stringtranslate.com

Рецептор частиц распознавания сигнала

Рецептор сигнальной распознающей частицы (SRP) , также называемый стыковочным белком , представляет собой димер, состоящий из 2 различных субъединиц, которые связаны исключительно с шероховатым ЭР в клетках млекопитающих . Его основная функция заключается в идентификации единиц SRP . SRP (сигнальная распознающая частица) представляет собой молекулу , которая помогает комплексам рибосома -мРНК -полипептид располагаться на мембране эндоплазматического ретикулума .

Эукариотический рецептор SRP (называемый SR) представляет собой гетеродимер SR-альфа (70 кДа; SRPRA) и SR-бета (25 кДа; SRPRB ), оба из которых содержат домен связывания ГТФ [2], в то время как прокариотический рецептор SRP включает только мономерный, слабо связанный с мембраной гомолог SR-альфа FtsY ( P10121 ).

SRX-домен

SR-альфа регулирует нацеливание комплексов SRP-рибосома-насцентный полипептид на транслокон . [3] SR-альфа связывается с субъединицей SRP54 комплекса SRP. Субъединица SR-бета представляет собой трансмембранную ГТФазу, которая прикрепляет субъединицу SR-альфа (периферическую мембранную ГТФазу) к мембране ЭР. [4] SR-бета взаимодействует с N-концевым SRX-доменом SR-альфа, который отсутствует в бактериальном гомологе FtsY. SR-бета также функционирует в привлечении полипептида SRP-насцент в белок-проводящий канал.

Семейство SRX представляет собой эукариотических гомологов альфа-субъединицы рецептора SR. Члены этой записи состоят из центрального шестицепочечного антипараллельного бета-слоя, зажатого спиралью альфа1 с одной стороны и спиралями альфа2-альфа4 с другой. Они взаимодействуют с небольшой ГТФазой SR-бета, образуя комплекс, который соответствует классу малых комплексов G-белка-эффектора, включая Rap-Raf, Ras-PI3K(гамма), Ras-RalGDS и Arl2-PDE(дельта). [2] На C-конце SR-альфа и FtsY находится домен NG, похожий на SRP54.

домен NG

Рецептор связывается с SPR54/Ffh с помощью «домена NG», комбинации домена «N» с 4-спиральным пучком ( InterPro :  IPR013822 ) и домена GTPase «G» ( InterPro :  IPR000897 ), которые являются общими для обоих белков. Связанная структура представляет собой квазисимметричный гетеродимер, называемый комплексом нацеливания. [5]

Частица распознавания сигнала (SRP)

Частица распознавания сигнала (SRP) представляет собой мультимерный белок, который вместе со своим сопряженным рецептором (SR) участвует в нацеливании секреторных белков на мембрану шероховатого эндоплазматического ретикулума (RER) у эукариот или на плазматическую мембрану у прокариот. [6] [7] SRP распознает сигнальную последовательность зарождающегося полипептида на рибосоме, замедляет ее удлинение и стыкует комплекс SRP-рибосома-полипептид с мембраной RER через рецептор SR. SRP состоит из шести полипептидов (SRP9, SRP14, SRP19, SRP54, SRP68 и SRP72) и одной молекулы РНК 7S длиной 300 нуклеотидов. Компонент РНК катализирует взаимодействие SRP с его рецептором SR. [8] У высших эукариот комплекс SRP состоит из домена Alu и домена S, связанных РНК SRP. Домен Alu состоит из гетеродимера SRP9 и SRP14, связанного с 5' и 3' концевыми последовательностями РНК SRP. Этот домен необходим для замедления удлинения зарождающейся полипептидной цепи, что дает SRP время для стыковки комплекса рибосома-полипептид с мембраной RER.

Ссылки

  1. ^ Шварц Т., Блобель Г. (март 2003 г.). «Структурная основа функции бета-субъединицы рецептора частиц распознавания сигнала эукариот». Cell . 112 (6): 793–803. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00161-2 . PMID  12654246.
  2. ^ ab Blobel G, Schwartz T (2003). «Структурная основа функции бета-субъединицы рецептора частиц распознавания эукариотического сигнала». Cell . 112 (6): 793–803. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00161-2 . PMID  12654246.
  3. ^ Эндрюс Д. В., Легате К. Р., Фальконе Д. (2000). «Зависимое от нуклеотидов связывание домена ГТФазы бета-субъединицы рецептора частицы распознавания сигнала с альфа-субъединицей». J. Biol. Chem . 275 (35): 27439–46. doi : 10.1074/jbc.M003215200 . PMID  10859309.
  4. ^ Walter P, Miller JD, Tajima S, Lauffer L (1995). «Бета-субъединица рецептора частиц распознавания сигнала представляет собой трансмембранную ГТФазу, которая прикрепляет альфа-субъединицу, периферическую мембранную ГТФазу, к мембране эндоплазматического ретикулума». J. Cell Biol . 128 (3): 273–282. doi :10.1083/jcb.128.3.273. PMC 2120348. PMID 7844142  . 
  5. ^ Wild, Klemens; Becker, Matthias MM; Kempf, Georg; Sinning, Irmgard (18 декабря 2019 г.). «Структура, динамика и взаимодействия крупных вариантов SRP». Биологическая химия . 401 (1): 63–80. doi : 10.1515/hsz-2019-0282 . PMID  31408431.
  6. ^ Stroud RM, Walter P, Rutenber E, Reyes CL (2007). Zhang S (ред.). "Рентгеновские структуры рецептора частиц распознавания сигнала выявляют промежуточные продукты цикла нацеливания". PLOS ONE . 2 (7): e607. Bibcode : 2007PLoSO...2..607R. doi : 10.1371/journal.pone.0000607 . PMC 1904258. PMID  17622352 .  Значок открытого доступа
  7. ^ Добберштейн Б., Хай С., Ромиш К., Миллер Ф.В. (2006). «Человеческие аутоантитела против белка 54 кДа блока распознавания сигнала функционируют на нескольких стадиях». Arthritis Research & Therapy . 8 (2): R39. doi : 10.1186/ar1895 . PMC 1526608. PMID  16469117 . 
  8. ^ Уолтер П., Брэдшоу Н. (2007). «Частица распознавания сигнала (SRP) РНК связывает конформационные изменения в SRP с нацеливанием белка». Mol. Biol. Cell . 18 (7): 2728–2734. doi :10.1091/mbc.E07-02-0117. PMC 1924838. PMID  17507650 . 
В статье использован текст из общедоступных источников Pfam и InterPro : IPR015284