stringtranslate.com

Субгеномная мРНК

Субгеномные мРНК по сути представляют собой меньшие участки исходной транскрибированной цепи-матрицы .

3'-5' ДНК или РНК

Во время транскрипции исходная цепочка шаблона обычно считывается от 3' до 5' конца от начала до конца. Субгеномные мРНК создаются, когда транскрипция начинается с 3' конца цепочки шаблона (или 5' вновь синтезируемого шаблона) и начинает копироваться по направлению к 5' концу цепочки шаблона перед «прыжком» к концу шаблона и копированием последних нуклеотидов 5' конца шаблона (завершением 3' хвоста для вновь созданной цепочки).

В результате транслируемая цепь будет иметь 5'-конец, в разной степени схожий с исходным шаблоном (в зависимости от того, через какую часть шаблона перепрыгнула транскрипция), и 3'-конец, схожий с шаблоном. [1]

5'-3' (положительный смысл) вирусная РНК

Положительно-смысловая (5' к 3') вирусная РНК, которая может быть напрямую транслирована в желаемые вирусные белки, проходит процесс, аналогичный описанному в 3' к 5'. Части вирусной РНК могут быть пропущены во время трансляции.

Результат

В результате из одной и той же нити мРНК может быть создано множество различных белков с похожими 5'-концами (в разной степени) и одинаковыми 3'-концами. Или же различные белки могут быть созданы с положительной смысловой вирусной РНК.

5'-участок вновь созданной цепи совпадает с участком цепи-шаблона, и этот участок цепи-шаблона называется «вложенным набором». [2]

3' 5' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATACGTTATTTCTGCGCGGAAAAAAAAA - Исходный шаблон Strand 5' 3' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATAC---------------AAAAAAAAA | GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCAC--------------------------AAAAAAAA | = Субгеномная мРНК. GCCGCCCCGTAT----------------------------------------AAAAAAAAAA |  GCCGCCCCGTAT = Вложенный набор — указывает на переходы.

Примеры

Этот сложный метод транскрипции, как правило, ограничивается вирусами , особенно вирусами с одноцепочечной положительной РНК или вирусами класса IV по Балтиморской системе классификации , например, вирусами порядка Nidovirales .

В основном он используется для уплотнения большего количества генетической информации в более короткий объем генетического материала. [3]

Литература

  1. ^ Wu B, White KA (декабрь 2007 г.). «Отсоединение репликации РНК-вируса от транскрипции через полимеразу: функциональные и эволюционные идеи». The EMBO Journal . 26 (24): 5120–30. doi :10.1038/sj.emboj.7601931. PMC  2140117. PMID  18034156 .
  2. ^ Le, TM; Wong, HH; Tay, FP; Fang, S; Keng, CT; Tan, YJ; Liu, DX (август 2007 г.). «Экспрессия, посттрансляционная модификация и биохимическая характеристика белков, кодируемых субгеномной мРНК8 коронавируса тяжелого острого респираторного синдрома». FEBS J . 274 (16): 4211–22. doi : 10.1111/j.1742-4658.2007.05947.x . PMC 7164070 . PMID  17645546. 
  3. ^ Xu W, White KA (февраль 2008 г.). «Субгеномная транскрипция мРНК у золотистого стафилококка: подавление транскрипции и эволюция регуляторных элементов РНК». Вирусология . 371 (2): 430–8. doi : 10.1016/j.virol.2007.09.035 . PMID  17988704.