Кубок Болгарии 1998–99 был 59-м сезоном Кубка Болгарии . ЦСКА София выиграл соревнование, обыграв Литекс Ловеч со счетом 1–0 в финале на стадионе Болгарска Армия в Софии . [1]
В этом туре приняли участие победители предварительных туров, а также команды из группы B.
В этом раунде приняли участие победители первого раунда и все команды группы А.