Центр биоинформатики — это междисциплинарное исследование в области биоинформатики в Копенгагенском университете (UCPH). Центр находится в секции вычислительной и РНК-биологии на кафедре биологии факультета естественных наук .
Программы
Центр биоинформатики отвечает за магистерскую программу по биоинформатике.
Организация
В центре есть четыре подгруппы, каждая из которых фокусируется на разных темах:
- Группа микро-РНК: микро-РНК — это небольшие молекулы РНК, играющие важную роль в регуляции экспрессии генов . Группа анализирует биологию микро-РНК с помощью вычислительных методов и разрабатывает инструменты, полезные для экспериментальных биологов.
- Группа некодирующих РНК: Многие молекулы РНК играют функциональную роль в клетке, которая отличается от классической роли служить шаблоном для синтеза белка . Группа работает над предсказанием вторичной структуры и множественным выравниванием некодирующих РНК .
- Группа анализа промотора: Группа разрабатывает статистические и биоинформатические методы для анализа регуляции транскрипции эукариотических генов . Это включает моделирование эпигенетики , сайтов связывания факторов транскрипции , основных промоутеров и сайтов начала транскрипции.
- Группа по структуре: группа разрабатывает методы прогнозирования трехмерной структуры белков и РНК на основе графических моделей и байесовских сетей , направленной статистики и методов Монте-Карло с использованием цепей Маркова . Группа также является ведущей областью исследований в области методов вероятностного программирования для прогнозирования структуры белков.
Люди
Центр возглавляет Андерс Крог , который был пионером в использовании скрытых марковских моделей в биоинформатике , совместно с Дэвидом Хаусслером . Центр также состоит из шести постдоков и около 17 аспирантов .
Внешние ссылки
- Сайт центра биоинформатики
55°41′57″с.ш. 12°33′25″в.д. / 55,6993°с.ш. 12,5569°в.д. / 55,6993; 12,5569
