Meistriliiga 1998 года был восьмым сезоном Meistriliiga , высшей футбольной лиги Эстонии. Сезон был необычно коротким, сыгранным во второй половине 1998 года, чтобы вернуться к скандинавскому весенне-осеннему формату сезона в следующем году. Flora выиграла свой четвертый титул.
«Ээсти Пылевкиви Йыхви» выиграла по сумме двух матчей со счетом 5–2 и сохранила за собой место в Мейстрилиге на сезон 1999 года .