Эхиномицин — пептидный антибиотик . Это димер двух пептидов, создающих циклическую структуру. Он содержит бициклический ароматический хромофор, который присоединен к димеризованному циклическому пептидному ядру и тиоацетальному мостику. Он интеркалирует в ДНК в двух специфических местах, тем самым блокируя связывание фактора 1 альфа, индуцируемого гипоксией (HIF1alpha). [1]
Эхиномицин является бис-интеркаляторным пептидом и биосинтезируется уникальной нерибосомальной пептидсинтетазой (NRPS). [2] [3] Эхиномицин выделяют из различных бактерий, таких как Streptomyces lasalienis . Он принадлежит к семейству хиноксалиновых антибиотиков . Эта группа соединений вызывает большой интерес, поскольку они обладают очень мощной антибактериальной, противораковой и противовирусной активностью. [4]
Биосинтез эхиномицина начинается с молекулы QC. L-триптофан является предшественником QC, и его биосинтез параллелен первой стадии биосинтеза никкомицина . [ необходима цитата ]
После биосинтеза QC домен аденилирования , содержащий Ecm1, активируется и переносит QC в FabC с использованием белка-переносчика ацила биосинтеза жирных кислот (ACP). Первый модуль, Ecm6, принимает QC-SFabC в качестве стартовой единицы. Emc7 содержит терминальный домен тиоэстеразы , который позволяет пептиду димеризоваться и затем высвобождаться. Затем этот циклизованный продукт переходит в Ecm17, оксидоредуктазу, создавая дисульфидную связь. Последний шаг в этом биосинтезе преобразует дисульфидную связь в тиоацетальный мостик. Это преобразование происходит в Ecm18, метилтрансферазе, зависящей от S-аденозил-L-метионина (SAM) . [4] Предполагается, что механизм проходит в два этапа. Первоначально Emc18 переносит активированную метильную группу с SAM на один из атомов серы в дисульфидной связи. Во-вторых, депротонирование альфа-протона в третичный сульфониевый катион способствует перегруппировке для образования тиоацетальной связи. [ необходима цитата ]