Сезон Южной футбольной лиги 1949–50 стал 47-м в истории английской футбольной лиги .
В лигу входило 24 клуба, включая все 22 клуба предыдущего сезона, а также два вновь избранных клуба — «Хедингтон Юнайтед» и «Уэймут» . Мертир Тайдфил стал чемпионом, выиграв свой второй титул Южной лиги. По итогам сезона Футбольная лига расширилась с 88 до 92 клубов. Шесть клубов Южной лиги подали заявки на вступление, в том числе «Колчестер Юнайтед» и «Джиллингем» .
Поскольку третий Южный дивизион Футбольной лиги был расширен с 20 до 22 клубов, ни один клуб Лиги не выставлялся на переизбрание, но два места были доступны для клубов, не входящих в Лигу. Шесть клубов Южной лиги подали заявки, при этом «Джиллингем» и «Колчестер Юнайтед» лидировали в бюллетенях [1] , несмотря на то, что Мертир выиграл лигу.