Кубок Чехии 2006–07 был 14-м выпуском ежегодного футбольного турнира на выбывание, организованного Чешской футбольной ассоциацией Чешской Республики . Он начался 22 июля 2006 года предварительным раундом и завершился финалом 24 мая 2007 года.
«Спарта» Прага одержала победу в Кубке 24 мая 2007 года и квалифицировалась в Кубок УЕФА 2007–08, но поскольку в том же сезоне они также квалифицировались в Лигу чемпионов через Чешскую первую лигу , место досталось «Яблонецу 97» , занявшему второе место.
Предварительный тур состоялся 22 июля 2006 года.
Первый тур состоялся 29 июля 2006 года.
Второй тур состоялся 3 августа 2006 года.
Третий тур состоялся 20 сентября 2006 года.
Четвертый тур состоялся 25 октября 2006 года.
Четвертьфиналы состоялись 25 апреля 2007 года.
Полуфиналы состоялись 16 и 17 мая 2007 года.