Кубок Африки 2006 года стал седьмым выпуском турнира по регби самого высокого уровня в Африке. В этом выпуске турнир расширился с девяти стран до двенадцати, что привело к изменению формата турнира, который теперь включает четыре группы по три команды. Результаты групп 1 и 2 также учитывались в квалификации Кубка мира по регби 2007 года .
Группы 1 и 2 играли на домашней и выездной основе, поскольку они также учитывались во 2-м раунде квалификации Кубка мира по регби 2007. Победители групп выходят в полуфинал.
Второй полуфинал по домашним и выездным матчам из-за отборочного турнира чемпионата мира по регби 2007 года .
Южная Африка вышла в финал.
Намибия вышла в финальную часть чемпионата мира по регби 2007 года .