Белок с рецепторной структурой, но с неидентифицированным лигандом
В биохимии рецептор -сирота — это белок, имеющий структуру, схожую с другими идентифицированными рецепторами , но эндогенный лиганд которого еще не идентифицирован. Если лиганд для рецептора-сироты обнаруживается позже, рецептор называют «усыновленным сиротой». [1] И наоборот, термин «лиганд-сирота» относится к биологическому лиганду, родственный рецептор которого еще не идентифицирован.
Примеры
Примерами рецепторов-сирот являются семейства рецепторов, сопряженных с G-белком (GPCR) [2] [3] [4] и ядерных рецепторов [5] [6] [7] .
Если найден эндогенный лиганд, рецептор-сирота «усыновляется» или «де-сиротируется». [8] Примером является ядерный рецептор фарнезоид X рецептор (FXR) и рецептор желчной кислоты, связанный с белком GPCR TGR5/GPCR19/G , оба из которых активируются желчными кислотами . [9] Принятые рецепторы-сироты в группе ядерных рецепторов включают FXR, рецептор X печени (LXR) и рецептор, активируемый пролифератором пероксисом (PPAR). Другим примером сайта рецептора-сироты является сайт связывания PCP в рецепторе NMDA , [10] тип лиганд-управляемого ионного канала . Это сайт, где работает рекреационный наркотик PCP, но ни один эндогенный лиганд не связывается с этим сайтом.
Сиротские рецепторы GPCR обычно получают название «GPR» с последующим номером, например GPR1 . В семействе GPCR около 100 генов, подобных рецепторам, остаются сиротами. [11]
Открытие
Исторически рецепторы были обнаружены с помощью лигандов для «выуживания» их рецепторов. Следовательно, по определению, эти рецепторы не были сиротами. Однако с помощью современных методов молекулярной биологии, таких как обратная фармакология , скрининг библиотек кДНК и секвенирование всего генома , рецепторы были идентифицированы на основе сходства последовательностей с известными рецепторами, без знания того, какие у них лиганды.
Ссылки
- ^ Нандури, Равикант; Бутани, Иша; Сомаварапу, Арун Кумар; Махаджан, Сахил; Паркеш, Раман; Гупта, Паван (1 января 2015 г.). «ONRLDB - база данных экспериментально проверенных лигандов для орфанных ядерных рецепторов, созданная вручную: взгляд на открытие новых лекарств». База данных . 2015 : bav112. doi : 10.1093/база данных/bav112. ПМК 4669993 . ПМИД 26637529.
- ^ Levoye A, Dam J, Ayoub MA, Guillaume JL, Jockers R (2006). «Имеют ли рецепторы, связанные с сиротским G-белком, лиганд-независимые функции? Новые идеи из гетеродимеров рецепторов». EMBO Rep . 7 (11): 1094–8. doi :10.1038/sj.embor.7400838. PMC 1679777. PMID 17077864 .
- ^ Civelli O, Saito Y, Wang Z, Nothacker HP, Reinscheid RK (2006). «Одинокие GPCR и их лиганды». Pharmacol Ther . 110 (3): 525–32. doi :10.1016/j.pharmthera.2005.10.001. PMID 16289308.
- ^ Wise A, Jupe SC, Rees S (2004). «Идентификация лигандов в рецепторах, сопряженных с сиротским G-белком». Annu Rev Pharmacol Toxicol . 44 (февраль): 43–66. doi :10.1146/annurev.pharmtox.44.101802.121419. PMID 14744238. S2CID 2618257.
- ^ Жигер V (октябрь 1999 г.). «Орфанные ядерные рецепторы: от гена к функции». Endocr. Rev. 20 ( 5): 689–725. doi : 10.1210/edrv.20.5.0378 . PMID 10529899.
- ^ Benoit G, Cooney A, Giguere V, Ingraham H , Lazar M, Muscat G, Perlmann T, Renaud JP, Schwabe J, Sladek F, Tsai MJ , Laudet V (2006). «Международный союз фармакологии. LXVI. Сиротские ядерные рецепторы». Pharmacol Rev . 58 (4): 798–836. doi :10.1124/pr.58.4.10. PMID 17132856. S2CID 2619263.
- ^ Shi Y (июнь 2007 г.). «Орфанные ядерные рецепторы в открытии лекарств». Drug Discov. Today . 12 (11–12): 440–5. doi :10.1016/j.drudis.2007.04.006. PMC 2748783. PMID 17532527 .
- ^ SHI, Y (2007). «Орфанные ядерные рецепторы в разработке лекарств». Drug Discovery Today . 12 (11–12): 440–445. doi :10.1016/j.drudis.2007.04.006. PMC 2748783. PMID 17532527 .
- ^ Mi LZ, Devarakonda S, Harp JM, Han Q, Pellicciari R, Willson TM, Khorasanizadeh S, Rastinejad F (апрель 2003 г.). «Структурная основа связывания желчных кислот и активации ядерного рецептора FXR». Mol. Cell . 11 (4): 1093–100. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00112-6 . PMID 12718893.
- ^ Fagg GE (май 1987). «Фенциклидин и родственные препараты связываются с активированным комплексом рецептор-канал N-метил-D-аспартата в мембранах мозга крыс». Neurosci. Lett . 76 (2): 221–7. doi :10.1016/0304-3940(87)90719-1. PMID 2438606. S2CID 23177400.
- ^ Laschet, C; Dupuis, N; Hanson, J (2018). «Ландшафт деорфанизации рецепторов, связанных с G-белком». Биохимическая фармакология . 153 : 62–74. doi : 10.1016/j.bcp.2018.02.016. PMID 29454621. S2CID 3566341.
Внешние ссылки
- «GPCR-сироты класса А». База данных руководства IUPHAR/BPS по фармакологии . Эдинбургский университет / Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии.
- «Класс адгезии GPCR». База данных IUPHAR/BPS Guide to PHARMACOLOGY . Эдинбургский университет / Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии.
- «GPCR-сироты класса C». База данных руководства IUPHAR/BPS по фармакологии . Эдинбургский университет / Международный союз фундаментальной и клинической фармакологии.