Секретоглобин

Секретоглобины (SCGB) — это семейство небольших, альфа-спиральных, дисульфидно- связанных димерных белков , которые встречаются только у млекопитающих. Это семейство ранее было известно как семейство Uteroglobin/Clara cell 10-kDa , по двум псевдонимам его основателя Uteroglobin.

Структура и функции

Белки в основном альфа-спиральные, а димер формируется антипараллельным образом. Интерфейс димера представляет собой полость, образованную через два мономера, которая может вмещать лиганды малого и среднего размера, такие как стероиды и фосфолипиды. ^[1] Связывание и высвобождение могут быть связаны с окислительно-восстановительным состоянием цистинов, т. е. наличием этих дисульфидных связей. ^[2]

Многие из них выполняют регулирующие функции.

Классификация

В 2006 году семейство было классифицировано по гомологии последовательностей на 6 подсемейств. ^[3] Геномы человека и мыши содержат только первые три семейства, согласно обновлению 2011 года. Не каждое семейство является монофилетическим. ^[4]

Крысиный простатеин (белок, связывающий стероиды простаты крысы) представляет собой трехкомпонентный тетрамерный белковый комплекс, построенный из трех липофилиноподобных генов в группах 2 и 3. Некоторые источники описывают его как ортолога липофилина. ^[3]

Дополнительные подсемейства

Подсемейства 4 и 6 изначально были описаны как обнаруженные у человека и мышей, но теперь они рассматриваются как дубликаты существующих групп. Подсемейство 5 изначально не обнаружено ни у одного из них. ^[3]

Подсемейство 4 ранее включало то, что сейчас известно как группа 1B, а 2B как группа 4A. Пары генов 1B/2B (ABP) расположены голова к голове на хромосоме в «модулях», которые были независимо дублированы. ^[4]

Подсемейство 6 должно было включать человеческий и крысиный RYD5 ^[3] , теперь переименованный в Scgb1c1. ^[4]

Fel d 1 должен был быть помещен в два подсемейства: цепь 1 в подсемействе 4 и цепь 2 в подсемействе 5. ^[3] Хотя это не упоминается в обновлении 2011 года, совпадения InterPro предполагают, что CH1 похож на 1B, а CH2 похож на 2B. ^[5] Дополнительные вычислительные исследования подтверждают сходство, полностью опровергая подсемейства 4 и 5. ^[6]

Ссылки

1. Umland TC, Swaminathan S, Singh G, Warty V, Furey W, Pletcher J, Sax M (август 1994). «Структура комплекса фосфолипид-связывающего белка-лиганда клетки человека Клара при разрешении 1,9 А». Nature Structural Biology . 1 (8): 538–45. doi :10.1038/nsb0894-538. PMID  7664082. S2CID  28261246.
2. Härd T, Barnes HJ, Larsson C, Gustafsson JA, Lund J (ноябрь 1995 г.). «Структура раствора белка, связывающего ПХБ млекопитающих, в комплексе с ПХБ». Nature Structural Biology . 2 (11): 983–9. doi :10.1038/nsb1195-983. PMID  7583672. S2CID  10369347.
3. Klug J, Beier HM, Bernard A, Chilton BS, Fleming TP, Lehrer RI и др. (25 января 2006 г.). «Семейство белков Uteroglobin/Clara cell 10-kDa: отчет номенклатурного комитета». Annals of the New York Academy of Sciences . 923 (1): 348–54. doi :10.1111/j.1749-6632.2000.tb05549.x. PMID  11193777. S2CID  38862724.
4. Jackson BC, Thompson DC, Wright MW, McAndrews M, Bernard A, Nebert DW, Vasiliou V (октябрь 2011 г.). «Обновление суперсемейства генов человеческого секретоглобина (SCGB) и пример «эволюционного расцвета» генов андрогенсвязывающего белка в суперсемействе генов мыши Scgb». Human Genomics . 5 (6): 691–702. doi : 10.1186/1479-7364-5-6-691 . PMC 3251818 . PMID  22155607. 
5. "Fel d 1 цепь 1", Mus musculus, "Fel d 1 цепь 2", Mus musculus. InterPro .
6. Дюрайрадж Р., Пейджет П., Бьенбуар-Фросини К. (2018). «Еще одна игра в кошки-мышки: расшифровка эволюции суперсемейства SCGB и исследование молекулярного сходства основного аллергена кошек Fel d 1 и мышиного ABP с использованием вычислительных подходов». PLOS ONE . 13 (5): e0197618. Bibcode : 2018PLoSO..1397618D. doi : 10.1371/journal.pone.0197618 . PMC 5957422. PMID  29771985 .