PCDH15

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Протокадгерин-15 — это белок , который у людей кодируется геном PCDH15 . [ ^{5] [6] [7]}

Функция

Этот ген является членом суперсемейства кадгеринов . Члены семейства кодируют интегральные мембранные белки, которые опосредуют кальций -зависимую клеточную адгезию . Белковый продукт этого гена состоит из сигнального пептида , 11 внеклеточных кальций-связывающих доменов, трансмембранного домена и уникального цитоплазматического домена . Он играет важную роль в поддержании нормальной функции сетчатки и улитки . ^[7] Считается, что он взаимодействует с CDH23 , образуя филаменты концевой связи . ^[8]

Клиническое значение

Мутации в этом гене связаны с потерей слуха, что согласуется с его расположением в критической области синдрома Ашера типа 1F (USH1F) на хромосоме 10. ^[7] Также было обнаружено, что вариации в нем связаны с нормальными различиями во внешности человека. ^[9]

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000150275 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000052613 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Ahmed ZM, Riazuddin S, Bernstein SL, Ahmed Z, Khan S, Griffith AJ, et al. (Июль 2001 г.). «Мутации гена протокадгерина PCDH15 вызывают синдром Ашера типа 1F». American Journal of Human Genetics . 69 (1): 25–34. doi :10.1086/321277. PMC 1226045 . PMID  11398101. 
6. Ahmed ZM, Riazuddin S, Ahmad J, Bernstein SL, Guo Y, Sabar MF и др. (декабрь 2003 г.). «PCDH15 экспрессируется в нейросенсорном эпителии глаза и уха, а мутантные аллели ответственны как за USH1F, так и за DFNB23». Human Molecular Genetics . 12 (24): 3215–23. doi : 10.1093/hmg/ddg358 . PMID  14570705. S2CID  14028314.
7. "Ген Энтреза: протокадгерин 15 PCDH15".
8. Kazmierczak P, Sakaguchi H, Tokita J, Wilson-Kubalek EM, Milligan RA, Müller U, Kachar B (сентябрь 2007 г.). «Кадгерин 23 и протокадгерин 15 взаимодействуют, образуя концевые нити в сенсорных волосковых клетках». Nature . 449 (7158): 87–91. Bibcode :2007Natur.449...87K. doi :10.1038/nature06091. PMID  17805295. S2CID  4414814.
9. Crouch DJ, Winney B, Koppen WP, Christmas WJ, Hutnik K, Day T и др. (январь 2018 г.). «Генетика человеческого лица: идентификация вариантов одного гена с большим эффектом». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (4): E676–E685. Bibcode : 2018PNAS..115E.676C . doi : 10.1073/pnas.1708207114 . PMC 5789906. PMID  29301965. 

Дальнейшее чтение

• Alagramam KN, Murcia CL, Kwon HY, Pawlowski KS, Wright CG, Woychik RP (январь 2001 г.). «Мышиный мутант потери слуха Ames Waltzer вызван мутацией Pcdh15, нового гена протокадгерина». Nature Genetics . 27 (1): 99–102. doi :10.1038/83837. PMID  11138007. S2CID  32444699.
• Alagramam KN, Yuan H, Kuehn MH, Murcia CL, Wayne S, Srisailpathy CR и др. (август 2001 г.). «Мутации в новом протокадгерине PCDH15 вызывают синдром Ашера типа 1F». Human Molecular Genetics . 10 (16): 1709–18. doi : 10.1093/hmg/10.16.1709 . PMID  11487575.
• Ben-Yosef T, Ness SL, Madeo AC, Bar-Lev A, Wolfman JH, Ahmed ZM и др. (апрель 2003 г.). «Мутация PCDH15 среди евреев-ашкенази с синдромом Ашера 1-го типа». The New England Journal of Medicine . 348 (17): 1664–70. doi : 10.1056/NEJMoa021502 . PMID  12711741.
• Zheng QY, Yan D, Ouyang XM, Du LL, Yu H, Chang B и др. (январь 2005 г.). «Дигенное наследование глухоты, вызванное мутациями в генах, кодирующих кадгерин 23 и протокадгерин 15 у мышей и людей». Human Molecular Genetics . 14 (1): 103–11. doi :10.1093/hmg/ddi010. PMC  2858222 . PMID  15537665.
• Ouyang XM, Yan D, Du LL, Hejtmancik JF, Jacobson SG, Nance WE и др. (март 2005 г.). «Характеристика мутаций генов синдрома Ашера I типа в популяции пациентов с синдромом Ашера». Генетика человека . 116 (4): 292–9. doi :10.1007/s00439-004-1227-2. PMID  15660226. S2CID  22812718.
• Roux AF, Faugère V, Le Guédard S, Pallares-Ruiz N, Vielle A, Chambert S и др. (сентябрь 2006 г.). «Обзор частоты мутаций гена USH1 в когорте пациентов Usher показывает важность генов кадгерина 23 и протокадгерина 15 и устанавливает уровень обнаружения выше 90%». Journal of Medical Genetics . 43 (9): 763–8. doi :10.1136/jmg.2006.041954. PMC  2564578 . PMID  16679490.
• Zheng QY, Yu H, Washington JL, Kisley LB, Kikkawa YS, Pawlowski KS и др. (сентябрь 2006 г.). «Новая спонтанная мутация в гене мышиного протокадгерина 15». Hearing Research . 219 (1–2): 110–20. doi :10.1016/j.heares.2006.06.010. PMC  2855306 . PMID  16887306.
• Le Guédard S, Faugère V, Malcolm S, Claustres M, Roux AF (январь 2007 г.). «Крупные геномные перестройки в гене PCDH15 являются значимой причиной синдрома USH1F». Molecular Vision . 13 : 102–7. PMC  2533038 . PMID  17277737.

Внешние ссылки

• Запись GeneReviews/NCBI/NIH/UW о синдроме Ашера I типа
• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого протокадгерина-15 (PCDH15)