Полипиримидиновый тракт — это область пре-мессенджерной РНК (мРНК), которая способствует сборке сплайсосомы , белкового комплекса, специализированного для проведения сплайсинга РНК в процессе посттранскрипционной модификации . Область богата пиримидиновыми нуклеотидами , особенно урацилом , и обычно имеет длину 15–20 пар оснований , расположенную примерно за 5–40 пар оснований до 3'-конца интрона , подлежащего сплайсингу. [1]
Ряд белковых факторов связываются или ассоциируются с полипиримидиновым трактом, включая компонент сплайсосомы U2AF и белок, связывающий полипиримидиновый тракт (PTB), который играет регуляторную роль в альтернативном сплайсинге . Основная функция PTB заключается в подавлении экзона , при котором определенная область экзона, обычно сплайсированная в зрелую мРНК, вместо этого исключается, что приводит к экспрессии изоформы белка , кодируемого мРНК . Поскольку PTB повсеместно экспрессируется во многих высших эукариотах , считается, что он подавляет включение «слабых» экзонов с плохо определенными сайтами сплайсинга . [2] Однако связывание PTB недостаточно для подавления «надежных» экзонов. [3]
Подавление или выбор экзонов имеет решающее значение для правильной экспрессии тканеспецифичных изоформ. Например, гладкие мышцы и скелетные мышцы экспрессируют альтернативные изоформы, отличающиеся взаимоисключающим выбором экзонов в альфа- тропомиозине . [4]