Цистром

Проще говоря, цистрома относится к набору регуляторных элементов набора генов, включая сайты связывания факторов транскрипции и модификации гистонов. Более конкретно, «набор цис-действующих мишеней транс-действующего фактора в масштабе всего генома, также известный как in vivo геномное расположение сайтов связывания факторов транскрипции или модификаций гистонов ». ^[1] Термин цистрома является гибридом cistr ( от cistron ) + ome (от genome ). Термин цистрома был придуман исследователями из Института рака Дана-Фарбера и Гарвардской медицинской школы . ^[2]

Такие технологии, как иммунопреципитация хроматина в сочетании с микроматричным анализом « ChIP-on-chip » или с массивным параллельным секвенированием ДНК « ChIP-Seq », значительно облегчили определение цистрома факторов транскрипции и других белков, ассоциированных с хроматином .

Ссылки

1. Liu T, Ortiz JA, Taing L, Meyer CA, Lee B, Zhang Y, Shin H, Wong SS, Ma J, Lei Y, Pape UJ, Poidinger M, Chen Y, Yeung K, Brown M, Turpaz Y, Liu XS (2011). "Cistrome: интегративная платформа для исследований регуляции транскрипции". Genome Biol . 12 (8): R83. doi : 10.1186/gb-2011-12-8-r83 . PMC  3245621. PMID  21859476 .
2. "cistrome / FrontPage". PBWiki, Inc.

Дальнейшее чтение

• Lupien M, Eeckhoute J, Meyer CA, Wang Q, Zhang Y, Li W, Carroll JS, Liu XS, Brown M (март 2008 г.). "FoxA1 транслирует эпигенетические сигнатуры в транскрипцию, управляемую энхансером и специфичную для конкретной линии". Cell . 132 (6): 958–70. doi :10.1016/j.cell.2008.01.018. PMC  2323438 . PMID  18358809.
• Lupien M, Brown M (июнь 2009). «Цистромика гормонозависимого рака». Endocr. Relat. Cancer . 16 (2): 381–9. doi : 10.1677/ERC-09-0038 . PMID  19369485.