Станция RCAF Уайтхорс изначально была открыта Министерством транспорта Канады как «аэродром Уайтхорс». Он расположен на территории нынешнего международного аэропорта Эрика Нильсена Уайтхорса в Уайтхорсе, Юкон .
Аэропорт был передан Королевским ВВС Канады в 1942 году как часть системы, получившей название Северо-Западный промежуточный маршрут . Обозначенная как станция RCAF Уайтхорс, она имела подразделения в Теслине , Айшихике и Снаге, Юкон , а в 1946 году - в Уотсон-Лейк, Юкон .
После Второй мировой войны станция RCAF Уайтхорс продолжала функционировать в основном как пункт дозаправки на маршруте через Аляску. Департамент транспорта взял на себя управление аэропортом, но RCAF остался. В 1948 году станция в Принс-Руперте, Британская Колумбия, закрылась, а позиции перехвата были перенесены в Уайтхорс.
Функция станции изменилась и стала в первую очередь радиостанцией, а именно радиостанцией № 5. Он стал частью дополнительной радиосистемы канадских вооруженных сил в 1966 году и был переименован в станцию канадских вооруженных сил Уайтхорс с переходом на дополнительную радиосистему (СУПРАД). Операции RCAF ограничивались радиоперехватом. Это была недолгая операция, поскольку CFS Whitehorse закрылась в 1968 году.