SNCAIP

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Синфилин-1 — это белок , который у людей кодируется геном SNCAIP . [ ^{5] [6]} SNCAIP означает «синуклеин, альфа-взаимодействующий белок» и может обозначаться как SNCAP_HUMAN, синфилин 1, синуклеин, альфа-взаимодействующий белок (синфилин) и SYPH1.

Функция

Этот ген кодирует белок, содержащий несколько доменов белок-белкового взаимодействия , включая анкирин -подобные повторы, домен спиральной спирали и мотив связывания АТФ/ГТФ. Кодируемый белок взаимодействует с альфа-синуклеином в нейронной ткани и может играть роль в формировании цитоплазматических включений и нейродегенерации . Мутация в этом гене была связана с болезнью Паркинсона . Были описаны альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы этого гена, но их полноразмерная природа еще не определена. ^[6]

Ген SNCAIP обеспечивает инструкции для создания белка, называемого синфилином-1, и немного отличающейся версии этого белка, называемого синфилином-1А. Эти белки вырабатываются в мозге. Обычно они расположены в специализированных структурах, называемых пресинаптическими окончаниями, которые находятся на кончиках нервных клеток. В нервных клетках синфилин-1 и синфилин-1А взаимодействуют с другим белком, называемым альфа-синуклеином. Однако функции синфилина-1 и синфилина-1А неизвестны.

Взаимодействия

Было показано, что SNCAIP взаимодействует с:

• Альфа-синуклеин ^{[5] [7] [8] [9]} и
• Паркин (лигаза) . ^[10]

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000064692 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000024534 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Engelender S, Kaminsky Z, Guo X, Sharp AH, Amaravi RK, Kleiderlein JJ, Margolis RL, Troncoso JC, Lanahan AA, Worley PF, Dawson VL, Dawson TM, Ross CA (май 1999). "Synphilin-1 связывается с альфа-синуклеином и способствует образованию цитозольных включений". Nat Genet . 22 (1): 110–4. doi :10.1038/8820. PMID  10319874. S2CID  2611127.
6. "Ген Энтреза: синуклеин SNCAIP, альфа-взаимодействующий белок (синфилин)".
7. Нейстат М, Ржецкая М, Холодилов Н, Берк Р. Э. (июнь 2002 г.). «Анализ взаимодействий синфилина-1 и синуклеина с помощью жидкостного анализа дрожжевой двухгибридной бета-галактозидазы». Neurosci. Lett . 325 (2): 119–23. doi :10.1016/s0304-3940(02)00253-7. PMID  12044636. S2CID  11517781.
8. Nagano Y, Yamashita H, Nakamura T, Takahashi T, Kondo E, Nakamura S (декабрь 2001 г.). «Отсутствие связывания, наблюдаемое между человеческим альфа-синуклеином и семейством белков Bcl-2». Neurosci. Lett . 316 (2): 103–7. doi :10.1016/s0304-3940(01)02330-8. PMID  11742726. S2CID  54363210.
9. Kawamata H, McLean PJ, Sharma N, Hyman BT (май 2001 г.). «Взаимодействие альфа-синуклеина и синфилина-1: эффект мутаций, связанных с болезнью Паркинсона». J. Neurochem . 77 (3): 929–34. doi : 10.1046/j.1471-4159.2001.00301.x . PMID  11331421. S2CID  83885937.
10. Chung KK, Zhang Y, Lim KL, Tanaka Y, Huang H, Gao J, Ross CA, Dawson VL, Dawson TM (октябрь 2001 г.). «Parkin ubiquitinates the alpha-synuclein-interacting protein, synphilin-1: implications for Lewy-body formation in Parkinson disease». Nat. Med . 7 (10): 1144–50. doi :10.1038/nm1001-1144. PMID  11590439. S2CID  12487644.

Дальнейшее чтение

• Krüger R (2005). «Роль синфилина-1 в синаптической функции и деградации белка». Cell Tissue Res . 318 (1): 195–9. doi :10.1007/s00441-004-0953-z. PMID  15322916. S2CID  12186058.
• Engelender S, Wanner T, Kleiderlein JJ, Wakabayashi K, Tsuji S, Takahashi H, Ashworth R, Margolis RL, Ross CA (2000). «Организация гена человеческого синфилина-1, кандидата на болезнь Паркинсона». Mamm. Genome . 11 (9): 763–6. doi :10.1007/s003350010123. PMID  10967135. S2CID  22420090.
• Kawamata H, McLean PJ, Sharma N, Hyman BT (2001). «Взаимодействие альфа-синуклеина и синфилина-1: эффект мутаций, связанных с болезнью Паркинсона». J. Neurochem . 77 (3): 929–34. doi : 10.1046/j.1471-4159.2001.00301.x . PMID  11331421. S2CID  83885937.
• Chung KK, Zhang Y, Lim KL, Tanaka Y, Huang H, Gao J, Ross CA, Dawson VL, Dawson TM (2001). «Паркин убиквитинирует белок, взаимодействующий с альфа-синуклеином, синфилин-1: влияние на образование телец Леви при болезни Паркинсона». Nat. Med . 7 (10): 1144–50. doi :10.1038/nm1001-1144. PMID  11590439. S2CID  12487644.
• Ribeiro CS, Carneiro K, Ross CA, Menezes JR, Engelender S (2002). «Синфилин-1 локализуется в процессе развития в синаптических окончаниях, а его связь с синаптическими пузырьками модулируется альфа-синуклеином». J. Biol. Chem . 277 (26): 23927–33. doi : 10.1074/jbc.M201115200 . PMID  11956199.
• O'Farrell C, Pickford F, Vink L, McGowan E, Cookson MR (2002). «Консервативная последовательность между мышиным и человеческим синфилином-1». Neurosci. Lett . 322 (1): 9–12. doi :10.1016/S0304-3940(02)00068-X. PMID  11958831. S2CID  9654263.
• Нейстат М, Ржецкая М, Холодилов Н, Берк Р. Э. (2002). «Анализ взаимодействий синфилина-1 и синуклеина с помощью жидкостного анализа двугибридной бета-галактозидазы дрожжей». Neurosci. Lett . 325 (2): 119–23. doi :10.1016/S0304-3940(02)00253-7. PMID  12044636. S2CID  11517781.
• Junn E, Lee SS, Suhr UT, Mouradian MM (2003). «Накопление паркина в агресомах из-за нарушения протеасомы». J. Biol. Chem . 277 (49): 47870–7. doi : 10.1074/jbc.M203159200 . PMID  12364339.
• Ихара М., Томимото Х., Китаяма Х., Мориока Й., Акигучи И., Шибасаки Х., Нода М., Киносита М. (2003). «Связь цитоскелетного ГТФ-связывающего белка Sept4/H5 с цитоплазматическими включениями, обнаруженными при болезни Паркинсона и других синуклеинопатиях». J. Biol. Chem . 278 (26): 24095–102. doi : 10.1074/jbc.M301352200 . PMID  12695511.
• Ito T, Niwa J, Hishikawa N, Ishigaki S, Doyu M, Sobue G (2003). «Дорфин локализуется в тельцах Леви и убиквитилирует синфилин-1». J. Biol. Chem . 278 (31): 29106–14. doi : 10.1074/jbc.M302763200 . PMID  12750386.
• Маркс Ф.П., Хольцман К., Штраус К.М., Ли Л., Эберхардт О., Герхардт Е., Куксон М.Р., Эрнандес Д., Фаррер М.Дж., Качергус Дж., Энгелендер С., Росс К.А., Бергер К., Шёльс Л., Шульц Дж.Б., Рисс О., Крюгер Р. (2004). «Идентификация и функциональная характеристика новой мутации R621C в гене синфилина-1 при болезни Паркинсона». Хм. Мол. Жене . 12 (11): 1223–31. дои : 10.1093/hmg/ddg134 . ПМИД  12761037.
• Scherzer CR, Jensen RV, Gullans SR, Feany MB (2004). «Изменения экспрессии генов предвещают нейродегенерацию в модели болезни Паркинсона на дрозофиле». Hum. Mol. Genet . 12 (19): 2457–66. doi : 10.1093/hmg/ddg265 . PMID  12915459.
• Нагано Ю, Ямасита Х, Такахаси Т, Кисида С, Накамура Т, Исеки Э, Хаттори Н, Мизуно Ю, Кикучи А, Мацумото М (2004). «Siah-1 способствует убиквитинированию и деградации синфилина-1». Ж. Биол. Хим . 278 (51): 51504–14. дои : 10.1074/jbc.M306347200 . ПМИД  14506261.
• Tanaka M, Kim YM, Lee G, Junn E, Iwatsubo T, Mouradian MM (2004). «Агресомы, образованные альфа-синуклеином и синфилином-1, обладают цитопротекторным действием». J. Biol. Chem . 279 (6): 4625–31. doi : 10.1074/jbc.M310994200 . PMID  14627698.
• Lee G, Tanaka M, Park K, Lee SS, Kim YM, Junn E, Lee SH, Mouradian MM (2004). «Фосфорилирование, опосредованное казеинкиназой II, регулирует взаимодействие альфа-синуклеина/синфилина-1 и образование включений». J. Biol. Chem . 279 (8): 6834–9. doi : 10.1074/jbc.M312760200 . PMID  14645218.
• Chung KK, Thomas B, Li X, Pletnikova O, Troncoso JC, Marsh L, Dawson VL, Dawson TM (2004). «S-нитрозилирование паркина регулирует убиквитинирование и нарушает защитную функцию паркина». Science . 304 (5675): 1328–31. doi :10.1126/science.1093891. PMID  15105460. S2CID  86854030.