stringtranslate.com

АДАР

Семейство ферментов аденозиндезаминазы, специфичных для двухцепочечной РНК, кодируется генами семейства ADAR . [ 5] ADAR означает аденозиндезаминазу, действующую на РНК . [6] [7] В этой статье основное внимание уделяется белкам ADAR. В этой статье подробно описывается эволюционная история, структура, функции, механизмы и важность всех белков этого семейства. [5]

Ферменты ADAR связываются с двухцепочечной РНК (dsRNA) и преобразуют аденозин в инозин ( гипоксантин ) путем дезаминирования . [8] Белки ADAR действуют посттранскрипционно, изменяя содержание нуклеотидов РНК. [9] Преобразование аденозина в инозин (A в I) в РНК нарушает нормальное спаривание A:U, дестабилизируя РНК. Инозин структурно похож на гуанин (G), что приводит к связыванию инозина с цитозином (I:C). [10] Инозин обычно имитирует гуанозин во время трансляции, но также может связываться с урацилом, цитозином и аденозином, хотя это не приветствуется.

Изменения кодонов могут возникать в результате редактирования РНК, что приводит к изменениям в кодирующих последовательностях белков и их функциях. [11] Большинство участков редактирования находятся в некодирующих областях РНК, таких как нетранслируемые области (UTR), элементы Alu и длинные перемежающиеся ядерные элементы (LINE). [12] Изменения кодонов могут приводить к альтернативным вариантам транскрипционного сплайсинга. ADAR влияет на транскриптом независимыми от редактирования способами, вероятно, путем вмешательства в другие связывающие РНК белки. [9]

Мутации в этом гене связаны с несколькими заболеваниями, включая ВИЧ, корь и меланому. Недавние исследования подтверждают связь между редактированием РНК и расстройствами нервной системы, такими как боковой амиотрофический склероз (БАС). Атипичное редактирование РНК, связанное с ADAR, может также коррелировать с психическими расстройствами, такими как шизофрения, эпилепсия и суицидальная депрессия. [13]

Открытие

Фермент ADAR и связанный с ним ген были случайно обнаружены в 1987 году в результате исследований Бренды Басс и Гарольда Вайнтрауба . [14] Эти исследователи использовали ингибирование антисмысловой РНК , чтобы определить, какие гены играют ключевую роль в развитии эмбрионов Xenopus laevis . Предыдущие исследования ооцитов Xenopus были успешными. Однако, когда Басс и Вайнтрауб применили идентичные протоколы к эмбрионам Xenopus , они не смогли определить гены развития эмбриона. Чтобы понять, почему метод оказался неудачным, они начали сравнивать дуплексную РНК как в ооцитах, так и в эмбрионах. Это привело их к открытию регулируемой развитием активности, которая денатурирует гибриды РНК:РНК в эмбрионах.

В 1988 году Ричард Вагнер и др. продолжили изучение активности, происходящей на эмбрионах Xenopus . [15] Они определили, что белок отвечает за раскручивание РНК из-за отсутствия активности после обработки протеиназой . Этот белок специфичен для dsRNA и не требует АТФ . Стало очевидно, что активность этого белка на dsRNA изменяет ее за пределами точки регибридизации, но не полностью денатурирует ее. Наконец, исследователи определили, что это раскручивание происходит из-за дезаминирования остатков аденозина в инозин . Эта модификация приводит к несовпадающему спариванию оснований между инозином и уридином , что приводит к дестабилизации и раскручиванию dsRNA.

Эволюция и функционирование

ADAR являются одной из наиболее распространенных форм редактирования РНК и обладают как селективной, так и неселективной активностью. [16] ADAR способен изменять и регулировать выход генного продукта, поскольку инозин интерпретируется клеткой как гуанозин . ADAR может изменять функциональность малых молекул РНК. Недавно ADAR также были обнаружены как регуляторы сплайсинга и биогенеза circRNA с их способностью к редактированию или функцией связывания РНК. [17] [18] [19] Считается, что ADAR произошел от ADAT (аденозиндезаминаза, действующая на тРНК), критического белка, присутствующего у всех эукариот , в начале периода метазоа посредством добавления домена связывания dsRNA . Это, вероятно, произошло в линии, которая ведет к короне Metazoa. Когда дублирующий ген ADAT был связан с другим геном, который кодировал по крайней мере одно связывание двухцепочечной РНК. Семейство генов ADAR в значительной степени сохранялось на протяжении всей истории его существования. Это, наряду с его присутствием в большинстве современных типов , указывает на то, что редактирование РНК имеет важное значение в регуляции генов для многоклеточных организмов. ADAR не был обнаружен у множества неметазойных эукариот, таких как растения , грибы и хоанофлагелляты .

Предполагается, что ADAR выполняют две функции: увеличивают разнообразие протеома, вызывая создание безвредных негеномно кодируемых белков, и защищают важные трансляционные сайты. Традиционно считается, что их основная роль заключается в увеличении разнообразия транскриптов и расширении вариации белков, способствуя эволюции белков. [5]

Формы ферментов ADAR

У млекопитающих существует три типа ферментов ADAR: ADAR (ADAR1), ADARB1 (ADAR2) и ADARB2 (ADAR3). [5]

АДАР (ADAR1) и АДАР2 (ADARB1)

ADAR один и два встречаются в различных тканях организма. Эти две формы ADAR также каталитически активны, что означает, что они могут использоваться в качестве катализатора в реакции. Обе формы также имеют схожие структуры паттернов экспрессии белков и требуют субстратных двухцепочечных структур РНК. [11]  Однако они различаются по своей редактирующей активности, поскольку и ADAR один, и ADAR два могут редактировать пре-мРНК GluR-B на участке R/G, и только ADAR2 может изменять участок Q/R. [20] Было обнаружено, что ADAR1 имеет две изоформы, ADAR1p150 и ADARp110. ADAR1p110 обычно находится в ядре, в то время как ADAR1p150 перемещается между ядром и цитоплазмой, в основном присутствуя в цитоплазме.

АДАР3 (АДАРБ2)

ADAR 3 отличается от двух других форм ADAR тем, что он обнаруживается только в мозговой ткани. Он также считается неактивным, когда дело касается каталитической активности. [11] Было обнаружено, что ADAR3 связан с памятью и обучением у мышей, что показывает, что он играет важную роль в нервной системе. Исследования in vitro также показали, что ADAR3 может играть роль в регуляции ADAR один и два. [21]

Каталитическая активность

Биохимическая реакция

ADAR катализируют реакцию гидролитического дезаминирования аденозина в инозин. [8] Активированная молекула воды будет реагировать с аденозином в реакции нуклеофильного замещения с аминогруппой углерода-6. Гидратированное промежуточное соединение будет существовать в течение короткого периода времени, затем аминогруппа уйдет в виде иона аммиака.

Активный сайт

У людей ферменты ADAR имеют два-три аминоконцевых домена связывания dsRNA (dsRBD) и один карбоксиконцевой домен каталитической дезаминазы. [22] В dsRBD имеется консервативная конфигурация α-β-β-β-α. [11] ADAR1 содержит две области для связывания Z-ДНК, известные как Zα и Zβ. [23] [24] ADAR2 и ADAR3 имеют богатый аргинином одноцепочечный домен связывания РНК (ssRNA). Была решена кристаллическая структура ADAR2. [22] В активном центре фермента находится остаток глутаминовой кислоты (E396), который образует водородные связи с водой. Гистидин (H394) и два остатка цистеина (C451 и C516) координируются с ионом цинка . Цинк активирует молекулу воды для нуклеофильного гидролитического дезаминирования. В каталитическом ядре находится инозитолгексакисфосфат (IP6), который стабилизирует остатки аргинина и лизина .

Активный сайт ADAR1

Димеризация

У млекопитающих преобразование из A в I требует гомодимеризации ADAR1 и ADAR2, но не ADAR3. [11] Исследования in vivo не дали окончательного ответа, требуется ли связывание РНК для димеризации. Исследование с мутантами семейства ADAR показало, что мутанты не способны связываться с dsRNA, но все еще способны димеризоваться , что предполагает, что они могут связываться на основе белок-белковых взаимодействий. [11] [25]

Роль в заболевании

Синдром Айкарди–Гутьера и двусторонний некроз/дистония полосатого тела

ADAR1 — один из нескольких генов, мутации которых часто способствуют развитию синдрома Айкарди–Гутьера . [26] Синдром Айкарди–Гутьера — это генетическое воспалительное заболевание, поражающее в первую очередь кожу и мозг, и оно характеризуется высоким уровнем IFN-α в спинномозговой жидкости. [27] Воспаление вызвано неправильной активацией генов, индуцируемых интерфероном, таких как гены, активируемые для борьбы с вирусными инфекциями. Мутация и потеря функции ADAR1 предотвращает дестабилизацию двухцепочечной РНК (dsRNA). [28] Это накопление dsRNA стимулирует выработку IFN без вирусной инфекции, вызывая воспалительную реакцию и аутоиммунный ответ. [29] Фенотип у мышей с нокаутом восстанавливается формой p150 ADAR1, содержащей домен Zα, который специфически связывается с левосторонней двухцепочечной конформацией, обнаруженной в Z-ДНК и Z-РНК, но не изоформой p110, в которой отсутствует этот домен. [30] У людей мутация P193A в домене Zα является причиной синдрома Айкарди–Гутьера [26] и более тяжелого фенотипа, обнаруженного при двустороннем некрозе/дистонии полосатого тела. [31] Результаты устанавливают биологическую роль левосторонней конформации Z-ДНК. [32]

Боковой амиотрофический склероз (БАС)

В двигательных нейронах наиболее обоснованным маркером бокового амиотрофического склероза (БАС) является ДНК-связывающий белок TAR (TDP-43) . При сбое редактирования РНК из-за снижения регуляции TDP-43 двигательные нейроны, лишенные ферментов ADAR2, экспрессируют нерегулируемый, что приводит к аномально проницаемым каналам Ca 2+ . У мышей с нокаутом ADAR2 наблюдаются признаки фенотипического сходства БАС. Современные исследователи разрабатывают молекулярную таргетную терапию путем нормализации экспрессии ADAR2. [33]

Рак

(ADAR)-индуцированное редактирование РНК A-to-I может вызывать опасные мутации аминокислот . Редактирование мРНК обычно вызывает миссенс-мутации, приводящие к изменениям в начальных и конечных областях трансляции. Однако могут происходить критические изменения аминокислот, приводящие к изменению функции нескольких клеточных процессов. Изменения аминокислот могут приводить к структурным изменениям белка во вторичной, третичной и четвертичной структурах. Исследователи наблюдали высокие уровни онкогенетического редактирования A-to-I в предшественниках кольцевой РНК, что напрямую подтверждает связь ADAR с раком. Список сайтов редактирования РНК, связанных с опухолями, можно найти здесь. [34]

Гепатоцеллюлярная карцинома

Исследования пациентов с гепатоцеллюлярной карциномой (ГЦК) показали тенденции к повышенной регуляции ADAR1 и пониженной регуляции ADAR2. Результаты показывают, что нерегулярная регуляция ответственна за нарушенный паттерн редактирования A в I, наблюдаемый при ГЦК, и что ADAR1 действует как онкоген в этом контексте, в то время как ADAR2 обладает опухолесупрессивной активностью. [35] Дисбаланс в экспрессии ADAR может изменить частоту переходов A в I в области кодирования белка генов, что приводит к мутациям белков, которые и управляют заболеванием. Дисрегуляция ADAR1 и ADAR2 может использоваться в качестве возможного прогностического маркера.

Меланома

Исследования показали, что потеря ADAR1 способствует росту меланомы и метастазированию. Ферменты ADAR могут воздействовать на микроРНК и влиять на ее биогенез, стабильность и/или ее цель связывания. [36] ADAR1 может подавляться белком связывания элемента cAMP-ответа (CREB), ограничивая его способность воздействовать на микроРНК. [37] Одним из таких примеров является miR-455-5p, который редактируется ADAR1. Когда ADAR подавляется CREB, неотредактированный miR-455-5p подавляет белок-супрессор опухоли, называемый CPEB1, способствуя прогрессированию меланомы в модели in vivo.

Симметричный наследственный дисхроматоз (DSH1)

Мутация Gly1007Arg в ADAR1, а также другие укороченные версии, рассматриваются как причина некоторых случаев DSH1. [38] Это заболевание характеризуется гиперпигментацией рук и ног и может встречаться в японских и китайских семьях.

ВИЧ

Было показано, что уровни экспрессии белка ADAR1 повышаются во время ВИЧ- инфекции, и было высказано предположение, что он отвечает за мутации A в G в геноме ВИЧ, ингибируя репликацию. [39] Мутация в геноме ВИЧ, вызванная ADAR1, может в некоторых случаях приводить к полезным вирусным мутациям, которые могут способствовать устойчивости к препаратам.

[37]

Вирусная активность

Противовирусное средство

ADAR1 — это интерферон ( IFN )-индуцируемый белок (высвобождаемый клеткой в ​​ответ на патоген или вирус), способный помогать в иммунном пути клетки. Доказательства показывают устранение репликона HCV , лимфоцитарного хориоменингита LCMV и полиомавируса . [40] [41]

Провирусный

ADAR1 является провирусным в других обстоятельствах. Редактирование ADAR1 от A до I было обнаружено во многих вирусах, включая вирус кори, [42] [41] [43] вирус гриппа, [44] вирус лимфоцитарного хориоменингита, [45] полиомавирус, [46] вирус гепатита дельта, [47] и вирус гепатита С. [48] Хотя ADAR1 был обнаружен в других вирусах, он был широко изучен только в нескольких. Исследования вируса кори показывают, что ADAR1 усиливает репликацию вируса посредством двух различных механизмов: редактирование РНК и ингибирование dsRNA-активируемой протеинкиназы ( PKR ). [40] [41] В частности, считается, что вирусы используют ADAR1 в качестве положительного фактора репликации, избирательно подавляя dsRNA-зависимые и противовирусные пути. [49]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000160710 – Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000027951 – Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ abcd Savva YA, Rieder LE, Reenan RA (декабрь 2012 г.). "Семейство белков ADAR". Genome Biology . 13 (12): 252. doi : 10.1186 /gb-2012-13-12-252 . PMC 3580408. PMID  23273215. 
  6. ^ «Ген Энтреза: Аденозиндезаминаза ADAR, действующая на РНК».
  7. ^ Ким У, Ван И, Сэнфорд Т, Цзэн И, Нишикура К (ноябрь 1994 г.). «Молекулярное клонирование кДНК для двухцепочечной РНК-аденозиндезаминазы, фермента-кандидата для редактирования ядерной РНК». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (24): 11457–11461. Bibcode : 1994PNAS...9111457K. doi : 10.1073/pnas.91.24.11457 . PMC 45250. PMID  7972084 . 
  8. ^ ab Samuel CE (2012). Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADARs) и редактирование A-to-I . Гейдельберг: Springer. ISBN 978-3-642-22800-1.
  9. ^ ab "ADAR". NCBI . Национальная медицинская библиотека США.
  10. ^ Licht K, Hartl M, Amman F, Anrather D, Janisiw MP, Jantsch MF (январь 2019). «Инозин вызывает контекстно-зависимую перекодировку и трансляционную остановку». Nucleic Acids Research . 47 (1): 3–14. doi :10.1093/nar/gky1163. PMC 6326813. PMID  30462291 . 
  11. ^ abcdef Nishikura K (7 июня 2010 г.). «Функции и регуляция редактирования РНК дезаминазами ADAR». Annual Review of Biochemistry . 79 (1): 321–349. doi :10.1146/annurev-biochem-060208-105251. PMC 2953425. PMID  20192758 . 
  12. ^ Tajaddod M, Jantsch MF, Licht K (март 2016 г.). «Динамический эпитранскриптом: редактирование от A до I модулирует генетическую информацию». Chromosoma . 125 (1): 51–63. doi :10.1007/s00412-015-0526-9. PMC 4761006 . PMID  26148686. 
  13. ^ Савва Я.А., Ридер Л.Е., Ринан Р.А. (декабрь 2012 г.). «Семейство белков ADAR». Геномная биология . 13 (12): 252. doi : 10.1186/gb-2012-13-12-252 . ПМК 3580408 . ПМИД  23273215. 
  14. ^ Samuel CE (март 2011 г.). «Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR), обладают как противовирусным, так и провирусным действием». Вирусология . 411 (2): 180–193. doi :10.1016/j.virol.2010.12.004. PMC 3057271. PMID  21211811 . 
  15. ^ Wagner RW, Smith JE, Cooperman BS, Nishikura K (апрель 1989 г.). «Двуцепочечная РНК-раскручивающая активность вносит структурные изменения посредством превращений аденозина в инозин в клетках млекопитающих и яйцах Xenopus». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 86 (8): 2647–2651. Bibcode : 1989PNAS...86.2647W. doi : 10.1073/pnas.86.8.2647 . PMC 286974. PMID  2704740 . 
  16. ^ Grice LF, Degnan BM (январь 2015 г.). «Происхождение семейства генов ADAR и редактирование РНК животных». BMC Evolutionary Biology . 15 (1): 4. Bibcode : 2015BMCEE..15....4G. doi : 10.1186/s12862-015-0279-3 . PMC 4323055. PMID  25630791 . 
  17. ^ Tang SJ, Shen H, An O, Hong H, Li J, Song Y и др. (февраль 2020 г.). «Цис- и транс-регуляции сплайсинга пре-мРНК ферментами редактирования РНК влияют на развитие рака». Nature Communications . 11 (1): 799. Bibcode :2020NatCo..11..799T. doi :10.1038/s41467-020-14621-5. PMC 7005744 . PMID  32034135. 
  18. ^ Hsiao YE, Bahn JH, Yang Y, Lin X, Tran S, Yang EW и др. (июнь 2018 г.). «Редактирование РНК в новообразованной РНК влияет на сплайсинг пре-мРНК». Genome Research . 28 (6): 812–823. doi :10.1101/gr.231209.117. PMC 5991522 . PMID  29724793. 
  19. ^ Shen H, An O, Ren X, Song Y, Tang SJ, Ke XY и др. (март 2022 г.). «ADAR действуют как мощные регуляторы кольцевого транскриптома при раке». Nature Communications . 13 (1): 1508. Bibcode :2022NatCo..13.1508S. doi :10.1038/s41467-022-29138-2. PMC 8938519 . PMID  35314703. 
  20. ^ Källman AM, Sahlin M, Ohman M (2003-08-15). "Редактирование ADAR2 A-->I: селективность сайта и эффективность редактирования являются отдельными событиями". Nucleic Acids Research . 31 (16): 4874–4881. doi :10.1093/nar/gkg681. ISSN  1362-4962. PMC 169957. PMID 12907730  . 
  21. ^ Wang Y, Chung DH, Monteleone LR, Li J, Chiang Y, Toney MD, Beal PA (2019-11-18). «Кандидаты связывания РНК для человеческого ADAR3 из субстратов мутанта с усилением функции, экспрессируемого в нейрональных клетках». Nucleic Acids Research . 47 (20): 10801–10814. doi :10.1093/nar/gkz815. ISSN  1362-4962. PMC 6846710. PMID 31552420  . 
  22. ^ аб Савва Я.А., Ридер Л.Е., Ринан Р.А. (декабрь 2012 г.). «Семейство белков ADAR». Геномная биология . 13 (12): 252. doi : 10.1186/gb-2012-13-12-252 . ПМК 3580408 . ПМИД  23273215. 
  23. ^ Шринивасан Б., Кусь К., Атанасиадис А. (август 2022 г.). «Термодинамический анализ взаимодействий домена Zα и нуклеиновой кислоты». Биохимический журнал . 479 (16): 1727–1741. doi : 10.1042/BCJ20220200 . PMID  35969150.
  24. ^ Габриэль Л., Шринивасан Б., Кусь К., Мата Дж. Ф., Жуан Аморим М., Янсен Л. Э., Атанасиадис А. (май 2021 г.). «Обогащение доменов Zα в гранулах цитоплазматического стресса обусловлено их врожденной способностью связываться с нуклеиновыми кислотами». Журнал клеточной науки . 134 (10): jcs258446. doi : 10.1242/jcs.258446 . PMID  34037233. S2CID  235202242.
  25. ^ Cho DS, Yang W, Lee JT, Shiekhattar R, Murray JM, Nishikura K (май 2003 г.). «Необходимость димеризации для РНК-редактирующей активности аденозиндезаминаз, действующих на РНК». Журнал биологической химии . 278 (19): 17093–17102. doi : 10.1074/jbc.M213127200 . PMID  12618436.
  26. ^ ab Rice GI, Kasher PR, Forte GM, Mannion NM, Greenwood SM, Szynkiewicz M, et al. (Ноябрь 2012). «Мутации в ADAR1 вызывают синдром Айкарди-Гутьера, связанный с сигнатурой интерферона I типа». Nature Genetics . 44 (11): 1243–1248. doi :10.1038/ng.2414. PMC 4154508 . PMID  23001123. 
  27. ^ Yang S, Deng P, Zhu Z, Zhu J, Wang G, Zhang L и др. (октябрь 2014 г.). «Аденозиндезаминаза, действующая на РНК 1, ограничивает обнаружение РНК RIG-I и подавляет выработку IFN в ответ на вирусные и эндогенные РНК». Журнал иммунологии . 193 (7): 3436–3445. doi :10.4049/jimmunol.1401136. PMC 4169998. PMID  25172485 . 
  28. ^ Галло А., Вукич Д., Михалик Д., О'Коннелл МА., Киган Л.П. (сентябрь 2017 г.). «Редактирование РНК ADAR при заболеваниях человека; больше, чем соответствует I». Генетика человека . 136 (9): 1265–1278. doi :10.1007/s00439-017-1837-0. PMID  28913566. S2CID  3754471.
  29. ^ Liddicoat BJ, Piskol R, Chalk AM, Ramaswami G, Higuchi M, Hartner JC и др. (сентябрь 2015 г.). «Редактирование РНК с помощью ADAR1 предотвращает восприятие MDA5 эндогенной dsRNA как не своей». Science . 349 (6252): 1115–1120. Bibcode :2015Sci...349.1115L. doi :10.1126/science.aac7049. PMC 5444807 . PMID  26275108. 
  30. ^ Ward SV, George CX, Welch MJ, Liou LY, Hahm B, Lewicki H и др. (январь 2011 г.). «Фермент редактирования РНК аденозиндезаминаза является фактором рестрикции для контроля репликации вируса кори, который также необходим для эмбриогенеза». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (1): 331–336. Bibcode : 2011PNAS..108..331W. doi : 10.1073 /pnas.1017241108 . PMC 3017198. PMID  21173229. 
  31. ^ Livingston JH, Lin JP, Dale RC, Gill D, Brogan P, Munnich A и др. (февраль 2014 г.). «Сигнатура интерферона I типа идентифицирует двусторонний некроз полосатого тела из-за мутаций в ADAR1». Журнал медицинской генетики . 51 (2): 76–82. doi :10.1136/jmedgenet-2013-102038. PMID  24262145. S2CID  8716360.
  32. ^ Herbert A (январь 2020 г.). «Менделирующая болезнь, вызванная вариантами, влияющими на распознавание Z-ДНК и Z-РНК доменом Zα фермента редактирования двухцепочечной РНК ADAR». European Journal of Human Genetics . 28 (1): 114–117. doi :10.1038/s41431-019-0458-6. PMC 6906422 . PMID  31320745. 
  33. ^ Ямашита Т, Квак С (июль 2019 г.). «Каскад клеточной смерти и молекулярная терапия в двигательных нейронах с дефицитом ADAR2 при БАС». Neuroscience Research . 144 : 4–13. doi : 10.1016/j.neures.2018.06.004. PMID  29944911. S2CID  49433496.
  34. ^ Wang H, Chen S, Wei J, Song G, Zhao Y (2021). «Редактирование РНК A-to-I при раке: от оценки уровня редактирования до изучения эффектов редактирования». Frontiers in Oncology . 10 : 632187. doi : 10.3389/fonc.2020.632187 . PMC 7905090. PMID  33643923 . 
  35. ^ Chan TH, Lin CH, Qi L, Fei J, Li Y, Yong KJ и др. (май 2014 г.). «Нарушенный баланс редактирования РНК, опосредованный ADAR (аденозиндеаминазами, действующими на РНК) при гепатоцеллюлярной карциноме человека». Gut . 63 (5): 832–843. doi :10.1136/gutjnl-2012-304037. PMC 3995272 . PMID  23766440. 
  36. ^ Heale BS, Keegan LP, McGurk L, Michlewski G, Brindle J, Stanton CM и др. (октябрь 2009 г.). «Редактирование независимых эффектов ADAR на путях miRNA/siRNA». The EMBO Journal . 28 (20): 3145–3156. doi :10.1038/emboj.2009.244. PMC 2735678. PMID  19713932 . 
  37. ^ ab Shoshan E, Mobley AK, Braeuer RR, Kamiya T, Huang L, Vasquez ME и др. (март 2015 г.). «Редактирование miR-455-5p с пониженным содержанием аденозина в инозин способствует росту и метастазированию меланомы». Nature Cell Biology . 17 (3): 311–321. doi :10.1038/ncb3110. PMC 4344852 . PMID  25686251. 
  38. ^ Tojo K, Sekijima Y, Suzuki T, Suzuki N, Tomita Y, Yoshida K и др. (сентябрь 2006 г.). «Дистония, ухудшение психического состояния и симметричный наследственный дисхроматоз в семье с мутацией ADAR1». Movement Disorders . 21 (9): 1510–1513. doi :10.1002/mds.21011. PMID  16817193. S2CID  38374943.
  39. ^ Weiden MD, Hoshino S, Levy DN, Li Y, Kumar R, Burke SA и др. (2014). «Аденозиндезаминаза, действующая на РНК-1 (ADAR1), ингибирует репликацию ВИЧ-1 в альвеолярных макрофагах человека». PLOS ONE . ​​9 (10): e108476. Bibcode :2014PLoSO...9j8476W. doi : 10.1371/journal.pone.0108476 . PMC 4182706 . PMID  25272020. 
  40. ^ аб Гелинас Дж. Ф., Клерзиус Г., Шоу Э., Гатиньоль А. (сентябрь 2011 г.). «Усиление репликации РНК-вирусов с помощью ADAR1 посредством редактирования РНК и ингибирования РНК-активируемой протеинкиназы». Журнал вирусологии . 85 (17): 8460–8466. дои : 10.1128/JVI.00240-11. ПМК 3165853 . ПМИД  21490091. 
  41. ^ abc Pfaller CK, George CX, Samuel CE (сентябрь 2021 г.). «Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADARs) и вирусные инфекции». Annual Review of Virology . 8 (1): 239–264. doi : 10.1146/annurev-virology-091919-065320 . PMID  33882257.
  42. ^ Бачко К., Лампе Дж., Либерт У.Г., Бринкманн Ю., Тер Мейлен В., Пардовиц И. и др. (ноябрь 1993 г.). «Клональная экспансия гипермутированного вируса кори в мозге SSPE». Вирусология . 197 (1): 188–195. дои : 10.1006/viro.1993.1579. ПМИД  8212553.
  43. ^ Cattaneo R, Schmid A, Eschle D, Baczko K, ter Meulen V, Billeter MA (октябрь 1988 г.). «Смещенная гипермутация и другие генетические изменения в дефектных вирусах кори при инфекциях человеческого мозга». Cell . 55 (2): 255–265. doi :10.1016/0092-8674(88)90048-7. PMC 7126660 . PMID  3167982. 
  44. ^ Теноевер Б.Р., Нг С.Л., Чуа М.А., МакВиртер С.М., Гарсиа-Састре А., Маниатис Т. (март 2007 г.). «Множественные функции IKK-родственной киназы IKKepsilon в интерферон-опосредованном противовирусном иммунитете». Наука . 315 (5816): 1274–1278. дои : 10.1126/science.1136567. PMID  17332413. S2CID  86636484.
  45. ^ Зан RC, Шелп I, Утермёлен О, фон Лаер Д (январь 2007 г.). «Гипермутация A-to-G в геноме вируса лимфоцитарного хориоменингита». Журнал вирусологии . 81 (2): 457–464. дои : 10.1128/jvi.00067-06. ПМК 1797460 . ПМИД  17020943. 
  46. ^ Kumar M, Carmichael GG (апрель 1997 г.). «Ядерная антисмысловая РНК индуцирует обширные модификации аденозина и ядерное удержание целевых транскриптов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (8): 3542–3547. Bibcode : 1997PNAS ...94.3542K. doi : 10.1073/pnas.94.8.3542 . PMC 20475. PMID  9108012. 
  47. ^ Luo GX, Chao M, Hsieh SY, Sureau C, Nishikura K, Taylor J (март 1990 г.). «Специфический переход оснований происходит при репликации РНК вируса гепатита дельта». Журнал вирусологии . 64 (3): 1021–1027. doi :10.1128/JVI.64.3.1021-1027.1990. PMC 249212. PMID  2304136 . 
  48. ^ Taylor DR, Puig M, Darnell ME, Mihalik K, Feinstone SM (май 2005 г.). «Новый противовирусный путь, который опосредует чувствительность интерферона репликона вируса гепатита С через ADAR1». Журнал вирусологии . 79 (10): 6291–6298. doi :10.1128/JVI.79.10.6291-6298.2005. PMC 1091666. PMID  15858013 . 
  49. ^ Toth AM, Li Z, Cattaneo R, Samuel CE (октябрь 2009 г.). «РНК-специфическая аденозиндезаминаза ADAR1 подавляет апоптоз, вызванный вирусом кори, и активацию протеинкиназы PKR». Журнал биологической химии . 284 (43): 29350–29356. doi : 10.1074/jbc.M109.045146 . PMC 2785566. PMID  19710021 . 

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки