Хорватская первая футбольная лига 1999–2000 годов была девятым сезоном Хорватской первой футбольной лиги , национального чемпионата для мужских футбольных команд в Хорватии , с момента его создания в 1992 году. Сезон начался 24 июля 1999 года и закончился 13 мая 2000 года. Динамо Загреб (Хорватия Загреб в осеннем сезоне) было действующим чемпионом, выиграв свой девятый чемпионский титул в предыдущем сезоне, и они снова защитили титул после победы над Риекой 6 мая 2000 года.
Расписание состояло из трех раундов. В течение первых двух раундов каждая команда играла друг с другом по одному разу дома и на выезде, в общей сложности 22 матча. Пары третьего раунда затем были установлены в соответствии с турнирной таблицей после первых двух раундов, давая каждой команде третью игру против каждого соперника, в общей сложности 33 игры на команду.
