2000–01 Кипрский третий дивизион был 30-м сезоном Кипрской футбольной лиги третьего уровня. ASIL Lysi выиграл свой первый титул.
В третьем дивизионе Кипра 2000–01 участвовало четырнадцать команд. Все команды играли друг с другом дважды, один раз дома и один раз на выезде. Команда, набравшая наибольшее количество очков в конце сезона, становилась чемпионом. Первые три команды были переведены во второй дивизион Кипра 2001–02 , а последние три команды были переведены в четвертый дивизион Кипра 2001–02 .
За победу команды получали три очка, за ничью — одно очко, за поражение — ноль очков.
Команды, вышедшие во Второй дивизион Кипра 2000–01
Команды, выбывшие из второго дивизиона Кипра 1999–2000 гг.
Команды, вышедшие из 1999–2000 гг. в Четвертый дивизион Кипра
Команды, вылетевшие в кипрский четвертый дивизион 2000–01 гг.