stringtranslate.com

Пурин

Пурингетероциклическое ароматическое органическое соединение , состоящее из двух колец ( пиримидинового и имидазольного ), соединенных вместе. Он растворим в воде . Пурин также дает свое название более широкому классу молекул , пуринов , которые включают замещенные пурины и их таутомеры . Они являются наиболее широко распространенными азотсодержащими гетероциклами в природе. [1]

Пищевые источники

Пурины в высокой концентрации содержатся в мясе и мясных продуктах, особенно во внутренних органах, таких как печень и почки . В целом, растительная диета содержит мало пуринов. [2] Растения и водоросли с высоким содержанием пуринов включают некоторые бобовые ( чечевица , соя и черноглазый горох ) и спирулину . Примерами источников с высоким содержанием пуринов являются: зобная железа , анчоусы , сардины , печень, говяжьи почки, мозги , мясные экстракты (например, Oxo , Bovril ), сельдь , скумбрия , гребешки , дичь , дрожжи ( пиво , дрожжевой экстракт , пищевые дрожжи ) и подливка . [3]

Умеренное количество пурина также содержится в красном мясе, говядине , свинине , птице , рыбе и морепродуктах , спарже , цветной капусте , шпинате , грибах , зеленом горошке , чечевице , сушеном горохе, фасоли , овсянке , пшеничных отрубях , зародышах пшеницы и боярышнике . [4]

Биохимия

Пурины и пиримидины составляют две группы азотистых оснований , включая две группы нуклеотидных оснований . Пуриновые основания - это гуанин (G) и аденин (A), которые образуют соответствующие нуклеозиды - дезоксирибонуклеозиды ( дезоксигуанозин и дезоксиаденозин ) с дезоксирибозным фрагментом и рибонуклеозиды ( гуанозин , аденозин ) с рибозным фрагментом. Эти нуклеозиды с фосфорной кислотой образуют соответствующие нуклеотиды (дезоксигуанилат, дезоксиаденилат и гуанилат, аденилат), которые являются строительными блоками ДНК и РНК соответственно. Пуриновые основания также играют важную роль во многих метаболических и сигнальных процессах в соединениях гуанозинмонофосфата (ГМФ) и аденозинмонофосфата (АМФ).

Для выполнения этих важных клеточных процессов клетке необходимы как пурины, так и пиримидины , причем в одинаковых количествах. И пурин, и пиримидин являются самоингибирующими и активирующими . Когда образуются пурины, они ингибируют ферменты , необходимые для большего образования пуринов. Это самоингибирование происходит, поскольку они также активируют ферменты, необходимые для образования пиримидинов. Пиримидин одновременно самоингибирует и активирует пурин аналогичным образом. Из-за этого в клетке всегда присутствует почти одинаковое количество обоих веществ. [5]

Характеристики

Пурин является как очень слабой кислотой ( pKa 8,93 ), так и еще более слабым основанием ( pKa 2,39 ). [6] При растворении в чистой воде pH находится посередине между этими двумя значениями pKa.

Пурин ароматичен , имеет четыре таутомера , каждый из которых имеет водородную связь с другим из четырех атомов азота. Они идентифицируются как 1-H, 3-H, 7-H и 9-H (см. изображение пронумерованного кольца). Общая кристаллическая форма благоприятствует таутомеру 7-H, тогда как в полярных растворителях преобладают как таутомеры 9-H, так и 7-H. [7] Заместители в кольцах и взаимодействия с другими молекулами могут смещать равновесие этих таутомеров. [8]

Известные пурины

Существует много встречающихся в природе пуринов. Они включают нуклеотидные основания аденин и гуанин . В ДНК эти основания образуют водородные связи с их комплементарными пиримидинами, тимином и цитозином , соответственно. Это называется комплементарным спариванием оснований. В РНК комплементом аденина является урацил вместо тимина.

Другие известные пурины — гипоксантин , ксантин , теофиллин , теобромин , кофеин , мочевая кислота и изогуанин .

Функции

Помимо решающей роли пуринов (аденина и гуанина) в ДНК и РНК, пурины также являются значимыми компонентами в ряде других важных биомолекул, таких как АТФ , ГТФ , циклический АМФ , НАДН и кофермент А. Сам пурин ( 1 ) в природе не обнаружен, но его можно получить путем органического синтеза .

Они также могут функционировать непосредственно как нейротрансмиттеры , воздействуя на пуринергические рецепторы . Аденозин активирует аденозиновые рецепторы .

История

Слово пурин ( чистая моча ) [9] было придумано немецким химиком Эмилем Фишером в 1884 году. [10] [11] Он синтезировал его впервые в 1898 году. [11] Исходным материалом для последовательности реакций была мочевая кислота ( 8 ), которая была выделена из почечных камней Карлом Вильгельмом Шееле в 1776 году. [12] Мочевая кислота реагировала с PCl 5 с образованием 2,6,8-трихлорпурина, который был преобразован с HI и PH 4 I с образованием 2,6-дииодпурина. Продукт был восстановлен до пурина с использованием цинковой пыли.

Превращение мочевой кислоты (слева) в пурин (справа) через промежуточные продукты 2,6,8-трихлорпурин и 2,6-дииодпурин

Метаболизм

У многих организмов имеются метаболические пути синтеза и расщепления пуринов.

Пурины биологически синтезируются в виде нуклеозидов (оснований, присоединенных к рибозе ).

Накопление модифицированных пуриновых нуклеотидов является дефектным для различных клеточных процессов, особенно тех, которые связаны с ДНК и РНК . Чтобы быть жизнеспособными, организмы обладают рядом дезоксипуриновых фосфогидролаз, которые гидролизуют эти пуриновые производные, удаляя их из активных пулов NTP и dNTP . Дезаминирование пуриновых оснований может привести к накоплению таких нуклеотидов, как ITP , dITP, XTP и dXTP. [13]

Дефекты ферментов, контролирующих выработку и распад пуринов, могут серьезно изменить последовательности ДНК клетки, что может объяснить, почему люди, являющиеся носителями определенных генетических вариантов ферментов метаболизма пуринов, имеют более высокий риск развития некоторых видов рака .

Биосинтез пуринов в трех сферах жизни

Организмы во всех трех доменах жизни, эукариоты , бактерии и археи , способны осуществлять биосинтез пуринов de novo . Эта способность отражает важность пуринов для жизни. Биохимический путь синтеза очень похож у эукариот и видов бактерий, но более изменчив среди видов архей. [14] Было установлено, что почти полный или полный набор генов, необходимых для биосинтеза пуринов, присутствует у 58 из 65 изученных видов архей. [14] Однако также было идентифицировано семь видов архей с полностью или почти полностью отсутствующими генами, кодирующими пурины. По-видимому, виды архей, неспособные синтезировать пурины, способны приобретать экзогенные пурины для роста [14] и, таким образом, являются аналогами пуриновых мутантов эукариот, например, пуриновых мутантов гриба-аскомицета Neurospora crassa [15] , которым также требуются экзогенные пурины для роста.

Связь с подагрой

Более высокие уровни потребления мяса и морепродуктов связаны с повышенным риском подагры , тогда как более высокий уровень потребления молочных продуктов связан с пониженным риском. Умеренное потребление овощей или белка, богатых пуринами, не связано с повышенным риском подагры. [16] Аналогичные результаты были получены с риском гиперурикемии .

Лабораторный синтез

Помимо синтеза пуринов in vivo в ходе пуринового обмена , пурины также могут быть синтезированы искусственно.

Пурин получается с хорошим выходом, если формамид нагревать в открытом сосуде при 170 °C в течение 28 часов. [17]

Эта замечательная реакция и другие подобные ей обсуждались в контексте происхождения жизни . [18]

Запатентованный 20 августа 1968 года, нынешний признанный метод промышленного производства аденина представляет собой модифицированную форму метода формамида. Этот метод нагревает формамид при температуре 120 °C в герметичной колбе в течение 5 часов для образования аденина. Реакция значительно увеличивается в количестве за счет использования оксихлорида фосфора (фосфорилхлорида) или пентахлорида фосфора в качестве кислотного катализатора и условий солнечного света или ультрафиолета. По истечении 5 часов и охлаждения раствора формамида-оксихлорида фосфора-аденина в колбу, содержащую формамид и теперь образованный аденин, наливают воду. Затем раствор вода-формамид-аденин пропускают через фильтрующую колонку с активированным углем. Молекулы воды и формамида, будучи небольшими молекулами, пройдут через уголь и попадут в колбу для отходов; Однако большие молекулы аденина будут прикрепляться или «адсорбироваться» на угле из-за сил Ван-дер-Ваальса, которые взаимодействуют между аденином и углеродом в угле. Поскольку уголь имеет большую площадь поверхности, он способен захватывать большинство молекул, которые проходят через него определенного размера (больше, чем вода и формамид). Чтобы извлечь аденин из адсорбированного углем аденина, газообразный аммиак, растворенный в воде (водная аммиак), выливают на структуру активированного угля-аденина, чтобы высвободить аденин в раствор аммиака и воды. Затем раствор, содержащий воду, аммиак и аденин, оставляют сохнуть на воздухе, при этом аденин теряет растворимость из-за потери газообразного аммиака, который ранее делал раствор основным и способным растворять аденин, тем самым заставляя его кристаллизоваться в чистый белый порошок, который можно хранить. [19]

Оро и Камат (1961) и сотрудники Оргеля (1966, 1967) показали, что четыре молекулы HCN тетрамеризуются с образованием диаминомалеодинитрила ( 12 ), который может быть преобразован почти во все встречающиеся в природе пурины. [20] [21] [22] [23] [24] Например, пять молекул HCN конденсируются в экзотермической реакции с образованием аденина , особенно в присутствии аммиака.

Синтез пурина Траубе (1900) — классическая реакция (названная в честь Вильгельма Траубе ) между аминозамещенным пиримидином и муравьиной кислотой . [25 ]

синтез пурина Траубе

Пребиотический синтез пуриновых рибонуклеозидов

Чтобы понять, как возникла жизнь , необходимо знание химических путей, которые позволяют формировать ключевые строительные блоки жизни в вероятных пребиотических условиях . Нам и др. (2018) [26] продемонстрировали прямую конденсацию пуриновых и пиримидиновых нуклеиновых оснований с рибозой с образованием рибонуклеозидов в водных микрокаплях, что является ключевым шагом, ведущим к образованию РНК. Кроме того, вероятный пребиотический процесс синтеза пуриновых рибонуклеозидов был представлен Беккером и др . в 2016 году. [27]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Rosemeyer H (март 2004 г.). «Хеморазнообразие пурина как компонента природных продуктов». Химия и биоразнообразие . 1 (3): 361–401. doi :10.1002/cbdv.200490033. PMID  17191854. S2CID  12416667.
  2. ^ "Подагра: список продуктов с высоким и низким содержанием пуринов". Dietaryfiberfood.com . 2016-04-08. Архивировано из оригинала 2011-11-12 . Получено 2016-07-16 .
  3. ^ Канеко К, Аояги Й, Фукуучи Т, Инадзава К, Ямаока Н (2014). «Общее содержание пуринов и пуриновых оснований в обычных продуктах питания для облегчения лечебного питания при подагре и гиперурикемии». Biological & Pharmaceutical Bulletin . 37 (5): 709–721. doi : 10.1248/bpb.b13-00967 . PMID  24553148.
  4. ^ "Диета при подагре: какие продукты следует избегать". Healthcastle.com . Архивировано из оригинала 2017-08-14 . Получено 2016-07-16 .
  5. ^ Guyton AC (2006). Учебник медицинской физиологии . Elsevier. стр. 37. ISBN 978-0-7216-0240-0.
  6. ^ Seela F, et al. (2014). "Hetarenes III (Six-Membered Rings and Larger Hetero-Rings with Maximum Unsaturation) — Part 2b". В Schaumann E (ред.). Houben-Weyl Methods of Organic Chemistry. Vol. E 9b/2 (4th Supplement ed.). Thieme. p. 310. ISBN 978-3-13-181504-0. Архивировано из оригинала 2022-02-17 . Получено 2020-05-15 .
  7. ^ Рачиньская Э.Д., Гал Дж.Ф., Мария П.К., Каминска Б., Игиельска М., Курпиевский Дж., Юрас В. (апрель 2020 г.). «Предпочтения таутомеров пуринов и чередование длин связей в связи с протонированием-депротонированием и катионизацией щелочных металлов». Журнал молекулярного моделирования . 26 (5): 93. doi :10.1007/s00894-020-4343-6. PMC 7256107. PMID  32248379. 
  8. ^ Stasyuk OA, Szatyłowicz H, Krygowski TM (апрель 2012 г.). «Влияние водородных связей на ароматичность пуриновых таутомеров». Журнал органической химии . 77 (8): 4035–45. doi :10.1021/jo300406r. PMID  22448684.
  9. ^ McGuigan H (1921). Введение в химическую фармакологию. P. Blakiston's Sons & Co. стр. 283. Архивировано из оригинала 16 апреля 2020 г. Получено 18 июля 2012 г.
  10. ^ Фишер Э (1884). «Ueber die Harnsäure. I». [О мочевой кислоте. Я.] (PDF) . Berichte der Deutschen Chemischen Gesellschaft . 17 : 328–338. дои : 10.1002/cber.18840170196 . Проверено 20 апреля 2016 г. Значок открытого доступа
    Из стр. 329. Архивировано 17 февраля 2022 г. в Wayback Machine : «Um eine rationelle Nomenklatur der so entstehenden zahlreichen Substanzen zu ermöglichen, betrachte ich Dieselben als Abkömmlinge der noch unbekannten Wasserstoffverbindung CH 3 .C 5 N 4 H 3 и nenne die letztere пурин». (Чтобы сделать возможной рациональную номенклатуру многочисленных существующих веществ, я рассматривал их как производные еще неизвестного водородного соединения CH 3 .C 5 N 4 H 3 и назвал последнее «метилпурином».)
  11. ^ аб Фишер Э (1898). «Ueber das Purin und seine Mmethylderivate» [О пурине и его метильных производных] (PDF) . Berichte der Deutschen Chemischen Gesellschaft . 31 (3): 2550–74. дои : 10.1002/cber.18980310304 . Проверено 20 апреля 2016 г. Значок открытого доступа
    Из стр. 2550. Архивировано 18 октября 2020 г. в Wayback Machine : «…hielt ich es für zweckmäßig, alle diese Produkte ebenso wie die Harnsäure als Derivate der sauerstofffreien Verbindung C 5 H 4 N 4 zu betrachten, und wählte für diese den Namen Purin, welcher ». aus den Wörtern purum und uricum kombiniert war». (…Все эти продукты я посчитал целесообразным рассматривать, так же, как и мочевую кислоту, как производные бескислородного соединения C 5 H 4 N 4 , и выбрал для них название «пурин», образовавшееся от [ латинские] слова purum и uricum .)
  12. ^ Шееле CW (1776). «Examen chemicum Calculi urinari» [Химическое исследование камней в почках]. Опускула . 2:73 .
  13. ^ Davies O, Mendes P, Smallbone K, Malys N (апрель 2012 г.). «Характеристика множественной субстрат-специфической (d)ITP/(d)XTPase и моделирование метаболизма дезаминированных пуриновых нуклеотидов». BMB Reports . 45 (4): 259–264. doi : 10.5483/BMBRep.2012.45.4.259 . PMID  22531138.
  14. ^ abc Браун, Энн М.; Хупес, Саманта Л.; Уайт, Роберт Х.; Сариски, Кэтрин А. (2011). «Биосинтез пуринов у архей: вариации на тему». Biology Direct . 6 : 63. doi : 10.1186/1745-6150-6-63 . PMC 3261824. PMID  22168471 . 
  15. ^ Бернстайн, Х. (1961). «Соединения имидазола, накапливаемые пуриновыми мутантами Neurospora crassa». Журнал общей микробиологии . 25 : 41–46. doi : 10.1099/00221287-25-1-41 .
  16. ^ Choi HK, Atkinson K, Karlson EW, Willett W, Curhan G (март 2004 г.). «Богатые пуринами продукты, молочные продукты и потребление белка и риск подагры у мужчин». The New England Journal of Medicine . 350 (11): 1093–1103. doi : 10.1056/NEJMoa035700 . PMID  15014182.
  17. ^ Ямада Х, Окамото Т (1972). "Одношаговый синтез пуринового кольца из формамида". Chemical & Pharmaceutical Bulletin . 20 (3): 623. doi : 10.1248/cpb.20.623 . Архивировано из оригинала 2016-05-16.
  18. ^ Saladino R, Crestini C, Ciciriello F, Costanzo G, Di Mauro E (декабрь 2006 г.). «О происхождении информационных полимеров на основе формамида: синтезы азотистых оснований и благоприятные термодинамические ниши для ранних полимеров». Origins of Life and Evolution of the Biosphere . 36 (5–6): 523–531. Bibcode :2006OLEB...36..523S. doi :10.1007/s11084-006-9053-2. PMID  17136429. S2CID  36278915.
  19. ^ [1], "Процесс приготовления аденина", опубликовано 10.11.1966.  Архивировано 26.05.2021 на Wayback Machine.
  20. ^ Sanchez RA, Ferris JP, Orgel LE (декабрь 1967 г.). «Исследования пребиотического синтеза. II. Синтез предшественников пурина и аминокислот из водного раствора цианистого водорода». Журнал молекулярной биологии . 30 (2): 223–253. doi :10.1016/S0022-2836(67)80037-8. PMID  4297187.
  21. ^ Ferris JP, Orgel LE (март 1966). «Необычная фотохимическая перегруппировка при синтезе аденина из цианистого водорода». Журнал Американского химического общества . 88 (5): 1074. doi :10.1021/ja00957a050.
  22. ^ Ferris JP, Kuder JE, Catalano AW (ноябрь 1969). «Фотохимические реакции и химическая эволюция пуринов и производных никотинамида». Science . 166 (3906): 765–6. Bibcode :1969Sci...166..765F. doi :10.1126/science.166.3906.765. PMID  4241847. S2CID  695243.
  23. ^ Oro J, Kamat SS (апрель 1961 г.). «Синтез аминокислот из цианида водорода в возможных примитивных земных условиях». Nature . 190 (4774): 442–3. Bibcode :1961Natur.190..442O. doi :10.1038/190442a0. PMID  13731262. S2CID  4219284.
  24. ^ Бауэр В. (1985). Методы органической химии Губена-Вейля . Том. E 5 (4-е приложение). Тиме Георг Верлаг. п. 1547. ИСБН 978-3-13-181154-7.
  25. ^ Хасснер А., Штумер К. (2002). Органические синтезы на основе реакций названий (2-е изд.). Elsevier. ISBN 0-08-043259-X.
  26. ^ Nam I, Nam HG, Zare RN (январь 2018 г.). «Абиотический синтез пуриновых и пиримидиновых рибонуклеозидов в водных микрокаплях». Proc Natl Acad Sci USA . 115 (1): 36–40. doi :10.1073/pnas.1718559115. PMC 5776833. PMID  29255025 . 
  27. ^ Becker S, Thoma I, Deutsch A, Gehrke T, Mayer P, Zipse H, Carell T (май 2016 г.). «Высокопродуктивный, строго региоселективный пребиотический путь образования пуриновых нуклеозидов». Science . 352 (6287): 833–6. doi :10.1126/science.aad2808. PMID  27174989.

Внешние ссылки