АДАРБ1

Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens

Двухцепочечная РНК-специфическая эдитаза 1 — это фермент , который у человека кодируется геном ADARB1 . [ ^{5] [6] [7]} Фермент является членом семейства ADAR .

Функция

Этот ген кодирует фермент, ответственный за редактирование пре-мРНК субъединицы B рецептора глутамата путем сайт -специфического дезаминирования аденозинов . Исследования на крысах показали, что этот фермент действует на свои собственные молекулы пре-мРНК , преобразуя динуклеотид AA в динуклеотид AI, что приводит к новому сайту сплайсинга . Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к нескольким вариантам транскриптов, некоторые из которых характеризуются наличием или отсутствием вставки кассеты Alu и короткой или длинной С-концевой области. ^[7]

Для правильной работы ADARB1 требуется небольшая молекула инозитолгексакисфосфата (IP ₆ ). ^[8] ADARB1 — это фермент редактирования РНК A-to-I , который в основном действует на субстраты , кодирующие белки . ^[9]

Смотрите также

• Аденозиндезаминаза (АДА), фермент, действующий на изолированный аденозин

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000197381 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000020262 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Mittaz L, Scott HS, Rossier C, Seeburg PH, Higuchi M, Antonarakis SE (апрель 1997 г.). «Клонирование дезаминазы редактирования РНК человека (ADARB1) рецепторов глутамата, которая отображается на хромосоме 21q22.3». Genomics . 41 (2): 210–7. doi :10.1006/geno.1997.4655. PMID  9143496.
6. Keegan LP, Leroy A, Sproul D, O'Connell MA (февраль 2004 г.). "Аденозиндезаминазы, действующие на РНК (ADAR): ферменты редактирования РНК". Genome Biology . 5 (2): 209. doi : 10.1186/gb-2004-5-2-209 . PMC 395743 . PMID  14759252. 
7. "Ген Entrez: аденозиндезаминаза ADARB1, РНК-специфическая, B1 (крысиный гомолог RED1)".
8. Macbeth MR, Schubert HL, Vandemark AP, Lingam AT, Hill CP, Bass BL (сентябрь 2005 г.). «Инозитол гексакисфосфат связан в ядре ADAR2 и требуется для редактирования РНК». Science . 309 (5740): 1534–9. Bibcode :2005Sci...309.1534M. doi :10.1126/science.1113150. PMC 1850959 . PMID  16141067. 
9. Licht K, Jantsch MF (апрель 2016 г.). «Быстрая и динамическая регуляция транскриптома путем редактирования РНК и модификаций РНК». Журнал клеточной биологии . 213 (1): 15–22. doi :10.1083/jcb.201511041. PMC 4828693. PMID  27044895 . 

Дальнейшее чтение

• Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG, Franco R (1997). "Оболочка ВИЧ-1 gp120 и вирусные частицы блокируют связывание аденозиндезаминазы с человеческим CD26". Клеточные пептидазы в иммунных функциях и заболеваниях . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Т. 421. С. 185–92. doi :10.1007/978-1-4757-9613-1_24. ISBN 978-1-4757-9615-5. PMID  9330696.
• Melcher T, Maas S, Herb A, Sprengel R, Seeburg PH, Higuchi M (февраль 1996 г.). "Фермент редактирования РНК млекопитающих". Nature . 379 (6564): 460–4. Bibcode :1996Natur.379..460M. doi :10.1038/379460a0. PMID  8559253. S2CID  4326456.
• O'Connell MA, Gerber A, Keller W (январь 1997 г.). «Очистка человеческой двухцепочечной РНК-специфической эдитазы 1 (hRED1), участвующей в редактировании пре-мРНК рецептора глутамата B мозга». Журнал биологической химии . 272 ​​(1): 473–8. doi : 10.1074/jbc.272.1.473 . PMID  8995285.
• Valenzuela A, Blanco J, Callebaut C, Jacotot E, Lluis C, Hovanessian AG, Franco R (апрель 1997 г.). «Связывание аденозиндезаминазы с человеческим CD26 ингибируется гликопротеином оболочки ВИЧ-1 gp120 и вирусными частицами». Журнал иммунологии . 158 (8): 3721–9. doi : 10.4049/jimmunol.158.8.3721 . PMID  9103436.
• Lai F, Chen CX, Carter KC, Nishikura K (май 1997). «Редактирование РНК ионного канала субъединицы рецептора глутамата B четырьмя альтернативно сплайсированными двухцепочечными РНК-аденозиндезаминазами DRADA2». Молекулярная и клеточная биология . 17 (5): 2413–24. doi :10.1128/MCB.17.5.2413. PMC  232090. PMID  9111310 .
• Yang JH, Sklar P, Axel R, Maniatis T (апрель 1997 г.). «Очистка и характеристика человеческой РНК-аденозиндезаминазы для редактирования пре-мРНК рецептора глутамата B». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (9): 4354–9. Bibcode : 1997PNAS...94.4354Y. doi : 10.1073 /pnas.94.9.4354 . PMC  20726. PMID  9113993.
• Gerber A, O'Connell MA, Keller W (май 1997). «Две формы человеческой двухцепочечной РНК-специфической эдитазы 1 (hRED1), полученные путем вставки кассеты Alu». РНК . 3 (5): 453–63. PMC  1369496 . PMID  9149227.
• Виллар Л., Тассоне Ф., Хаймович М., Велборн Р., Гардинер К. (март 1997 г.). «Карта расположения, геномная организация и паттерны экспрессии человеческой РНК-эдитазы RED1». Somatic Cell and Molecular Genetics . 23 (2): 135–45. doi :10.1007/BF02679972. PMID  9330641. S2CID  45104326.
• Бланко Х., Валенсуэла А., Эррера К., Луис К., Ованесян А.Г., Франко Р. (июль 2000 г.). «Gp120 ВИЧ-1 ингибирует связывание аденозиндезаминазы с CD26 по механизму, модулируемому экспрессией CD4 и CXCR4». Письма ФЭБС . 477 (1–2): 123–8. дои : 10.1016/S0014-5793(00)01751-8. PMID  10899322. S2CID  22229481.
• Herrera C, Morimoto C, Blanco J, Mallol J, Arenzana F, Lluis C, Franco R (июнь 2001 г.). «Комодуляция CXCR4 и CD26 в лимфоцитах человека». Журнал биологической химии . 276 (22): 19532–9. doi : 10.1074/jbc.M004586200 . PMID  11278278.
• Maas S, Patt S, Schrey M, Rich A (декабрь 2001 г.). «Недоредактирование мРНК рецептора глутамата GluR-B в злокачественных глиомах». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (25): 14687–92. Bibcode : 2001PNAS...9814687M. doi : 10.1073/pnas.251531398 . PMC  64742. PMID  11717408 .
• Jayan GC, Casey JL (апрель 2002 г.). «Увеличение редактирования РНК и ингибирование репликации вируса гепатита дельта за счет высокой экспрессии ADAR1 и ADAR2». Журнал вирусологии . 76 (8): 3819–27. doi : 10.1128 /JVI.76.8.3819-3827.2002. PMC  136091. PMID  11907222.
• Jaikaran DC, Collins CH, MacMillan AM (октябрь 2002 г.). «Редактирование аденозина в инозин с помощью ADAR2 требует образования тройного комплекса на участке GluR-B R/G». Журнал биологической химии . 277 (40): 37624–9. doi : 10.1074/jbc.M204126200 . PMID  12163487.
• Jayan GC, Casey JL (декабрь 2002 г.). «Ингибирование редактирования РНК вируса гепатита дельта путем опосредованного короткой ингибиторной РНК нокдауна ADAR1, но не экспрессии ADAR2». Журнал вирусологии . 76 (23): 12399–404. doi : 10.1128 /JVI.76.23.12399-12404.2002. PMC  136899. PMID  12414985.
• Славов Д., Гардинер К. (октябрь 2002 г.). «Филогенетическое сравнение генов и транскриптов пре-мРНК аденозиндезаминазы ADAR2: сохранение и разнообразие в последовательности сайта редактирования и альтернативных моделях сплайсинга». Gene . 299 (1–2): 83–94. doi :10.1016/S0378-1119(02)01016-8. PMID  12459255.

Внешние ссылки

• Расположение генома человека ADARB1 и страница с подробностями гена ADARB1 в браузере геномов UCSC .