stringtranslate.com

Топоизомераза II типа

Топоизомеразы типа II — это топоизомеразы , которые разрезают обе нити спирали ДНК одновременно, чтобы управлять клубками и суперспиралями ДНК . Они используют гидролиз АТФ , в отличие от топоизомеразы типа I. В этом процессе эти ферменты изменяют число связей кольцевой ДНК на ±2. Топоизомеразы — это вездесущие ферменты, обнаруженные во всех живых организмах. [1]

У животных топоизомераза II является мишенью химиотерапии. У прокариот гираза является антибактериальной мишенью. [2] Действительно, эти ферменты представляют интерес для широкого спектра эффектов.

Функция

Топоизомеразы типа II увеличивают или уменьшают число связей петли ДНК на 2 единицы, и это способствует распутыванию хромосом. Например, ДНК-гираза , топоизомераза типа II, наблюдаемая у E. coli и большинства других прокариот , вводит отрицательные супервитки и уменьшает число связей на 2. Гираза также способна удалять узлы из бактериальной хромосомы . Наряду с гиразой большинство прокариот также содержат вторую топоизомеразу типа IIA, называемую топоизомеразой IV. Гираза и топоизомераза IV различаются своими С-концевыми доменами, что, как полагают, определяет субстратную специфичность и функциональность для этих двух ферментов. Футпринтинг показывает, что гираза, которая образует отпечаток из 140 пар оснований и оборачивает ДНК, вводит отрицательные супервитки , в то время как топоизомераза IV, которая образует отпечаток из 28 пар оснований, не оборачивает ДНК.

Эукариотическая топоизомераза II типа не может образовывать суперспирали; она может только расслаблять их.

Роль топоизомераз типа IIB изучена меньше. В отличие от топоизомераз типа IIA, топоизомеразы типа IIB не могут упростить топологию ДНК (см. ниже), но они разделяют несколько структурных особенностей с топоизомеразами типа IIA.

Упрощение топологии

Топоизомеразы типа IIA необходимы для разделения переплетенных дочерних цепей во время репликации. Считается, что эта функция выполняется топоизомеразой II у эукариот и топоизомеразой IV у прокариот. Неспособность разделить эти цепи приводит к гибели клетки. Топоизомеразы типа IIA обладают особой способностью расслаблять ДНК до состояния ниже термодинамического равновесия, что отличается от топоизомераз типов IA, IB и IIB. Эта способность, известная как упрощение топологии, была впервые выявлена ​​Рыбенковым и др. [3] Гидролиз АТФ приводит к этому упрощению, но четкий молекулярный механизм этого упрощения до сих пор отсутствует. Было предложено несколько моделей для объяснения этого явления, включая две модели, которые основаны на способности топоизомераз типа IIA распознавать изогнутые дуплексы ДНК. [4] Биохимия, электронная микроскопия и недавние исследования структур топоизомеразы II, связанной с ДНК, показывают, что топоизомеразы типа IIA связываются с верхушками ДНК, что подтверждает эту модель.

Классификация

Существует два подкласса топоизомераз типа II: тип IIA и тип IIB.

Некоторые организмы, включая людей, имеют две изоформы топоизомеразы II: альфа и бета . При раке топоизомераза IIα сильно экспрессируется в пролиферирующих клетках. При некоторых видах рака, таких как опухоли оболочек периферических нервов, высокая экспрессия кодируемого ею белка также связана с плохой выживаемостью пациентов.

Два класса топоизомераз обладают схожим механизмом прохождения нити и структурой домена (см. ниже), однако у них также есть несколько важных различий. Топоизомеразы типа IIA образуют двухцепочечные разрывы с выступами из четырех пар оснований, тогда как топоизомеразы типа IIB образуют двухцепочечные разрывы с выступами из двух оснований. [6] Кроме того, топоизомеразы типа IIA способны упрощать топологию ДНК, [3] тогда как топоизомеразы типа IIB не способны на это. [7]

Структура

Тип IIA

Схематическое изображение структуры гиразы, перевернутой по сравнению с другими примерами в этой статье.
Структура дрожжевой топоизомеразы II, связанной с дважды расщепленной 34-мерной дуплексной ДНК ( PDB : 2RGR ​). Складка Toprim окрашена в голубой цвет; ДНК окрашена в оранжевый цвет; HTH окрашена в пурпурный цвет; а C-gate окрашен в фиолетовый цвет. Обратите внимание, что ДНК изогнута примерно на 160 градусов через инвариантный изолейцин (Ile833 в дрожжах).

Топоизомеразы типа IIA состоят из нескольких ключевых мотивов:

Эукариотические топоизомеразы типа II являются гомодимерами (A 2 ), тогда как прокариотические топоизомеразы типа II являются гетеротетрамерами (A 2 B 2 ). У прокариот домен АТФазы и складка Toprim находятся на одном полипептиде ( Pfam PF00204), тогда как ядро ​​расщепления ДНК и CTD находятся на втором полипептиде ( Pfam PF00521). Для гиразы первый полипептид называется GyrB, а второй полипептид называется GyrA. Для topo IV первый полипептид называется ParE, а второй полипептид называется ParC. Обе сигнатуры Pfam обнаружены в одноцепочечной эукариотической топоизомеразе.

Структуры N-концевого домена АТФазы гиразы [8] и дрожжевой топоизомеразы II [9] были решены в комплексе с AMPPNP (аналогом АТФ), показывая, что два домена АТФазы димеризуются, образуя закрытую конформацию. Для гиразы структура имеет существенное отверстие в середине, которое, как предполагается, вмещает T-сегмент.

Связывание домена АТФазы с фолдом Toprim представляет собой спиральный элемент, известный как домен трансдуктора. Предполагается, что этот домен передает состояние нуклеотидов домена АТФазы остальной части белка. Изменения этого домена влияют на активность топоизомеразы, а структурная работа, проделанная группой Verdine, показывает, что состояние АТФ влияет на ориентацию домена трансдуктора. [10]

Центральное ядро ​​белка содержит складку Toprim и ДНК-связывающее ядро, которое содержит домен крылатой спирали (WHD), часто называемый доменом CAP, поскольку он был впервые идентифицирован как напоминающий WHD белка-активатора катаболита. Каталитический тирозин лежит на этом WHD. Складка Toprim представляет собой складку Россмана, которая содержит три инвариантных кислотных остатка, которые координируют ионы магния, участвующие в расщеплении ДНК и религировании ДНК. [11] Структура складки Toprim и ДНК-связывающего ядра дрожжевой топоизомеразы II была впервые решена Бергером и Ваном, [12] а первое ДНК-связывающее ядро ​​гиразы было решено Мораисом Кабралом и др. [13] Структура, решенная Бергером, выявила важные сведения о функции фермента. ДНК-связывающее ядро ​​состоит из WHD, что приводит к домену башни. Спирально-спиральная область ведет к С-концевому домену, который образует основной димерный интерфейс для этого кристаллического состояния (часто называемого C-воротами). В то время как исходная структура топоизомеразы II показывает ситуацию, когда WHD разделены большим расстоянием, структура гиразы показывает закрытую конформацию, где WHD закрыты.

Ядро топоизомеразы II позднее было решено в новых конформациях, включая одну, предложенную Фассом и др. [14] и Донгом и др. [15]. Структура Фасса показывает, что домен Toprim является гибким, и что эта гибкость может позволить домену Toprim координироваться с WHD для формирования компетентного комплекса расщепления. Это было в конечном итоге подтверждено структурой Донга и др., которая была решена в присутствии ДНК. Эта последняя структура показала, что домен Toprim и WHD образовали комплекс расщепления, очень похожий на комплекс топоизомераз типа IA, и указала, как связывание ДНК и расщепление могут быть разъединены, а структура показала, что ДНК была согнута примерно на 150 градусов через инвариантный изолейцин (в топоизомеразе II это I833, а в гиразе это I172). Этот механизм изгиба очень похож на механизм интеграционного фактора хозяина (IHF) и HU, двух архитектурных белков в бактериях. Кроме того, в то время как предыдущие структуры ДНК-связывающего ядра имели закрытые C-ворота, эта структура захватила ворота открытыми, что является ключевым шагом в двухворотном механизме (см. ниже).

Совсем недавно несколько структур ДНК-связанной структуры были решены в попытке понять как химический механизм расщепления ДНК, так и структурную основу ингибирования топоизомеразы антибактериальными ядами. Первая полная архитектура ДНК -гиразы E. coli была решена с помощью криоэлектронной микроскопии с разрешением, близким к атомному. [16] Нуклеопротеиновый комплекс был захвачен с помощью длинного ДНК-дуплекса и гепотидацина , нового бактериального ингибитора топоизомеразы.

C-концевая область прокариотических топоизомераз была решена для нескольких видов. Первая структура C-концевого домена гиразы была решена Корбеттом и др. [17] , а C-концевой домен топоизомеразы IV был решен Корбеттом и др. [7]. Структуры образовали новый бета-бочонок, который изгибает ДНК, оборачивая нуклеиновую кислоту вокруг себя. Изгиб ДНК гиразой был предложен в качестве ключевого механизма в способности гиразы вводить отрицательные суперспирали в ДНК. Это согласуется с данными футпринтинга, которые показывают, что гираза имеет футпринт из 140 пар оснований. CTD как гиразы, так и топоизомеразы IV изгибают ДНК, но только гираза вводит отрицательные суперспирали.

В отличие от функции С-концевого домена прокариотических топоизомераз, функция С-концевой области эукариотической топоизомеразы II до сих пор не ясна. Исследования показали, что эта область регулируется фосфорилированием, и это модулирует активность топоизомеразы, однако для изучения этого вопроса необходимо провести больше исследований.

Тип IIB

Структура топо VI ( PDB : 2Q2E ​) в ориентации, похожей на пример с дрожжами. Цепи окрашены по-разному. Домен Toprim лежит сверху, а домен ATPase — снизу; каждый образует ворота ДНК.

Организация топоизомераз типа IIB похожа на организацию топоизомераз типа IIA, за исключением того, что все типы IIB имеют два гена и образуют гетеротетрамеры. Один ген, называемый topo VI-B (поскольку он напоминает gyrB), содержит домен АТФазы, домен трансдуктора ( Pfam PF09239) и C-концевой домен Ig-fold-like H2TH ( Pfam PF18000). Второй ген, называемый topo VI-A ( Pfam PF04406), содержит домен WHD и Toprim.

Домен АТФазы топо VI B был решен в нескольких нуклеотидных состояниях. [18] Он очень похож на домен GHKL топо II и MutL и показывает, что состояние нуклеотида (АДФ против АТФ) влияет на ориентацию домена трансдуктора (и 1MX0).

Структура топоизомера VI-A была решена Бержератом и др. [19], показав, что складка HTH и Toprim имеет новую конформацию по сравнению с топоизомером IIA.

Недавно была решена структура комплекса топо VI A/B, показывающая открытую и закрытую конформацию, два состояния, которые предсказаны в двухзатворном механизме (см. ниже). Эти структуры, одна из которых является рентгеновской кристаллической структурой, а другая — реконструкцией малоуглового рентгеновского рассеяния (SAXS), показывают, что домен АТФазы может быть как открытым, так и закрытым. [20]

Механизм действия

Проход через Стрэнд

Топоизомераза типа IIA действует посредством механизма «двух ворот» (хотя это историческое обозначение), механизм, поддерживаемый биохимией [21] , а также структурными исследованиями. [22]

Цепь ДНК, называемая воротами или G-сегментом, связана центральными ДНК-связывающими воротами (ДНК-воротами). Вторая цепь ДНК, называемая транспортной или T-сегментом, захватывается димеризацией N-концевого домена АТФазы (АТФазными воротами), когда связываются две молекулы АТФ. Гидролиз АТФ и высвобождение неорганического фосфата приводит к расщеплению G-сегмента, поскольку каталитические тирозины образуют ковалентную фосфотирозиновую связь с 5'-концом ДНК. Это создает нависание из четырех оснований и двухцепочечный разрыв в G-сегменте. Когда ДНК-связывающие ворота разделяются, T-сегмент переносится через G-сегмент. G-сегмент запечатывается, что приводит к открытию C-концевых ворот (или C-ворот), позволяя высвободить T-сегмент. Высвобождение продукта АДФ приводит к перезагрузке системы и позволяет захватить второй Т-сегмент.

Топоизомеразы типа IIB действуют аналогичным образом, за исключением того, что белок образует двухосновной выступ в G-сегменте, а C-концевые ворота полностью отсутствуют.

расщепление ДНК

В механизме прохождения цепи расщепление ДНК является ключевым для того, чтобы позволить T-сегменту пройти через G-сегмент. Механизм расщепления ДНК топоизомеразами типа IIA в последнее время оказался в центре внимания многих биохимических и структурно-биологических исследований.

Катенация

Катенация — это процесс, посредством которого две кольцевые нити ДНК соединяются вместе, как звенья цепи. Это происходит после репликации ДНК, когда две одинарные нити соединяются и все еще могут реплицироваться, но не могут разделиться на две дочерние клетки. Поскольку топоизомеразы типа II разрывают двойную нить, они могут исправить это состояние (топоизомеразы типа I могли бы сделать это только в том случае, если бы уже был одноцепочечный разрыв), и правильное число хромосом может сохраняться в дочерних клетках. Линейная ДНК у эукариот настолько длинная, что их можно считать не имеющими концов; топоизомеразы типа II необходимы по той же причине.

Ингибирование

Малые молекулы, нацеленные на топоизомеразу типа II, делятся на два класса: ингибиторы и яды. Из-за их частого присутствия в пролиферирующих эукариотических клетках ингибиторы топоизомеразы типа II были широко изучены и использовались в качестве противораковых препаратов. [23]

Экспериментальный противоопухолевый препарат m-AMSA (4'-(9'-акридиниламино)метансульфон-м-анисидид) также ингибирует топоизомеразу типа 2. [24]

Яды топоизомеразы широко использовались как в качестве противораковой, так и антибактериальной терапии. Хотя антибактериальные соединения, такие как ципрофлоксацин, нацелены на бактериальную гиразу, они не способны ингибировать эукариотические топоизомеразы типа IIA. Кроме того, у устойчивых к лекарствам бактерий часто есть точечная мутация в гиразе (серин79аланин в E. coli ), которая делает хинолоны неэффективными. [ необходима цитата ] Недавние структурные исследования привели к открытию соединения, которое больше не зависит от этого остатка и, следовательно, эффективно против устойчивых к лекарствам бактерий. [ необходима цитата ]

Бактериофаг Т4 гираза

Бактериофаговая (фаговая) гираза T4 (топоизмераза II типа) представляет собой многосубъединичный белок, состоящий из продуктов генов 39, 52 и, возможно, 60. [25] [26] Она катализирует релаксацию отрицательно или положительно суперспиральной ДНК и используется в репликации ДНК фага во время заражения бактериального хозяина E. coli . [27] Белок гена фага 52 имеет гомологию с субъединицей gyrA гиразы E. coli [28] , а белок гена фага 39 имеет гомологию с субъединицей gyr B. [29] Поскольку ДНК-гираза хозяина E. coli может частично компенсировать потерю продуктов гена фага T4, мутанты, дефектные в генах 39, 52 или 60, не полностью отменяют репликацию ДНК фага, а скорее задерживают ее инициацию. [27] Скорость удлинения ДНК не ниже, чем у дикого типа при таких мутантных инфекциях. [30] Мутанты, дефектные в генах 39, 52 или 60, демонстрируют повышенную генетическую рекомбинацию , а также повышенную замену оснований и делеционную мутацию, что позволяет предположить, что компенсируемый хозяином синтез ДНК менее точен, чем тот, который направляется фагом дикого типа. [31] Мутант, дефектный в гене 39, демонстрирует повышенную чувствительность к инактивации ультрафиолетовым облучением на стадии фаговой инфекции после инициации репликации ДНК, когда присутствуют множественные копии хромосомы фага. [32] Мутанты, дефектные в генах 39, 52 и 60, обладают пониженной способностью выполнять множественную реактивацию, форму рекомбинационной репарации, которая может справляться с различными типами повреждений ДНК. [33] Гираза, определяемая геномом незараженной E. coli, также, по-видимому, участвует в рекомбинационной репарации, обеспечивая точку инициации для взаимного обмена цепями, управляемого белком RecA. [34]

Ссылки

  1. ^ Deweese JE, Osheroff N (февраль 2009 г.). «Реакция расщепления ДНК топоизомеразой II: волк в овечьей шкуре». Nucleic Acids Research . 37 (3): 738–748. doi :10.1093/nar/gkn937. PMC  2647315. PMID  19042970 .
  2. ^ Reece RJ, Maxwell A (1991). «ДНК-гираза: структура и функция». Критические обзоры по биохимии и молекулярной биологии . 26 (3–4): 335–375. doi :10.3109/10409239109114072. PMID  1657531.
  3. ^ ab Рыбенков ВВ, Ульспергер С, Вологодский АВ, Коццарелли Н.Р. (август 1997). «Упрощение топологии ДНК ниже равновесных значений с помощью топоизомераз типа II». Science . 277 (5326). New York, NY: 690–3. doi :10.1126/science.277.5326.690. PMID  9235892.
  4. ^ Вологодский АВ, Чжан В, Рыбенков ВВ, Подтележников AA, Субраманиан Д, Гриффит Дж. Д., Коццарелли Н. Р. (март 2001 г.). «Механизм упрощения топологии топоизомеразами ДНК типа II». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (6): 3045–9. Bibcode :2001PNAS...98.3045V. doi : 10.1073/pnas.061029098 . PMC 30604 . PMID  11248029. 
  5. ^ Reece RJ, Maxwell A (январь 1991). «ДНК-гираза: структура и функция». Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology . 26 (3–4): 335–75. doi :10.3109/10409239109114072. PMID  1657531.
  6. ^ Buhler C, Lebbink JH, Bocs C, Ladenstein R, Forterre P (октябрь 2001 г.). «ДНК-топоизомераза VI генерирует АТФ-зависимые двухцепочечные разрывы с двухнуклеотидными выступами». Журнал биологической химии . 276 (40): 37215–22. doi : 10.1074/jbc.M101823200 . PMID  11485995. S2CID  24354635.
  7. ^ ab PDB : 1zvt ​; Corbett KD, Schoeffler AJ, Thomsen ND, Berger JM (август 2005 г.). «Структурная основа субстратной специфичности ДНК-топоизомеразы IV». Журнал молекулярной биологии . 351 (3): 545–61. doi :10.1016/j.jmb.2005.06.029. PMID  16023670.
  8. ^ Wigley DB, Davies GJ, Dodson EJ, Maxwell A, Dodson G (июнь 1991 г.). «Кристаллическая структура N-концевого фрагмента белка ДНК-гиразы B». Nature . 351 (6328): 624–9. Bibcode :1991Natur.351..624W. doi :10.1038/351624a0. PMID  1646964. S2CID  4373125.
  9. ^ ab PDB : 1PVG ​; Classen S, Olland S, Berger JM (сентябрь 2003 г.). «Структура области АТФазы топоизомеразы II и механизм ее ингибирования химиотерапевтическим агентом ICRF-187». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (19): 10629–34. Bibcode :2003PNAS..10010629C. doi : 10.1073/pnas.1832879100 . PMC 196855 . PMID  12963818. 
  10. ^ Wei H, Ruthenburg AJ, Bechis SK, Verdine GL (ноябрь 2005 г.). «Движение домена, зависящее от нуклеотидов, в домене АТФазы ДНК-топоизомеразы человека типа IIA» (PDF) . Журнал биологической химии . 280 (44): 37041–7. doi : 10.1074/jbc.M506520200 . PMID  16100112. S2CID  35186716.
  11. ^ Aravind L, Leipe DD, Koonin EV (сентябрь 1998 г.). "Toprim — консервативный каталитический домен в топоизомеразах типа IA и II, праймазах типа DnaG, нуклеазах семейства OLD и белках RecR". Nucleic Acids Research . 26 (18): 4205–13. doi :10.1093/nar/26.18.4205. PMC 147817 . PMID  9722641. 
  12. ^ PDB : 1BGW ; Berger JM, Gamblin SJ, Harrison SC, Wang JC (январь 1996). «Структура и механизм ДНК-топоизомеразы II». Nature . 379 (6562): 225–32. Bibcode : 1996Natur.379..225B. doi : 10.1038/379225a0. PMID  8538787. S2CID  4360011.
  13. ^ PDB : 1AB4 ​; Morais Cabral JH, Jackson AP, Smith CV, Shikotra N, Maxwell A, Liddington RC (август 1997 г.). «Кристаллическая структура домена разрыва-воссоединения ДНК-гиразы». Nature . 388 (6645): 903–6. Bibcode :1997Natur.388..903M. doi : 10.1038/42294 . PMID  9278055. S2CID  4320715.
  14. ^ PDB : 1BJT ​; Fass D, Bogden CE, Berger JM (апрель 1999). «Четвертичные изменения в топоизомеразе II могут направлять ортогональное движение двух цепей ДНК». Nature Structural Biology . 6 (4): 322–6. doi :10.1038/7556. PMID  10201398. S2CID  947461.
  15. ^ PDB : 2RGR ; Dong KC, Berger JM (декабрь 2007 г.). «Структурная основа распознавания и изгибания воротной ДНК топоизомеразами типа IIA». Nature . 450 (7173): 1201–5. Bibcode : 2007Natur.450.1201D. doi : 10.1038/nature06396. PMID  18097402. S2CID  1756317.
  16. ^ Vanden Broeck A, Lotz C, Ortiz J, Lamour V (октябрь 2019 г.). "Крио-ЭМ-структура полного комплекса нуклеопротеина ДНК-гиразы E. coli". Nature Communications . 10 (1): 4935. Bibcode :2019NatCo..10.4935V. doi :10.1038/s41467-019-12914-y. PMC 6821735 . PMID  31666516. 
  17. ^ PDB : 1SUU ; Corbett KD, Shultzaberger RK, Berger JM (май 2004 г.). «C-концевой домен ДНК-гиразы A принимает изгибающую ДНК бета-вертушку». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (19): 7293–8. Bibcode : 2004PNAS..101.7293C. doi : 10.1073/pnas.0401595101 . PMC 409912. PMID  15123801 . 
  18. ^ PDB : 1MU5 ​; Corbett KD, Berger JM (январь 2003 г.). «Структура субъединицы топоизомеразы VI-B: значение для механизма и эволюции топоизомеразы типа II». The EMBO Journal . 22 (1): 151–63. doi :10.1093/emboj/cdg008. PMC 140052 . PMID  12505993. 
  19. ^ Bergerat A, de Massy B, Gadelle D, Varoutas PC, Nicolas A, Forterre P (март 1997). "Атипичная топоизомераза II из Archaea с последствиями для мейотической рекомбинации". Nature . 386 (6623): 414–7. Bibcode :1997Natur.386..414B. doi :10.1038/386414a0. PMID  9121560. S2CID  4327493.
  20. ^ PDB : 2Q2E ​; Corbett KD, Benedetti P, Berger JM (июль 2007 г.). «Сборка голофермента и АТФ-опосредованная конформационная динамика топоизомеразы VI». Nature Structural & Molecular Biology . 14 (7): 611–9. doi :10.1038/nsmb1264. PMID  17603498. S2CID  2159631.
  21. ^ Roca J, Wang JC (май 1994). «Транспорт ДНК ДНК-топоизомеразой типа II: доказательства в пользу двухзатворного механизма». Cell . 77 (4): 609–16. doi :10.1016/0092-8674(94)90222-4. PMID  8187179. S2CID  19776252.
  22. ^ Berger JM, Wang JC (февраль 1996). "Последние разработки в области структуры и механизма ДНК-топоизомеразы II". Current Opinion in Structural Biology . 6 (1): 84–90. doi :10.1016/s0959-440x(96)80099-6. PMID  8696977.
  23. ^ Альбертс Б. (2014-11-18). Молекулярная биология клетки (шестое изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк. ISBN 978-0-8153-4432-2. OCLC  887605755.{{cite book}}: CS1 maint: отсутствует местоположение издателя ( ссылка )
  24. ^ Willmore E, de Caux S, Sunter NJ, Tilby MJ, Jackson GH, Austin CA, Durkacz BW (июнь 2004 г.). «Новый ингибитор ДНК-зависимой протеинкиназы NU7026 усиливает цитотоксичность ядов топоизомеразы II, используемых при лечении лейкемии». Blood . 103 (12): 4659–65. doi : 10.1182/blood-2003-07-2527 . PMID  15010369.
  25. ^ Liu LF , Liu CC, Alberts BM (октябрь 1979). "Топоизомераза ДНК T4: новый АТФ-зависимый фермент, необходимый для инициации репликации ДНК бактериофага T4". Nature . 281 (5731): 456–61. Bibcode : 1979Natur.281..456L. doi : 10.1038/281456a0. PMID  226889. S2CID  4343962.
  26. ^ Stetler GL, King GJ, Huang WM (август 1979). «T4 DNA-delay proteins, required for specific DNA replication, form a complex that have ATP-dependent DNA topoisomerase activity». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 76 (8): 3737–41. Bibcode :1979PNAS...76.3737S. doi : 10.1073/pnas.76.8.3737 . PMC 383908 . PMID  226976. 
  27. ^ ab McCarthy D (январь 1979). «Зависимая от гиразы инициация репликации ДНК бактериофага T4: взаимодействие гиразы Escherichia coli с новобиоцином, кумермицином и продуктами гена задержки фаговой ДНК». Журнал молекулярной биологии . 127 (3): 265–83. doi :10.1016/0022-2836(79)90329-2. PMID  372540.
  28. ^ Huang WM (сентябрь 1986 г.). «52-белковая субъединица ДНК-топоизомеразы T4 гомологична белку gyrA гиразы». Nucleic Acids Research . 14 (18): 7379–90. PMC 311757. PMID  3020513 . 
  29. ^ Huang WM (октябрь 1986 г.). «Нуклеотидная последовательность гена топоизомеразы ДНК типа II. Ген бактериофага T4 39». Nucleic Acids Research . 14 (19): 7751–65. doi : 10.1093/nar/14.19.7751. PMC 311794. PMID  3022233. 
  30. ^ Маккарти Д., Миннер К., Бернстайн Х., Бернстайн К. (октябрь 1976 г.). «Скорости удлинения ДНК и распределение точек роста фага T4 дикого типа и мутанта с задержкой ДНК Amber». Журнал молекулярной биологии . 106 (4): 963–81. doi :10.1016/0022-2836(76)90346-6. PMID  789903.
  31. ^ Муфтий С., Бернштейн Х. (октябрь 1974 г.). «Мутанты бактериофага Т4 с задержкой ДНК». Журнал вирусологии . 14 (4): 860–71. doi :10.1128/JVI.14.4.860-871.1974. ПМЦ 355592 . ПМИД  4609406. 
  32. ^ Хайман П. (август 1993 г.). «Генетика эффекта Лурии-Латарже в бактериофаге Т4: доказательства участия множественных путей репарации ДНК». Genetical Research . 62 (1): 1–9. doi : 10.1017/s0016672300031499 . PMID  8405988.
  33. ^ Miskimins R, Schneider S, Johns V, Bernstein H (июнь 1982 г.). «Участие топоизомеразы в множественной реактивации фага T4». Genetics . 101 (2): 157–77. doi :10.1093/genetics/101.2.157. PMC 1201854 . PMID  6293912. 
  34. ^ Cassuto E (сентябрь 1984 г.). «Формирование ковалентно закрытой гетеродуплексной ДНК совместным действием гиразы и белка RecA». The EMBO Journal . 3 (9): 2159–64. doi :10.1002/j.1460-2075.1984.tb02106.x. PMC 557658. PMID  6092061 . 

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки

На Викискладе есть медиафайлы по теме ДНК-топоизомераза типа II .