Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
Щелочная фосфатаза плацентарного типа, также известная как плацентарная щелочная фосфатаза ( PLAP ), является аллостерическим ферментом , который у человека кодируется геном ALPP . [5] [6] [7]
Ген
Существует по крайней мере четыре различных, но родственных щелочных фосфатазы: кишечная ( ALPI ), плацентарная (этот фермент), плацентарно-подобная ( ALPPL2 ) и печеночно-костно-почечная ( ALPL ) (тканеспецифическая). Первые три расположены вместе на хромосоме 2, тогда как тканеспецифическая форма расположена на хромосоме 1. Кодирующая последовательность для этой формы щелочной фосфатазы уникальна тем, что 3'-нетранслируемая область содержит несколько копий повтора семейства Alu. Кроме того, этот ген является полиморфным, и три общих аллеля (тип 1, тип 2 и тип 3) для этой формы щелочной фосфатазы были хорошо охарактеризованы. [7]
Функция
Щелочная фосфатаза плацентарного типа представляет собой связанный с мембраной гликозилированный димерный фермент, также называемый термостабильной формой, которая экспрессируется в основном в плаценте, хотя она тесно связана с кишечной формой фермента, а также с плацентарноподобной формой. [7]
Клиническое значение
PLAP является опухолевым маркером, особенно при семиноме [8] [9] [10] и раке яичников (например, дисгерминоме ). [11] PLAP надежен только у некурящих, так как курение мешает измерению PLAP, [12] поскольку сывороточные концентрации PLAP увеличиваются до 10 раз у курильщиков, и поэтому его измерение имеет небольшую ценность в этой группе. [13]
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000163283 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000079440 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Kam W, Clauser E, Kim YS, Kan YW, Rutter WJ (февраль 1986 г.). «Клонирование, секвенирование и хромосомная локализация человеческой терминальной плацентарной щелочной фосфатазы кДНК». Proc Natl Acad Sci USA . 82 (24): 8715–9. doi : 10.1073/pnas.82.24.8715 . PMC 391507. PMID 3001717 .
- ^ Henthorn PS, Knoll BJ, Raducha M, Rothblum KN, Slaughter C, Weiss M, Lafferty MA, Fischer T, Harris H (сентябрь 1986 г.). «Продукты двух общих аллелей в локусе человеческой плацентарной щелочной фосфатазы отличаются семью аминокислотами». Proc Natl Acad Sci USA . 83 (15): 5597–601. Bibcode :1986PNAS...83.5597H. doi : 10.1073/pnas.83.15.5597 . PMC 386335 . PMID 3461452.
- ^ abc "Ген Энтреза: щелочная фосфатаза ALPP, плацентарная (изофермент Регана)".
- ^ "Европейская группа по опухолевым маркерам. Европейская экспертная группа по опухолевым маркерам. Рак зародышевых клеток". Архивировано из оригинала 2012-04-26.
- ^ W. Albrecht; et al. (2004). «Маркеры яичек: краеугольные камни в лечении злокачественных опухолей зародышевых клеток» (PDF) . J Lab Med . 28 (2): 109–115. doi :10.1515/labmed.2004.018. S2CID 53781946. Архивировано из оригинала (PDF) 24.01.2011.
- ^ Sturgeon C (август 2002 г.). «Практические рекомендации по использованию опухолевых маркеров в клинике». Clin. Chem . 48 (8): 1151–9. doi : 10.1093/clinchem/48.8.1151 . PMID 12142367.
- ^ Fishman WH (декабрь 1987 г.). «Клиническое и биологическое значение изоферментного маркера опухоли — PLAP». Clin. Biochem . 20 (6): 387–92. doi :10.1016/0009-9120(87)90003-8. PMID 3325192.
- ^ Schmoll HJ, Souchon R, Krege S, et al. (сентябрь 2004 г.). «Европейский консенсус по диагностике и лечению рака зародышевых клеток: отчет Европейской консенсусной группы по раку зародышевых клеток (EGCCCG)». Annals of Oncology . 15 (9): 1377–99. doi :10.1093/annonc/mdh301. PMID 15319245.
- ^ "Опухолевые маркеры при раке яичек" (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 2010-11-12.
Дальнейшее чтение
- Nye KE, Riley GA, Pinching AJ (1992). «Дефект, наблюдаемый в пути гидролиза фосфатидилинозитола в ВИЧ-инфицированных лимфоцитах и лимфобластоидных клетках, обусловлен ингибированием инозитол 1,4,5-трифосфат 1,3,4,5-тетракисфосфат 5-фосфомоноэстеразы». Clin. Exp. Immunol . 89 (1): 89–93. doi :10.1111/j.1365-2249.1992.tb06883.x. PMC 1554388. PMID 1321014 .
- Lowe ME (1992). «Сайт-специфические мутации в COOH-конце плацентарной щелочной фосфатазы: замена одной аминокислоты превращает белок, закрепленный на фосфатидилинозитол-гликане, в секретируемый белок». J. Cell Biol . 116 (3): 799–807. doi :10.1083/jcb.116.3.799. PMC 2289307. PMID 1730777 .
- Micanovic R, Gerber LD, Berger J, Kodukula K, Udenfriend S (1990). "Селективность сайта расщепления/присоединения мембранных белков, закрепленных на фосфатидилинозитол-гликане, определенная сайт-специфическим мутагенезом в Asp-484 плацентарной щелочной фосфатазы". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 87 (1): 157–61. Bibcode :1990PNAS...87..157M. doi : 10.1073/pnas.87.1.157 . PMC 53219 . PMID 2153284.
- Martin D, Spurr NK, Trowsdale J (1988). "RFLP гена щелочной фосфатазы плаценты человека (PLAP)". Nucleic Acids Res . 15 (21): 9104. doi :10.1093/nar/15.21.9104. PMC 306450. PMID 2891112 .
- Knoll BJ, Rothblum KN, Longley M (1988). "Нуклеотидная последовательность гена щелочной фосфатазы плаценты человека. Эволюция 5'-фланкирующей области путем делеции/замены". J. Biol. Chem . 263 (24): 12020–7. doi : 10.1016/S0021-9258(18)37887-6 . PMID 3042787.
- Micanovic R, Bailey CA, Brink L, Gerber L, Pan YC, Hulmes JD, Udenfriend S (1988). «Аспарагиновая кислота-484 формирующейся плацентарной щелочной фосфатазы конденсируется с фосфатидилинозитолгликаном, становясь карбоксильным концом зрелого фермента». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 85 (5): 1398–402. Bibcode :1988PNAS...85.1398M. doi : 10.1073/pnas.85.5.1398 . PMC 279778 . PMID 3422741.
- Knoll BJ, Rothblum KN, Longley M (1988). "Два события дупликации генов в эволюции человеческих термостабильных щелочных фосфатаз". Gene . 60 (2–3): 267–76. doi :10.1016/0378-1119(87)90235-6. PMID 3443302.
- Ovitt CE, Strauss AW, Alpers DH, Chou JY, Boime I (1986). «Экспрессия мРНК щелочной фосфатазы плаценты разного размера в клетках плаценты и хориокарциномы». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 83 (11): 3781–5. Bibcode : 1986PNAS...83.3781O. doi : 10.1073/pnas.83.11.3781 . PMC 323607. PMID 3459156 .
- Millán JL (1986). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности человеческой плацентарной щелочной фосфатазы». J. Biol. Chem . 261 (7): 3112–5. doi : 10.1016/S0021-9258(17)35755-1 . PMID 3512548.
- Ezra E, Blacher R, Udenfriend S (1984). «Очистка и частичное секвенирование человеческой плацентарной щелочной фосфатазы». Biochem. Biophys. Res. Commun . 116 (3): 1076–83. doi :10.1016/S0006-291X(83)80252-6. PMID 6651840.
- Le Du MH, Stigbrand T, Taussig MJ, Menez A, Stura EA (2001). «Кристаллическая структура щелочной фосфатазы из плаценты человека при разрешении 1,8 А. Значение для субстратной специфичности». J. Biol. Chem . 276 (12): 9158–65. doi : 10.1074/jbc.M009250200 . PMID 11124260.
- Spurway TD, Dalley JA, High S, Bulleid NJ (2001). «Ранние события в присоединении гликозилфосфатидилинозитольного якоря. Субстратные белки ассоциируются с трансамидазной субъединицей gpi8p». J. Biol. Chem . 276 (19): 15975–82. doi : 10.1074/jbc.M010128200 . PMID 11278620.
- Rump A, Kasper G, Hayes C, Wen G, Starke H, Liehr T, Lehmann R, Lagemann D, Rosenthal A (2001). «Сложное расположение генов в области 220 кб двойной дупликации ДНК на человеческом 2q37.1». Genomics . 73 (1): 50–5. doi :10.1006/geno.2000.6504. PMID 11352565.
- Wennberg C, Kozlenkov A, Di Mauro S, Fröhlander N, Beckman L, Hoylaerts MF, Millán JL (2002). «Структура, геномное ДНК-типирование и кинетическая характеристика аллозима D плацентарной щелочной фосфатазы (PLAP/ALPP)». Hum. Mutat . 19 (3): 258–67. doi :10.1002/humu.10052. PMID 11857742. S2CID 44666573.
- Kozlenkov A, Manes T, Hoylaerts MF, Millán JL (2002). «Присвоение функций консервативным остаткам в щелочных фосфатазах млекопитающих». J. Biol. Chem . 277 (25): 22992–9. doi : 10.1074/jbc.M202298200 . PMID 11937510.
- Tang J, Li W (2002). "[Методологическое исследование анализа активности гликозилфосфатидилинозитол-специфической фосфолипазы D в сыворотке]". Hunan Yi Ke da Xue Xue Bao . 24 (2): 119–22. PMID 11938765.
- Lehto MT, Sharom FJ (2002). «Близость белковой части белка, закрепленного на GPI, к поверхности мембраны: исследование FRET». Биохимия . 41 (26): 8368–76. doi :10.1021/bi012038+. PMID 12081485.
- Le Du MH, Millan JL (2003). «Структурные доказательства функциональной дивергенции в щелочных фосфатазах человека». J. Biol. Chem . 277 (51): 49808–14. doi : 10.1074/jbc.M207394200 . PMID 12372831.
- Llinas P, Stura EA, Ménez A, Kiss Z, Stigbrand T, Millán JL, Le Du MH (июль 2005 г.). «Структурные исследования человеческой плацентарной щелочной фосфатазы в комплексе с функциональными лигандами». J. Mol. Biol . 350 (3): 441–51. doi :10.1016/j.jmb.2005.04.068. PMID 15946677.