В сезоне 1999–2000 Liga Alef Hapoel Majd al-Krum (чемпионы Северного дивизиона) и Maccabi Ashkelon (чемпионы Южного дивизиона) выиграли титул и получили повышение в Liga Artzit . В конце сезона клубы Liga Artzit, Beitar Tel Aviv и Shimshon Tel Aviv объединились в Beitar Shimshon Tel Aviv , а Hapoel Nir Ramat HaSharon также получили повышение.
На дне турнирной таблицы клубы «Маккаби Афула» (из Северного дивизиона) и «Хапоэль Ор-Йехуда» (из Южного дивизиона) были автоматически переведены в Лигу Бет , в то время как клуб «Секция Нес Циона» был отсрочен от вылета после того , как клуб «Маккаби Лазарус Холон» распался в конце сезона.