Чемпионат мира по суперспорту 2006 года был восьмым сезоном чемпионата мира по суперспорту FIM — десятым, если учесть два сезона, прошедших под названием Supersport World Series. Сезон начался 25 февраля в Лосаиле и закончился 8 октября в Маньи-Куре после 12 гонок.
Чемпионат среди гонщиков выиграл Себастьен Шарпантье, одержавший в общей сложности 6 побед в гонках. Это был второй чемпионат мира по суперспорту для Шарпантье. Чемпионат среди производителей выиграла Honda.