как в случае полидиметилсилоксана . Некоторые необычные, но показательные неорганические полимеры включают политиазил ((SN)x) с чередующимися атомами S и N и полифосфаты ((PO 3 - ) n ).

Биополимеры

Основными семействами биополимеров являются полисахариды (углеводы), пептиды и полинуклеотиды . Известно множество вариантов каждого. [3]

Белки и пептиды

Белки характеризуются амидными связями (-N(H)-C(O)-), образующимися при конденсации аминокислот . Последовательность аминокислот в основной цепи полипептида известна как первичная структура белка. Как и почти все полимеры, белок сворачивается и скручивается, образуя вторичную структуру , которая становится жесткой за счет водородных связей между карбонильными атомами кислорода и амидными атомами водорода в основной цепи, т.е. C=O---HN. Дальнейшие взаимодействия между остатками отдельных аминокислот формируют третичную структуру белка . По этой причине первичная структура аминокислот в основной цепи полипептида представляет собой карту окончательной структуры белка и, следовательно, указывает на его биологическую функцию. [4] [3] Пространственные положения атомов основной цепи можно реконструировать по положениям альфа-углеродов с использованием вычислительных инструментов для реконструкции основной цепи. [5]

Упрощенный пример конденсации, показывающий альфа- и бета- классификацию. Глюкоза и фруктоза образуют сахарозу . Синтез гликогена в организме осуществляется ферментом гликогенсинтазой , который использует уходящую группу уридиндифосфата (UDP).

Углеводы

Углеводы возникают в результате конденсации моносахаридов , таких как глюкоза . Полимеры можно разделить на олигосахариды (до 10 остатков) и полисахариды (до примерно 50 000 остатков). Основная цепь характеризуется эфирной связью между отдельными моносахаридами. Эта связь называется гликозидной связью . [6] Эти основные цепи могут быть неразветвленными (содержащими одну линейную цепь) или разветвленными (содержащими несколько цепей). Гликозидные связи обозначаются как альфа или бета в зависимости от относительной стереохимии аномерного ( или наиболее окисленного ) углерода. В проекции Фишера , если гликозидная связь находится на той же стороне или стороне, что и углерод 6 обычного биологического сахарида, углевод обозначается как бета , а если связь находится на противоположной стороне, он обозначается как альфа . В традиционной проекции « структуры стула », если связь находится в той же плоскости (экваториальной или аксиальной), что и углерод 6, она обозначается как бета , а в противоположной плоскости — как альфа . Примером этого является сахароза (столовый сахар), которая содержит альфа- связь с глюкозой и бета-связь с фруктозой . Как правило, углеводы, которые расщепляет наш организм, являются альфа -связанными (пример: гликоген) , а те, которые выполняют структурную функцию, являются бета -связанными (например, целлюлоза ). [3] [7]

Нуклеиновые кислоты

Конденсация аденина и гуанина образует фосфодиэфирную связь , трифосфорилированная рибоза входящего нуклеотида атакуется 3'- гидроксилом полимера, высвобождая пирофосфат .

Дезоксирибонуклеиновая кислота (ДНК) и рибонуклеиновая кислота (РНК) являются основными примерами полинуклеотидов . Они возникают путем конденсации нуклеотидов. Их основные цепи образуются в результате конденсации гидроксильной группы рибозы с фосфатной группой другой рибозы. Эта связь называется фосфодиэфирной связью . Конденсация катализируется ферментами , называемыми полимеразами . ДНК и РНК могут иметь длину в миллионы нуклеотидов, что обеспечивает генетическое разнообразие жизни. Основания отходят от основной цепи пентозофосфатного полимера и попарно связаны водородными связями со своими комплементарными партнерами (A с T и G с C). Это создает двойную спираль с пентозофосфатными остовами с обеих сторон, образуя таким образом вторичную структуру . [8] [3] [9]

Рекомендации

  1. ^ «Полимеры». Архивировано из оригинала 2 октября 2015 г. Проверено 17 сентября 2015 г.
  2. ^ Брабец, CJ; Уиндер, К.; Шарбер, MC; Сарычифтчи, SN ; Хуммелен, Дж. К.; Свенссон, М.; Андерссон, MR (2001). «Влияние беспорядка на фотоиндуцированные возбуждения в фенилзамещенных политиофенах» (PDF) . Журнал химической физики . 115 (15): 7235. Бибкод : 2001JChPh.115.7235B. дои : 10.1063/1.1404984.
  3. ^ abcd Voet, Дональд; Воэт, Джудит Г.; Пратт, Шарлотта В. (2016). Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (5-е изд.). Уайли. ISBN 978-1-118-91840-1.В
  4. ^ Берг Дж. М., Тимочко Дж. Л., Страйер Л. (2002). «3.2 Первичная структура: аминокислоты связаны пептидными связями с образованием полипептидных цепей». Биохимия (5-е изд.). У. Х. Фриман. ISBN 0-7167-3051-0. НБК22364.
  5. ^ Бадачевска-Давид, Александра Э.; Колинский, Анджей; Кмичик, Себастьян (2020). «Вычислительная реконструкция атомистических белковых структур на основе крупнозернистых моделей». Журнал вычислительной и структурной биотехнологии . 18 : 162–176. дои : 10.1016/j.csbj.2019.12.007. ISSN  2001-0370. ПМК 6961067 . ПМИД  31969975. 
  6. ^ Бускьяццо, Алехандро (2004). «Кристаллическая структура гликогенсинтазы: гомологичные ферменты катализируют синтез и деградацию гликогена». Журнал ЭМБО . 23 (16): 3196–3205. дои : 10.1038/sj.emboj.7600324. ПМК 514502 . ПМИД  15272305. 
  7. ^ Бертоцци CR, Рабука Д (2009). «Структурная основа разнообразия гликанов». В Варки А., Каммингс Р.Д., Эско Дж.Д. и др. (ред.). Основы гликобиологии (2-е изд.). Лабораторный пресс Колд-Спринг-Харбор. ISBN 9780879697709. ПМИД  20301274.
  8. ^ Альбертс Б., Джонсон А., Льюис Дж. и др. (2002). «Механизмы репликации ДНК». Молекулярная биология клетки (4-е изд.). Гирляндная наука. ISBN 0-8153-3218-1. НБК26850.
  9. ^ Лодиш Х., Берк А., Зипурски С.Л. и др. (2000). «4.1. Структура нуклеиновых кислот». Молекулярно-клеточная биология (4-е изд.). У. Х. Фриман. ISBN 0-7167-3136-3. НБК21514.

Смотрите также