Сезон 1939 года в футбольном клубном турнире Кубка Митропы выиграл Уйпешт , который обыграл венгерский клуб Ференцварош со счетом 6–3 по сумме двух матчей в финале. Это был третий финал подряд для Ференцвароша и вторая и последняя победа Уйпешта в соревновании.
Это был 13-й выпуск турнира. Победители прошлого сезона «Славия» Прага были выбиты в четвертьфинале югославской командой «Београдски» .