Первичные пищевые группы — группы организмов , разделенные по способу питания по источникам энергии и углерода, необходимым для жизни, роста и размножения. Источниками энергии могут быть свет или химические соединения; источники углерода могут быть органического или неорганического происхождения. [1]
Термины аэробное дыхание , анаэробное дыхание и ферментация ( фосфорилирование на уровне субстрата ) не относятся к первичным группам питания, а просто отражают различное использование возможных акцепторов электронов в конкретных организмах, таких как О 2 при аэробном дыхании или нитрат ( NO−
3), сульфат ( SO2−
4) или фумарат при анаэробном дыхании, или различные промежуточные продукты метаболизма при брожении.
Фототрофы поглощают свет фоторецепторами и преобразуют его в химическую энергию.
Хемотрофы выделяют химическую энергию.
Освобожденная энергия сохраняется в виде потенциальной энергии в АТФ , углеводах или белках . В конце концов, энергия используется для жизненных процессов, таких как движение, рост и размножение.
Растения и некоторые бактерии могут чередовать фототрофию и хемотрофию в зависимости от наличия света.
Органотрофы используют органические соединения в качестве доноров электронов и водорода .
Литотрофы используют неорганические соединения в качестве доноров электронов/водорода.
Электроны или атомы водорода от восстанавливающих эквивалентов (доноров электронов) необходимы как фототрофам, так и хемотрофам в окислительно-восстановительных реакциях , передающих энергию в анаболических процессах синтеза АТФ (у гетеротрофов) или биосинтеза (у автотрофов). Доноры электронов или водорода поглощаются из окружающей среды.
Органотрофные организмы часто также являются гетеротрофными, используя органические соединения в качестве источников как электронов, так и углерода. Точно так же литотрофные организмы часто также являются автотрофами, используя неорганические источники электронов и CO 2 в качестве неорганического источника углерода.
Некоторые литотрофные бактерии могут использовать различные источники электронов в зависимости от наличия возможных доноров.
Здесь не учитываются органические или неорганические вещества (например, кислород), используемые в качестве акцепторов электронов, необходимых в катаболических процессах аэробного или анаэробного дыхания и ферментации .
Например, растения являются литотрофами, поскольку они используют воду в качестве донора электронов для цепи переноса электронов через тилакоидную мембрану. Животные являются органотрофами, поскольку используют органические соединения в качестве доноров электронов для синтеза АТФ (растения тоже делают это, но это не учитывается). Оба используют кислород при дыхании в качестве акцептора электронов, но этот признак не используется для определения их как литотрофов.
Гетеротрофы метаболизируют органические соединения с получением углерода для роста и развития.
Автотрофы используют углекислый газ (CO 2 ) в качестве источника углерода.
Хемоорганогетеротрофный организм — это организм , которому для получения углерода для роста и развития необходимы органические субстраты , а энергию он получает за счет разложения органических соединений. Эту группу организмов можно подразделить в зависимости от того, какой органический субстрат и соединение они используют. Разрушители являются примерами хемоорганогетеротрофов, которые получают углерод и электроны или водород из мертвого органического вещества. Травоядные и плотоядные животные являются примерами организмов, которые получают углерод и электроны или водород из живого органического вещества.
Хемоорганотрофы — это организмы , которые используют химическую энергию органических соединений в качестве источника энергии и получают электроны или водород из органических соединений, включая сахара (т.е. глюкозу ), жиры и белки. [2] Хемогетеротрофы также получают атомы углерода, необходимые им для клеточной функции, из этих органических соединений.
Все животные являются хемогетеротрофами (то есть они окисляют химические соединения в качестве источника энергии и углерода), как и грибы , простейшие и некоторые бактерии . Важным отличием этой группы является то, что хемоорганотрофы окисляют только органические соединения, тогда как хемолитотрофы вместо этого используют окисление неорганических соединений в качестве источника энергии. [3]
В следующей таблице приведены некоторые примеры для каждой пищевой группы: [4] [5] [6] [7]
*Некоторые авторы используют -гидро-, когда источником является вода.
Общая заключительная часть - троф происходит от древнегреческого τροφή трофḗ «питание».
Некоторые, обычно одноклеточные, организмы могут переключаться между различными режимами метаболизма, например между фотоавтотрофией, фотогетеротрофией и хемогетеротрофией у Chroococcales . [13] Rhodopseudomonas palustris – еще один пример – может расти с кислородом или без него , используя для получения энергии свет, неорганические или органические соединения. [14] Такие миксотрофные организмы могут доминировать в своей среде обитания из-за их способности использовать больше ресурсов, чем фотоавтотрофные или органогетеротрофные организмы. [15]
В природе могут существовать всевозможные комбинации, но некоторые из них встречаются чаще других. Например, большинство растений являются фотолитоавтотрофами , поскольку используют свет в качестве источника энергии, воду в качестве донора электронов и CO 2 в качестве источника углерода. Все животные и грибы хемоорганогетеротрофны , поскольку используют органические вещества как в качестве источников химической энергии, так и в качестве доноров электронов/водорода и источников углерода. Однако некоторые эукариотические микроорганизмы не ограничиваются одним способом питания. Например, некоторые водоросли на свету живут фотоавтотрофно, а в темноте переходят к хемоорганогетеротрофии. Даже высшие растения сохраняли ночью способность гетеротрофно дышать за счет крахмала, который днем синтезировался фототрофно.
Прокариоты демонстрируют большое разнообразие категорий питания . [16] Например, цианобактерии и многие пурпурные серные бактерии могут быть фотолитоавтотрофными , используя свет в качестве энергии, H 2 O или сульфид в качестве доноров электронов/водорода и CO 2 в качестве источника углерода, тогда как зеленые несерные бактерии могут быть фотоорганогетеротрофными , используя органические молекулы как доноры электронов/водорода и источники углерода. [8] [16] Многие бактерии являются хемоорганогетеротрофами , используя органические молекулы в качестве источников энергии, электронов/водорода и углерода. [8] Некоторые бактерии ограничены только одной пищевой группой, тогда как другие являются факультативными и переключаются с одного режима на другой в зависимости от доступных источников питательных веществ. [16] Сероокисляющие , железо- и анаммокс- бактерии, а также метаногены являются хемолитоавтотрофами , использующими неорганическую энергию, источники электронов и углерода. Хемолитогетеротрофы встречаются редко, поскольку гетеротрофия предполагает наличие органических субстратов, которые также могут служить легкими источниками электронов, что делает литотрофию ненужной. Фотоорганоавтотрофы встречаются редко, поскольку их органический источник электронов/водородов может стать легким источником углерода, что приводит к гетеротрофии.
Усилия синтетической биологии позволили преобразовать трофический режим двух модельных микроорганизмов от гетеротрофии к хемоорганоавтотрофии:
Таблица 1: Определения метаболических стратегий для получения углерода и энергии.