stringtranslate.com

Согласованность (генетика)

В генетике конкордантность — это вероятность того , что пара индивидуумов будет иметь определенную характеристику ( фенотипический признак ), при условии, что один из пары имеет эту характеристику. Конкордантность можно измерить с помощью коэффициентов конкордантности , отражающих вероятность того, что один человек будет иметь признак, если другой его имеет. Важные клинические примеры включают вероятность того, что у потомства будет определенное заболевание, если оно есть у матери, если оно есть у отца или если оно есть у обоих родителей. Конкордантность среди братьев и сестер также представляет интерес: каковы шансы того, что у последующего потомка будет заболевание, если оно есть у старшего ребенка? В исследованиях конкордантность часто обсуждается в контексте обоих членов пары близнецов . Близнецы конкордантны, когда у обоих есть или у обоих отсутствует заданный признак. [1] Идеальным примером конкордантности являются однояйцевые близнецы , потому что геном одинаков, эквивалентность, которая помогает обнаружить причинно-следственную связь посредством деконфаундинга , относительно генетических эффектов по сравнению с эпигенетическими и экологическими эффектами ( природа по сравнению с воспитанием ).

Напротив, дискордантность возникает, когда схожие черты не являются общими для людей. Исследования близнецов показали, что генетические черты монозиготных близнецов полностью конкордантны, тогда как у дизиготных близнецов половина генетических черт конкордантны, а другая половина — дискордантны. Показатели дискордантности, которые выше показателей конкордантности, выражают влияние окружающей среды на черты близнецов. [2]

Исследования

Исследование близнецов сравнивает уровень конкордантности однояйцевых близнецов с уровнем конкордантности разнояйцевых близнецов. Это может помочь предположить, имеет ли заболевание или определенная черта генетическую причину. [3] Спорные применения данных близнецов рассматривали уровни конкордантности для гомосексуальности и интеллекта . Другие исследования включали изучение генетических и экологических факторов, которые могут привести к повышению уровня ЛПНП у женщин-близнецов. [4]

Поскольку однояйцевые близнецы генетически практически идентичны, из этого следует, что генетический шаблон, который несет один из них, с большой вероятностью будет также носить и другой. Если характеристика, выявленная у одного близнеца, вызвана определенным геном, то она с большой вероятностью будет присутствовать и у другого близнеца. Таким образом, уровень соответствия данной характеристики помогает предположить, связана ли характеристика с генетикой и в какой степени.

С этим предположением связано несколько проблем:

  1. Определенный генетический паттерн может не иметь 100% пенетрантности , и в этом случае он может иметь различные фенотипические последствия у генетически идентичных людей;
  2. Условия развития и окружающей среды могут быть разными для генетически идентичных людей. Если условия развития и окружающей среды способствуют развитию заболевания или другой характеристики, могут быть различия в исходе генетически идентичных людей;
  3. Логика еще больше усложняется, если характеристика полигенная , т. е. вызвана различиями более чем в одном гене.
  4. Эпигенетические эффекты могут изменять генетические выражения у близнецов посредством различных факторов. Выражение эпигенетического эффекта обычно слабее, когда близнецы молоды, и увеличивается по мере взросления однояйцевых близнецов. [5]
  5. Если при отсутствии одного или нескольких факторов окружающей среды состояние не разовьется у человека, даже при высоких показателях конкордантности, непосредственной причиной является окружающая среда с сильным генетическим влиянием: таким образом, «существенная роль генетических факторов не исключает возможности того, что развитие заболевания может быть изменено вмешательством окружающей среды». Таким образом, «предполагается, что генетические факторы способствуют развитию этого заболевания», но не могут считаться единственными причинными факторами. [6]

Генотипические исследования

В исследованиях генотипирования , где ДНК напрямую анализируется на позиции дисперсии (см. SNP ), конкордантность является мерой процента SNP , которые измерены как идентичные. Образцы от одного и того же человека или идентичных близнецов теоретически имеют конкордантность 100%, но из-за ошибок анализа и соматических мутаций они обычно находятся в диапазоне от 99% до 99,95%. Таким образом, конкордантность может использоваться как метод оценки точности платформы анализа генотипирования .

Поскольку ребенок наследует половину своей ДНК от каждого родителя, у родителей и детей, братьев и сестер, а также у разнояйцевых (дизиготных) близнецов конкордантность при использовании этого метода составляет в среднем 50%.

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ Левонтин Р. (март 1982). Человеческое разнообразие . Scientific American Press. ISBN 978-0-7167-1469-9.
  2. ^ "Конкордант против дискорданта – Исследования близнецов – Медикция" . Получено 2020-06-19 .
  3. ^ van den Berg SM, Hjelmborg JV (сентябрь 2012 г.). «Генетический анализ редких расстройств: байесовская оценка показателей конкордантности близнецов». Behavior Genetics . 42 (5): 857–65. doi :10.1007/s10519-012-9547-9. PMC 3442174 . PMID  22711379. 
  4. ^ Austin MA, Newman B, Selby JV, Edwards K, Mayer EJ, Krauss RM (май 1993). «Генетика фенотипов подкласса ЛПНП у женщин-близнецов. Анализ соответствия, наследуемости и смешивания». Артериосклероз и тромбоз . 13 (5): 687–95. doi : 10.1161/01.ATV.13.5.687 . PMID  8485120.
  5. ^ "Врожденные сходства у однояйцевых близнецов могут быть не такими уж сильными (однояйцевые близнецы могут быть более разными...)". Биомедицина . Архивировано из оригинала 2017-08-09 . Получено 2010-06-27 .
  6. ^ Thomsen SF, Stensballe LG, Skytthe A, Kyvik KO, Backer V, Bisgaard H (март 2008 г.). «Повышенная конкордантность тяжелой респираторно-синцитиальной вирусной инфекции у однояйцевых близнецов». Pediatrics . 121 (3): 493–6. doi :10.1542/peds.2007-1889. PMID  18310197. S2CID  5192096.