В мембранной биологии слияние — это процесс, при котором два первоначально различных липидных бислоя сливаются со своими гидрофобными ядрами, в результате чего образуется одна взаимосвязанная структура. Если это слияние происходит полностью через обе створки обоих бислоев, образуется водный мостик и внутреннее содержимое двух структур может смешиваться. Альтернативно, если в процессе слияния участвует только один листок от каждого бислоя, бислои называются полуслитыми. При гемислиянии липидные компоненты внешнего листка двух бислоев могут смешиваться, но внутренние листочки остаются отдельными. Водное содержимое, заключенное в каждом бислое, также остается разделенным.
Слияние участвует во многих клеточных процессах, особенно у эукариот , поскольку эукариотическая клетка сильно разделена липидными двухслойными мембранами. Экзоцитоз , оплодотворение яйцеклетки спермой и транспорт отходов в лизосому — вот лишь некоторые из многих эукариотических процессов, которые основаны на той или иной форме слияния . Слияние также является важным механизмом транспорта липидов от места их синтеза к мембране, где они необходимы. Даже проникновение патогенов можно контролировать путем слияния, поскольку многие вирусы с двухслойной оболочкой имеют специальные слитые белки для проникновения в клетку-хозяина.
Липидный механизм
Процесс слияния состоит из четырех основных этапов, хотя каждый из этих этапов на самом деле представляет собой сложную последовательность событий. [1] Во-первых, вовлеченные мембраны должны агрегировать, приближаясь друг к другу с точностью до нескольких нанометров. Во-вторых, два бислоя должны вступить в очень тесный контакт (в пределах нескольких ангстрем). Чтобы достичь такого тесного контакта, две поверхности должны стать хотя бы частично обезвоженными, поскольку обычно присутствующая связанная поверхностная вода заставляет бислои сильно отталкиваться на этом расстоянии. В-третьих, в одной точке между двумя бислоями должна развиться дестабилизация, вызывающая высоколокализованную перестройку двух бислоев. Наконец, по мере роста этого точечного дефекта компоненты двух бислоев смешиваются и диффундируют от места контакта. В зависимости от того, происходит ли гемислияние или полное слияние, внутреннее содержимое оболочек в этот момент также может смешиваться.
Точные механизмы, стоящие за этой сложной последовательностью событий, до сих пор являются предметом споров. Чтобы упростить систему и обеспечить более точное исследование, множество экспериментов было проведено in vitro с синтетическими липидными везикулами. Эти исследования показали, что двухвалентные катионы играют решающую роль в процессе слияния, связываясь с отрицательно заряженными липидами, такими как фосфатидилсерин , фосфатидилглицерин и кардиолипин . [2] Одна из функций этих ионов в процессе синтеза — экранировать отрицательный заряд на поверхности бислоя, уменьшая электростатическое отталкивание и позволяя мембранам приближаться друг к другу. Однако это явно не единственная роль, поскольку существует широко документированная разница в способности Mg 2+ и Ca 2+ индуцировать слияние. Хотя Mg 2+ вызывает обширную агрегацию, он не вызывает слияния, тогда как Ca 2+ индуцирует и то, и другое. [3] Было высказано предположение, что это несоответствие связано с разницей в степени обезвоживания. Согласно этой теории, ионы кальция сильнее связываются с заряженными липидами, но менее прочно с водой. Возникающее в результате замещение кальция водой дестабилизирует границу раздела липид-вода и способствует тесному контакту между бислоями. [4] Недавно предложенная альтернативная гипотеза заключается в том, что связывание кальция вызывает дестабилизирующее латеральное напряжение . [5] Каким бы ни был механизм индуцированного кальцием слияния, первоначальное взаимодействие явно является электростатическим, поскольку цвиттер-ионные липиды не подвержены этому эффекту. [6] [7]
В процессе слияния головная группа липидов не только участвует в плотности заряда, но может влиять на дегидратацию и зарождение дефектов. Эти эффекты не зависят от эффектов ионов. Присутствие незаряженной головной группы фосфатидилэтаноламина (PE) увеличивает слияние при включении в бислой фосфатидилхолина. Некоторые объясняют это явление эффектом обезвоживания, подобным влиянию кальция. [8] Головная группа полиэтилена связывает воду менее прочно, чем поликарбонат, и поэтому может легче обеспечить тесное прилегание. Альтернативное объяснение состоит в том, что физическая, а не химическая природа ПЭ может способствовать синтезу. Согласно гипотезе слияния стебля, чтобы произошло слияние, между двумя бислоями должен образоваться сильно изогнутый мостик. [9] Поскольку PE имеет небольшую головную группу и легко образует инвертированные мицеллярные фазы, он должен, согласно модели стебля, способствовать образованию этих стеблей. [10] Еще одним свидетельством в пользу этой теории является тот факт, что некоторые липидные смеси, как было показано, поддерживают плавление только тогда, когда их температура превышает температуру перехода этих обращенных фаз. [11] [12] Эта тема также остается спорной, и даже если в процессе термоядерного синтеза присутствует искривленная структура, в литературе ведутся споры о том, является ли она кубической, гексагональной или более экзотической расширенной фазой. [13]
Слитые белки
Ситуация еще больше усложняется при рассмотрении слияния in vivo , поскольку биологическое слияние почти всегда регулируется действием мембран-ассоциированных белков . Первыми из этих белков, которые были изучены, были слитые вирусные белки, которые позволяют вирусу с оболочкой вставлять свой генетический материал в клетку-хозяина (вирусы с оболочкой - это вирусы, окруженные липидным бислоем; некоторые другие имеют только белковую оболочку). В широком смысле существует два класса вирусных слитых белков: кислые и pH-независимые. [1] pH -независимые слитые белки могут функционировать в нейтральных условиях и сливаться с плазматической мембраной , обеспечивая проникновение вируса в клетку. Вирусы, использующие эту схему, включали ВИЧ , корь и герпес . Кислотные слитые белки, такие как те, что обнаружены при гриппе , активируются только при низком pH кислых эндосом и должны сначала подвергнуться эндоцитозу , чтобы проникнуть в клетку.
Эукариотические клетки используют совершенно разные классы слитых белков, наиболее изученными из которых являются SNARE . Белки SNARE используются для управления всем везикулярным внутриклеточным транспортом. Несмотря на годы исследований, многое еще неизвестно о функции этого класса белков. Фактически, до сих пор ведутся активные дебаты относительно того, связаны ли SNARE с ранней стыковкой или участвуют позже в процессе слияния, способствуя гемифузии. [15] Даже если роль SNARE или других специфических белков будет освещена, единое понимание слитых белков маловероятно, поскольку внутри этих классов существует огромное разнообразие структур и функций, и очень мало тем сохраняется. [16]
Слияние в лабораторной практике
В исследованиях молекулярной и клеточной биологии часто желательно искусственно вызвать слияние. Хотя этого можно добиться добавлением кальция, как обсуждалось ранее, эта процедура часто неосуществима, поскольку кальций регулирует многие другие биохимические процессы, и его добавление может стать серьезной помехой. Кроме того, как уже упоминалось, кальций вызывает массивную агрегацию, а также слияние. Добавление полиэтиленгликоля (ПЭГ) вызывает слияние без значительной агрегации или биохимического разрушения. Эта процедура сейчас широко используется, например, путем слияния В-клеток с клетками миеломы . [17] Полученная в результате этой комбинации « гибридома » экспрессирует желаемое антитело , что определяется участвующими В-клетками, но иммортализована из-за миеломного компонента. Механизм слияния ПЭГ окончательно не идентифицирован, но некоторые исследователи полагают, что ПЭГ, связывая большое количество молекул воды, эффективно снижает химическую активность воды и, таким образом, обезвоживает головные группы липидов. [18] Слияние также можно искусственно вызвать посредством электропорации в процессе, известном как электрослияние. Считается, что это явление возникает из-за энергетически активных краев, образующихся во время электропорации, которые могут действовать как локальная точка дефекта, вызывающая рост стебля между двумя бислоями. [19]
Альтернативно, модельные системы на основе SNARE можно использовать для индукции слияния мембран липидных везикул. В этих системах комплементарная ДНК, закрепленная на мембране, [20] [21] [22] ПНК, [23] пептиды [24] или другие молекулы [25] «застегиваются» вместе и притягивают мембраны друг к другу. Такие системы могут найти практическое применение в будущем, например, при доставке лекарств. [26] Вероятно, наиболее изученная система [27] состоит из пептидов, образующих спиральную спираль, с комплементарным зарядом (один из них обычно несет избыток положительно заряженных лизинов и поэтому называется пептидом К, а другой - отрицательно заряженных глутаминовых кислот, называемый пептидом Е). [28] Интересно, что было обнаружено, что не только образование спиральной спирали между двумя пептидами необходимо для слияния мембран, но также и то, что пептид К взаимодействует с поверхностью мембраны и вызывает локальные дефекты. [29]
Анализы для измерения слияния мембран
Различают два уровня слияния: смешение мембранных липидов и перемешивание содержимого. Анализы слияния мембран сообщают либо о смешивании мембранных липидов, либо о смешивании водного содержимого слитых образований.
Анализы для измерения смешивания липидов
В анализах, оценивающих смешивание липидов, используются эффекты, зависящие от концентрации, такие как безызлучательный перенос энергии, тушение флуоресценции и образование пиренового эксимера.
Перенос энергии NBD-родамин: [30] В этом методе мембрана, меченная как NBD (донор), так и родамином (акцептор), объединяется с немеченой мембраной. Когда NBD и Родамин находятся на определенном расстоянии, происходит резонансная передача энергии Фёрстера (FRET). После слияния резонансная передача энергии (FRET) уменьшается, когда среднее расстояние между зондами увеличивается, а флуоресценция NBD увеличивается.
Образование эксимера пирена: длины волн излучения мономера пирена и эксимера различны. Длина волны излучения мономера составляет около 400 нм, а эксимера - около 470 нм. В этом методе мембрана, меченная пиреном, объединяется с немеченой мембраной. Пирен самоассоциируется в мембране, а затем возбужденный пирен возбуждает другой пирен. До термоядерного синтеза большая часть эмиссии представляет собой эксимерную эмиссию. После слияния расстояние между зондами увеличивается и доля эмиссии эксимеров уменьшается. [ нужна цитата ]
Самотушение октадецилродамина B: [31] Этот анализ основан на самотушении октадецилродамина B. Самотушение октадецилродамина B происходит, когда зонд включается в мембранные липиды в концентрациях 1–10 мольных процентов [32], поскольку Димеры родамина тушат флуоресценцию. В этом методе мембрана, меченная родамином, объединяется с немеченой мембраной. Слияние с немечеными мембранами приводит к разведению зонда, что сопровождается увеличением флуоресценции. [33] [34] Основной проблемой этого анализа является спонтанный перенос.
Анализы для измерения смешивания контента
Смешивание водного содержимого везикул в результате лизиса, слияния или физиологической проницаемости можно обнаружить флуорометрически с использованием низкомолекулярных растворимых индикаторов.
Анализы тушения флуоресценции с помощью ANTS/DPX: [35] [36] ANTS представляет собой полианионный флуорофор, а DPX представляет собой катионный тушитель. Анализ основан на их столкновительном тушении. Отдельные популяции везикул нагружены ANTS или DPX соответственно. Когда происходит смешивание содержимого, ANTS и DPX сталкиваются, и флуоресценция ANTS, контролируемая при длине волны 530 нм, с возбуждением при длине волны 360 нм гасится. Этот метод выполняется при кислом pH и высокой концентрации.
Анализы усиления флуоресценции с помощью Tb 3+ /DPA: [37] [38] Этот метод основан на том факте, что хелат Tb 3+ /DPA в 10 000 раз более флуоресцентен, чем один Tb 3+ . В анализе Tb 3+ /DPA отдельные популяции везикул нагружаются TbCl 3 или DPA. Образование хелата Tb 3+ /DPA можно использовать для указания на слияние пузырьков. Этот метод хорош для безбелковых мембран. [ нужна цитата ]
Анализ одной молекулы ДНК. [39] Шпилька ДНК, состоящая из стебля из 5 пар оснований и политимидиновой петли, помеченной донором (Cy3) и акцептором (Cy5) на концах стебля, была инкапсулирована в везикулу v-SNARE. Мы отдельно инкапсулировали несколько немеченых нитей полиаденозиновой ДНК в везикулу t-SNARE. Если две везикулы, обе диаметром около 100 нм, стыкуются и между ними образуется достаточно большая пора слияния, две молекулы ДНК должны гибридизоваться, открывая область стебля шпильки и переключая эффективность резонансной передачи энергии Фёрстера (FRET) ( E) между Cy3 и Cy5 от высокого до низкого значения.
^ Дюзгунес, Нежат; Вильшут, Ян; Фрейли, Роберт; Папахаджопулос, Деметриос (1981). «Исследование механизма слияния мембран. Роль состава головных групп в индуцированном кальцием и магнием слиянии смешанных фосфолипидных везикул». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Биомембраны . 642 (1): 182–95. дои : 10.1016/0005-2736(81)90148-6. ПМИД 7225377.
^ Маркин, В.С.; Козлов, М.М.; Боровягин, В.Л. (1984). «К теории слияния мембран. Стеблевой механизм» (PDF) . Общая физиология и биофизика . 3 (5): 361–77. ПМИД 6510702.
^ Черномордик, Леонид В.; Козлов, Михаил М. (2003). «Белко-липидное взаимодействие при слиянии и делении биологических мембран». Ежегодный обзор биохимии . 72 : 175–207. doi : 10.1146/annurev.biochem.72.121801.161504. ПМИД 14527322.
^ Нир, С.; Бенц, Дж.; Вильшут, Дж.; Дузгунес, Н. (1983). «Агрегация и слияние фосфолипидных везикул». Прогресс в науке о поверхности . 13 (1): 1–124. Бибкод :1983ПрСС...13....1Н. дои : 10.1016/0079-6816(83)90010-2.
^ Элленс, Харма; Бенц, Джо; Сока, Фрэнсис К. (1986). «Слияние фосфатидилэтаноламинсодержащих липосом и механизм фазового перехода Lα-HII». Биохимия . 25 (14): 4141–7. дои : 10.1021/bi00362a023. ПМИД 3741846.
^ Георгиев, Данко Д.; Глейзбрук, Джеймс Ф. (2007). «Субнейронная обработка информации уединенными волнами и случайными процессами». В Лышевском, Сергей Эдвард (ред.). Справочник по нано- и молекулярной электронике (PDF) . Серия «Нано и микроинженерия». ЦРК Пресс. стр. 17–1–17–41. дои : 10.1201/9781315221670. ISBN978-0-8493-8528-5.
^ Чен, Ю А.; Шеллер, Ричард Х. (2001). «SNARE-опосредованное слияние мембран». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 2 (2): 98–106. дои : 10.1038/35052017. PMID 11252968. S2CID 205012830.
^ Уайт, Дж. М. (1990). «Белки, слитые с вирусными и клеточными мембранами». Ежегодный обзор физиологии . 52 : 675–97. doi : 10.1146/annurev.ph.52.030190.003331. ПМИД 2184772.
^ Ленц, Барри Р. (1994). «Вызванное полимером слияние мембран: потенциальный механизм и связь с событиями слияния клеток». Химия и физика липидов . 73 (1–2): 91–106. дои : 10.1016/0009-3084(94)90176-7. ПМИД 8001186.
^ Рабе, Мартин; Эйзенбри, Кристофер; Плугачкова Кристина; Де Верт, Винсент; Бойл, Эйми Л.; Брюггеман, Диджей Ф.; Кирш, Соня А.; Бёкманн, Райнер А.; Крос, Александр; Раап, Ян; Бехингер, Буркхард (15 ноября 2016 г.). «Пептид со спиральной спиралью, формирующий липидные бислои при слиянии». Биофизический журнал . 111 (10): 2162–2175. Бибкод : 2016BpJ...111.2162R. дои : 10.1016/j.bpj.2016.10.010. ISSN 0006-3495. ПМК 5113151 . ПМИД 27851940.
^ Страк, Дуглас К.; Хекстра, Дик; Пагано, Ричард Э. (1981). «Использование резонансной передачи энергии для мониторинга слияния мембран». Биохимия . 20 (14): 4093–9. дои : 10.1021/bi00517a023. ПМИД 7284312.
^ Хукстра, Дик; Де Бур, Тайни; Клаппе, Карин; Вильшут, Ян (1984). «Флуоресцентный метод измерения кинетики слияния биологических мембран». Биохимия . 23 (24): 5675–81. дои : 10.1021/bi00319a002. ПМИД 6098295.
^ Макдональд, Руби I (1990). «Особенности самотушения флуоресценции липид-конъюгированного родамина в мембранах». Журнал биологической химии . 265 (23): 13533–9. дои : 10.1016/S0021-9258(18)77380-8 . ПМИД 2380172.
^ Рубин, Р.Дж.; Чен, Ю.Д. (1990). «Диффузия и перераспределение липидоподобных молекул между мембранами в системах слияния вирус-клетка и клетка-клетка». Биофизический журнал . 58 (5): 1157–67. Бибкод : 1990BpJ....58.1157R. дои : 10.1016/S0006-3495(90)82457-7. ПМК 1281061 . ПМИД 2291940.