stringtranslate.com

Архепластиды

Archaeplastida (или царство Plantae sensu lato «в широком смысле»; произносится /ɑːr kɪ ˈ p l æ s t ɪ də / ) крупная группа эукариот , включающая фотоавтотрофные красные водоросли ( Rhodophyta ) , зеленые водоросли , наземные растения и второстепенную группу глаукофитов . [ 6] Она также включает нефотосинтетическую линию Rhodelphidia , хищных (эукариотрофных) жгутиконосцев, которые являются сестринскими для Rhodophyta, и, вероятно , микроскопических пикозойных . [7] Archaeplastida имеют хлоропласты , окруженные двумя мембранами, что позволяет предположить, что они были приобретены непосредственно через один акт эндосимбиоза путем фагоцитоза цианобактерии . [8] Все другие группы, имеющие хлоропласты, кроме амебоидного рода Paulinella , имеют хлоропласты, окруженные тремя или четырьмя мембранами, что позволяет предположить, что они были приобретены вторично от красных или зеленых водорослей. [примечание 1] В отличие от красных и зеленых водорослей, глаукофиты никогда не участвовали во вторичных эндосимбиотических событиях. [10]

Клетки Archaeplastida обычно лишены центриолей и имеют митохондрии с плоскими кристами . Обычно они имеют клеточную стенку , содержащую целлюлозу , а пища хранится в виде крахмала . Однако эти характеристики также являются общими с другими эукариотами. Основное доказательство того, что Archaeplastida образуют монофилетическую группу, получено из генетических исследований, которые указывают на то, что их пластиды, вероятно, имели единое происхождение. Это доказательство оспаривается. [11] [12] На основании имеющихся на сегодняшний день доказательств невозможно подтвердить или опровергнуть альтернативные эволюционные сценарии единого первичного эндосимбиоза . [13] Фотосинтезирующие организмы с пластидами разного происхождения (например, бурые водоросли ) не относятся к Archaeplastida.

Архепластиданы делятся на две основные эволюционные линии. Красные водоросли пигментированы хлорофиллом a и фикобилипротеинами , как и большинство цианобактерий, и накапливают крахмал вне хлоропластов. Зеленые водоросли и наземные растения — вместе известные как Viridiplantae (лат. «зеленые растения») или Chloroplastida — пигментированы хлорофиллами a и b , но лишены фикобилипротеинов, и крахмал накапливается внутри хлоропластов. [14] Глаукофиты имеют типичные пигменты цианобактерий, но их пластиды (называемые цианеллами) отличаются наличием внешнего слоя пептидогликана. [1]

Archaeplastida не следует путать со старым и устаревшим названием Archiplastideae, которое относится к цианобактериям и другим группам бактерий. [15] [16]

Таксономия

Консенсус 2005 года, когда группа, состоящая из глаукофитов, красных и зеленых водорослей и наземных растений, была названа «Archaeplastida», [1] заключался в том, что это была клада , т. е. была монофилетической . Многие исследования, опубликованные с тех пор, предоставили доказательства в этом согласии. [17] [18] [19] [20] Однако другие исследования предположили, что группа является парафилетической . [21] [22] [23] [12] [24] На сегодняшний день ситуация кажется нерешенной, но в недавнем исследовании (с обогащением генов красных водорослей) был продемонстрирован сильный сигнал в пользу монофилии Plantae (Archaeplastida). [25] Здесь сделано предположение, что Archaeplastida является действительной кладой.

Группе давали различные названия. Некоторые авторы просто называли группу растениями или Plantae. [26] [27] Однако название Plantae неоднозначно, поскольку оно также применялось к менее обширным кладам , таким как Viridiplantae и Embryophytes . Чтобы различать, большую группу иногда называют Plantae sensu lato («растения в широком смысле»).

Чтобы избежать двусмысленности, были предложены другие названия. Primoplantae, появившееся в 2004 году, по-видимому, является первым новым названием, предложенным для этой группы. [5] Другое название, примененное к этому узлу, — Plastida, определяемое как клад, разделяющий «пластиды первичного (прямого прокариотного) происхождения [как] в Magnolia virginiana Linnaeus 1753». [28]

Хотя многие исследования предполагали, что Archaeplastida образуют монофилетическую группу, [29] в статье 2009 года утверждается, что они на самом деле парафилетичны . [23] Обогащение новых генов красных водорослей в недавнем исследовании демонстрирует сильный сигнал монофилии Plantae (Archaeplastida) и столь же сильный сигнал истории обмена генами между красными/зелеными водорослями и другими линиями. [25] Это исследование дает представление о том, насколько важны богатые данные о генах мезофильных красных водорослей для проверки спорных вопросов в эволюции эукариот и для понимания сложных моделей наследования генов у простейших.

Название Archaeplastida было предложено в 2005 году большой международной группой авторов (Adl et al. ), которые стремились создать классификацию эукариот, которая учитывала бы морфологию, биохимию и филогенетику и которая имела бы «некоторую стабильность в ближайшей перспективе». Они отказались от использования формальных таксономических рангов в пользу иерархической организации, где названия клад не обозначают ранг. Таким образом, название типа «Glaucophyta» и название класса «Rhodophyceae» появляются на одном уровне в их классификации. Подразделения, предложенные для Archaeplastida, показаны ниже как в табличной, так и в диаграммной форме . [1]

Архепластиды :

Глаукофит Glaucocystis
  • Глаукофиты — небольшая группа пресноводных одноклеточных водорослей. Их хлоропласты, называемые цианеллами , имеют пептидогликановый слой, что делает их более похожими на цианобактерии, чем на остальные архепластиды.
Родофит Лауренсия
Красные водоросли образуют одну из самых больших групп водорослей. Большинство из них — морские водоросли, многоклеточные и морские. Их красный цвет обусловлен фикобилипротеинами , используемыми в качестве вспомогательных пигментов при улавливании света для фотосинтеза.
Chloroplastida — это термин, выбранный Adl et al. для группы, состоящей из зеленых водорослей и наземных растений (эмбриофитов). За исключением случаев вторичной утраты, все имеют хлоропласты без пептидогликанового слоя и лишены фикобилипротеинов.
Хлорофит Стигеоклониум
  • Chlorophyta Pascher, 1914, исправлено. Lewis & McCourt, 2004 – зеленые водоросли (часть)
Адл и др. используют узкое определение Chlorophyta; другие источники включают Chlorodendrales и Prasinophytae, которые сами по себе могут быть объединены.
  • Chlorodendrales Fritsch, 1917 – зеленые водоросли (часть)
  • Prasinophytae Cavalier-Smith, 1998, исправлено. Льюис и МакКорт, 2004 – зеленые водоросли (часть)
  • Мезостигма Лаутерборн, 1894 г., исправлено. МакКорт в Adl et al. , 2005 (Mesostigmata Turmel, Otis и Lemieux, 2002 )
  • Charophyta Karol et al. , 2001, изм. Lewis & McCourt, 2004 (Charophyceae Smith 1938, изм. Mattox and Stewart 1984 ) – зеленые водоросли (часть) и наземные растения
Charophyta sensu lato , как его используют Адл и др. , представляет собой монофилетическую группу, состоящую из некоторых зеленых водорослей, включая каменистые водоросли (Charophyta sensu stricto ), а также наземных растений (эмбриофитов).
  • Подразделения, отличные от Streptophytina (ниже), не были указаны Адлом и др.
Другие источники включают группы зеленых водорослей Chlorokybales , Klebsormidiales , Zygnematales и Coleochaetales . [30]
  • Streptophytina Lewis & McCourt, 2004 – костянки и наземные растения
  • Charales Lindley 1836 (Charophytae Engler, 1887 ) – каменистые водоросли
  • Plantae Haeckel 1866 (Cormophyta Endlicher, 1836 ; Embryophyta Endlicher, 1836, исправлено Lewis & McCourt, 2004 ) – наземные растения (эмбриофиты)

Внешняя филогения

Ниже представлена ​​консенсусная реконструкция взаимоотношений Archaeplastida с ее ближайшими соседями, основанная в основном на молекулярных данных. [31] [32] [33] [34]

Имелись разногласия относительно корня Archaeplastida, например, возникли ли Cryptista внутри Archaeplastida. В 2014 году был опубликован подробный обзор этих несоответствий. [35] Положение Telonemia и Picozoa неясно. Также Hacrobia (Haptista + Cryptista) может быть полностью связана с кладой SAR. SAR часто рассматриваются как гибриды эукариот-эукариот, что способствует путанице в генетических анализах. Сестра Gloeomargarita lithophora была поглощена предком Archaeplastida, что привело к появлению пластид , которые живут в постоянном эндосимбиозе в большинстве потомков. Поскольку и Gloeomargarita, и родственные им цианобактерии, а также самые примитивные архепластиды живут в пресной воде, можно предположить, что архепластиды возникли в пресной воде и колонизировали океаны только в позднем протерозое. [36] [37]

Внутренняя филогения

В 2019 году была предложена филогения Archaeplastida, основанная на геномах и транскриптомах 1153 видов растений. [38] Размещение групп водорослей поддерживается филогениями, основанными на геномах Mesostigmatophyceae и Chlorokybophyceae, которые с тех пор были секвенированы. Как «хлорофитовые водоросли», так и «стрептофитовые водоросли» рассматриваются как парафилетические (вертикальные полосы рядом с диаграммой филогенетического дерева) в этом анализе. [39] [40] Классификация Bryophyta поддерживается как Puttick et al. 2018, [41] , так и филогениями, включающими геномы роголистника, которые также с тех пор были секвенированы. [42] [43]

Недавние исследования нефотосинтезирующих водорослей помещают Rhodelphidia в качестве родственных групп Rhodophyta или Glaucophyta и Viridiplantae; [44] [45] а Picozoa — в качестве родственных групп этой пары. [46]

Морфология

Все архепластидины имеют пластиды (хлоропласты), которые осуществляют фотосинтез и, как полагают, произошли от эндосимбиотических цианобактерий. У глаукофитов, возможно, самых примитивных членов группы, хлоропласт называется цианеллой и разделяет несколько черт с цианобактериями, включая клеточную стенку из пептидогликана, которые не сохраняются у других членов группы. Сходство цианелл с цианобактериями подтверждает эндосимбиотическую теорию .

Клетки большинства архепластид имеют стенки, обычно, но не всегда, состоящие из целлюлозы. [ необходима цитата ]

Archaeplastida сильно различаются по степени организации клеток: от изолированных клеток до нитей, колоний и многоклеточных организмов. Самые ранние были одноклеточными, и многие группы остаются таковыми и сегодня. Многоклеточность развивалась отдельно в нескольких группах, включая красные водоросли, ульвофитные зеленые водоросли и зеленые водоросли, которые дали начало каменистым водорослям и наземным растениям.

Эндосимбиоз

Поскольку предполагается, что предковый архепластид приобрел свои хлоропласты непосредственно путем поглощения цианобактерий, это событие известно как первичный эндосимбиоз (что отражено в названии, выбранном для группы «Archaeplastida», т. е. «древняя пластида»). В 2013 году было обнаружено, что один вид зеленых водорослей, Cymbomonas tetramitiformis в порядке Pyramimonadales , является миксотрофом и способен поддерживать себя как посредством фаготрофии , так и фототрофии . Пока неизвестно, является ли это примитивной чертой и, следовательно, определяет последнего общего предка Archaeplastida, что могло бы объяснить, как он получил свои хлоропласты, или это черта, восстановленная путем горизонтального переноса генов . [47] С тех пор было обнаружено больше видов миксотрофных зеленых водорослей, таких как Pyramimonas tychotreta и Mantoniella antarctica . [48]

Доказательства первичного эндосимбиоза включают наличие двойной мембраны вокруг хлоропластов; одна мембрана принадлежала бактерии, а другая — эукариоте, которая ее захватила. Со временем многие гены из хлоропласта были перенесены в ядро ​​клетки-хозяина посредством эндосимбиотического переноса генов (EGT). По оценкам, 6–20% генома архепластид состоит из генов, перенесенных из эндосимбионта. [49] Наличие таких генов в ядрах эукариот без хлоропластов предполагает, что этот перенос произошел на ранних этапах эволюции группы. [50]

Другие эукариоты с хлоропластами, по-видимому, приобрели их, поглощая одноклеточный архепластидан своими собственными хлоропластами бактериального происхождения. Поскольку эти события включают эндосимбиоз клеток, имеющих своих собственных эндосимбионтов, этот процесс называется вторичным эндосимбиозом . Хлоропласты таких эукариот обычно окружены более чем двумя мембранами, что отражает историю многократного поглощения. Хлоропласты эвгленид , хлорарахниофитов и небольшой группы динофлагеллятов, по-видимому, являются захваченными зелеными водорослями, [51] тогда как хлоропласты остальных фотосинтетических эукариот, таких как гетероконтовые водоросли, криптофиты , гаптофиты и динофлагелляты, по-видимому, являются захваченными красными водорослями. [52]

Ископаемые останки

Возможно, самые древние останки Archaeplastida — это предполагаемые красные водоросли ( Rafatazmia ) в строматолитах в породах возрастом 1600 млн лет в Индии [53] , а также возможные ископаемые водоросли ( Tuanshanzia ) из китайской биоты Гаоючжуан того же возраста. [54] Несколько более поздними являются микроископаемые из группы Roper в северной Австралии. Структура этих одноклеточных ископаемых напоминает структуру современных зеленых водорослей. Они датируются мезопротерозойской эрой, примерно 1500–1300 млн лет назад. [55] Эти ископаемые согласуются с исследованием молекулярных часов , которое подсчитало, что эта клада разошлась около 1500 млн лет назад. [56] Самая старая ископаемая находка, которая может быть отнесена к определенной современной группе, — это красная водоросль Bangiomorpha , возраст которой составляет 1200 млн лет. [57]

В поздней неопротерозойской эре водорослевые окаменелости стали более многочисленными и разнообразными. В конце концов, в палеозойской эре, растения вышли на сушу и продолжают процветать вплоть до настоящего времени.

Примечания

  1. ^ Исключительные две пластидные мембраны водоросли страменопила Chrysoparadoxa , вероятно, являются результатом вторичной редукции. [9]

Ссылки

  1. ^ abcd Adl, SM; et al. (2005). «Новая высокоуровневая классификация эукариот с акцентом на таксономию протистов». Журнал эукариотической микробиологии . 52 (5): 399–451. doi : 10.1111/j.1550-7408.2005.00053.x . PMID  16248873. S2CID  8060916.
  2. ^ аб Язаки, Юки; Ябуки, Акинори; Имаидзуми, Аяка; Куме, Кейтаро; Хасимото, Тецуо; Инагаки, Юдзи (31 августа 2021 г.). «Филогеномика ссылается на кладу, в которой обитают Cryptista, Archaeplastida и Microheliella maris ». bioRxiv 10.1101/2021.08.29.458128 . 
  3. ^ Шён, М. Э.; Златогурский, В. В.; Сингх, РП; и др. (17 ноября 2021 г.). «Геномика отдельных клеток показывает, что лишенные пластид пикозоа являются близкими родственниками красных водорослей». Nature Communications . 12: 6651 (1): 6651. Bibcode :2021NatCo..12.6651S. doi :10.1038/s41467-021-26918-0. ISSN  2041-1723. PMC 8599508 . PMID  34789758. 
  4. ^ Кавальер-Смит, Т. (1981). «Царства эукариот: семь или девять?»". BioSystems . 14 (3–4): 461–481. Bibcode :1981BiSys..14..461C. doi :10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID  7337818.
  5. ^ ab Palmer, Jeffrey D.; Soltis, Douglas E.; Chase, Mark W. (2004). «Растительное дерево жизни: обзор и некоторые точки зрения». American Journal of Botany . 91 (10): 1437–1445. doi : 10.3732/ajb.91.10.1437 . PMID  21652302.
  6. ^ Ball, S.; Colleoni, C. (январь 2011 г.). «Эволюция метаболизма гликогена и крахмала у эукариот дает молекулярные подсказки для понимания установления пластидного эндосимбиоза». Журнал экспериментальной ботаники . 62 (6). Cenci, U.; Raj, JN; Tirtiaux, C.: 1775–1801. doi : 10.1093/jxb/erq411 . PMID  21220783.
  7. ^ Пикозои — это водоросли, в конце концов: исследование | The Scientist Magazine®
  8. ^ Институт биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина Российской академии наук; Тихоненков, Денис В. (2020). «Хищные жгутиконосцы – новые недавно обнаруженные глубинные ветви эукариотического древа и их эволюционное и экологическое значение» (PDF) . Protistology . 14 (1). doi : 10.21685/1680-0826-2020-14-1-2 .
  9. ^ Wetherbee, Richard; Jackson, Christopher J.; Repetti, Sonja I.; Clementson, Lesley A.; Costa, Joana F.; van de Meene, Allison; Crawford, Simon; Verbruggen, Heroen (9 декабря 2018 г.). «Золотой парадокс – новая гетероконтная линия с хлоропластами, окруженными двумя мембранами». Journal of Phycology . 22 (2): 257–278. doi :10.1111/jpy.12822. hdl : 11343/233613 . PMID  30536815. S2CID  54477112.
  10. ^ Справочник по морским микроводорослям: достижения биотехнологии
  11. ^ Parfrey. LW; Barbero, E.; Lasser, E; et al. (декабрь 2006 г.). «Оценка поддержки текущей классификации эукариотического разнообразия». PLOS Genetics . 2 (12): e220. doi : 10.1371/journal.pgen.0020220 . PMC 1713255. PMID  17194223 . 
  12. ^ ab Kim, E; Graham, LE (июль 2008 г.). Redfield, Rosemary Jeanne (ред.). "Анализ EEF2 бросает вызов монофилии Archaeplastida и Chromalveolata". PLOS ONE . ​​3 (7): e2621. Bibcode :2008PLoSO...3.2621K. doi : 10.1371/journal.pone.0002621 . PMC 2440802 . PMID  18612431. 
  13. ^ Мацкевич, П.; Гагат, П. (2014). «Монофилия супергруппы Archaeplastida и отношения между ее линиями в свете филогенетических и филогеномных исследований. Приближены ли мы к консенсусу?». Acta Societatis Botanicorum Poloniae . 83 (4): 263–280. doi : 10.5586/asbp.2014.044 .
  14. ^ Виола, Р.; Нивалл, П.; Педерсен, М. (2001). «Уникальные особенности метаболизма крахмала в красных водорослях». Труды Королевского общества B: Биологические науки . 268 (1474): 1417–1422. doi :10.1098/rspb.2001.1644. PMC 1088757. PMID  11429143 . 
  15. ^ Коупленд, Х. Ф. (1956). Классификация низших организмов . Пало-Альто: Pacific Books, стр. 29, [1].
  16. ^ Бесси, CE (1907). «Обзор типов растений». Univ. Nebraska Studies . 7 : 275–358.
  17. ^ Бурки, Фабьен; Кямран Шалчян-Тебризи; Марианна Минге; Осмунд Скьевеланд; Сергей Иванович Николаев; Кжетилл С. Якобсен; Ян Павловский (2007). Батлер, Джеральдин (ред.). «Филогеномика меняет супергруппы эукариот». ПЛОС ОДИН . 2 (8): е790. Бибкод : 2007PLoSO...2..790B. дои : 10.1371/journal.pone.0000790 . ЧВК 1949142 . ПМИД  17726520. 
  18. ^ Burki, F.; Inagaki, Y.; Brate, J.; Archibald, JM; Keeling, PJ; Cavalier-Smith, T.; et al. (2009). «Масштабный филогеномный анализ показывает, что две загадочные линии протистов, Telonemia и Centroheliozoa, связаны с фотосинтетическими Chromalveolates». Genome Biology and Evolution . 1 : 231–238. doi :10.1093/gbe/evp022. PMC 2817417. PMID  20333193 . 
  19. ^ Кавальер-Смит, Томас (2009). «Царства Protozoa и Chromista и эозойный корень эукариотического дерева». Biology Letters . 6 (3): 342–345. doi :10.1098/rsbl.2009.0948. PMC 2880060. PMID 20031978  . 
  20. ^ Рогозин, ИБ; Басу, МК; Чюрёш, М. и Кунин, ЭВ (2009). «Анализ редких геномных изменений не подтверждает филогению Unikont–Bikont и предполагает, что симбиоз цианобактерий является точкой первичной радиации эукариот». Genome Biology and Evolution . 1 : 99–113. doi :10.1093/gbe/evp011. PMC 2817406. PMID  20333181. 
  21. ^ Балдауф, Сандра Л.; Роджер, А. Дж.; Венк-Зиферт, И.; Дулитл, У. Ф. (2000). «Филогения эукариот на уровне царства на основе комбинированных данных о белках». Science . 290 (5493): 972–977. Bibcode :2000Sci...290..972B. doi :10.1126/science.290.5493.972. PMID  11062127.
  22. ^ Липскомб, Диана. 1991. Широкая классификация: царства и простейшие. В: Parasitic Protozoa, т. 1, 2-е изд., JP Kreier, JR Baker (ред.), стр. 81-136. Academic Press, Сан-Диего.
  23. ^ ab Nozaki, H.; Maruyama, S.; Matsuzaki, M.; Nakada, T.; Kato, S.; Misawa, K. (декабрь 2009 г.). «Филогенетические позиции Glaucophyta, зеленых растений (Archaeplastida) и Haptophyta (Chromalveolata), выведенные из медленно эволюционирующих ядерных генов». Молекулярная филогенетика и эволюция . 53 (3): 872–80. doi :10.1016/j.ympev.2009.08.015. PMID  19698794.
  24. ^ Palmgren M, Sørensen DM, Hallström BM, Säll T, Broberg K (август 2019 г.). «Эволюция АТФаз P2A и P5A: повторный взгляд на древние дупликации генов и связь красных водорослей с зелеными растениями». Physiol. Plant . 168 (3): 630–647. doi :10.1111/ppl.13008. PMC 7065118. PMID 31268560  . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )
  25. ^ ab Chan, CX; Yang, EC; Banerjee, T.; Yoon, HS; Martone, PT; Estevez, JM; Bhattacharya, D. (2011). «Монофилия красных и зеленых водорослей и обширное совместное использование генов, обнаруженные в богатом репертуаре генов красных водорослей». Current Biology . 21 (4): 328–333. Bibcode :2011CBio...21..328C. doi : 10.1016/j.cub.2011.01.037 . PMID  21315598. S2CID  7162977.
  26. ^ T. Cavalier-Smith (1981). «Царства эукариот: семь или девять?». BioSystems . 14 (3–4): 461–481. Bibcode : 1981BiSys..14..461C. doi : 10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID  7337818.
  27. ^ Бхаттачарья, Дебашиш; Юн, Хван Су; Хакетт, Джеремия (2003). «Фотосинтетические эукариоты объединяются: эндосимбиоз соединяет точки». BioEssays . 26 (1): 50–60. doi :10.1002/bies.10376. PMID  14696040.
  28. ^ Симпсон, AGB (2004). «Таксоны самого высокого уровня в пределах эукариот». Первая международная встреча по филогенетической номенклатуре. Париж, 6–9 июля .
  29. ^ Виноградов СН; Фернандес, И.; Хоогевийс, Д.; Арредондо-Питер, Р. (октябрь 2010 г.). «Филогенетические отношения гемоглобинов 3/3 и 2/2 в геномах архепластид к бактериальным и другим гемоглобинам эукариот». Molecular Plant . 4 (1): 42–58. doi : 10.1093/mp/ssq040 . PMID  20952597.
  30. ^ Turmel, M.; Otis, C.; Lemieux, C. (2005). «Полные последовательности ДНК хлоропластов харовых зеленых водорослей Staurastrum и Zygnema показывают, что геном хлоропластов претерпел значительные изменения в ходе эволюции Zygnematales». BMC Biology . 3 : 22. doi : 10.1186/1741-7007-3-22 . PMC 1277820 . PMID  16236178. 
  31. ^ Leliaert, Frederik; Smith, David R.; Moreau, Hervé; Herron, Matthew D.; Verbruggen, Heroen; Delwiche, Charles F.; De Clerck, Olivier (2012). "Phylogeny and Molecular Evolution of the Green Algae" (PDF) . Critical Reviews in Plant Sciences . 31 (1): 1–46. Bibcode :2012CRvPS..31....1L. doi :10.1080/07352689.2011.615705. S2CID  17603352. Архивировано из оригинала (PDF) 24.09.2015 . Получено 15.10.2017 .
  32. ^ Кук, Марта Э.; Грэм, Линда Э. (2017). «Chlorokybophyceae, Klebsormidiophyceae, Coleochaetophyceae». В Арчибальд, Джон М.; Симпсон, Аластер ГБ; Сламовиц, Клаудио Х. (ред.). Справочник простейших . Springer International Publishing. стр. 185–204. doi :10.1007/978-3-319-28149-0_36. ISBN 9783319281476.
  33. ^ Льюис, Луиза А.; МакКорт, Ричард М. (2004). «Зеленые водоросли и происхождение наземных растений». Американский журнал ботаники . 91 (10): 1535–1556. doi :10.3732/ajb.91.10.1535. PMID  21652308.
  34. ^ Adl, Sina M.; Simpson, Alastair GB; Lane, Christopher E.; Lukeš, Julius; Bass, David; Bowser, Samuel S.; Brown, Matthew W.; Burki, Fabien; Dunthorn, Micah (2012-09-01). "Пересмотренная классификация эукариот". Journal of Eukaryotic Microbiology . 59 (5): 429–514. doi :10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC 3483872 . PMID  23020233. 
  35. ^ Мацкевич, Павел; Гагат, Пшемыслав (31 декабря 2014 г.). «Монофилия супергруппы Archaeplastida и взаимоотношения между ее линиями в свете филогенетических и филогеномных исследований. Близки ли мы к консенсусу?». Acta Societatis Botanicorum Poloniae . 83 (4): 263–280. дои : 10.5586/asbp.2014.044 .
  36. ^ де Врис, Ян; Арчибальд, Джон М. (2017). «Эндосимбиоз: пластиды эволюционировали из пресноводной цианобактерии?». Current Biology . 27 (3): R103–R105. Bibcode : 2017CBio...27.R103D. doi : 10.1016/j.cub.2016.12.006 . PMID  28171752.
  37. ^ Льюис, LA (2017). «Удержи соль: пресноводное происхождение первичных пластид». PNAS . 114 (37): 9759–9760. Bibcode : 2017PNAS..114.9759L. doi : 10.1073/pnas.1712956114 . PMC 5604047. PMID  28860199 . 
  38. ^ Либенс-Мак, М.; Баркер, М.; Карпентер, Э.; и др. (2019). «Тысяча транскриптомов растений и филогеномика зеленых растений». Nature . 574 (7780): 679–685. doi : 10.1038/s41586-019-1693-2 . ​​PMC 6872490 . PMID  31645766. 
  39. ^ Лян, Чжэ и др. (2019). «Геном и транскриптом Mesostigma viride дают представление о происхождении и эволюции Streptophyta». Advanced Science . 7 (1): 1901850. doi : 10.1002/advs.201901850 . PMC 6947507 . PMID  31921561. 
  40. ^ Ван, Сибо и др. (2020). «Геномы рано расходящихся стрептофитовых водорослей проливают свет на террестриализацию растений». Nature Plants . 6 (2): 95–106. doi : 10.1038/s41477-019-0560-3 . PMC 7027972 . PMID  31844283. 
  41. ^ Путтик, Марк; и др. (2018). «Взаимоотношения наземных растений и природа предкового эмбриона». Current Biology . 28 (5): 733–745. Bibcode : 2018CBio...28E.733P. doi : 10.1016/j.cub.2018.01.063 . hdl : 1983/ad32d4da-6cb3-4ed6-add2-2415f81b46da . PMID  29456145.
  42. ^ Чжан, Цзянь и др . (2020). «Геном роголистника и ранняя эволюция наземных растений». Nature Plants . 6 (2): 107–118. doi : 10.1038/s41477-019-0588-4 . PMC 7027989. PMID  32042158. 
  43. ^ Ли, Фэй Вэй и др. (2020). «Геномы Anthoceros проливают свет на происхождение наземных растений и уникальную биологию роголистников». Nature Plants . 6 (3): 259–272. doi : 10.1038/s41477-020-0618-2 . PMC 8075897 . PMID  32170292. 
  44. ^ Gawryluk, Ryan MR; Tikhonenkov, Denis V.; Hehenberger, Elisabeth; Husnik, Filip; Mylnikov, Alexander P.; Keeling, Patrick J. (17 июля 2019 г.). «Нефотосинтезирующие хищники — сестры красных водорослей». Nature . 572 (7768): 240–243. doi :10.1038/s41586-019-1398-6. PMID  31316212. S2CID  197542583.
  45. ^ Новак, Лукас В.Ф.; Муньос-Гомес, Серхио А.; Беверен, Фабиан ван; Чобану, Мария; Эме, Лаура; Лопес-Гарсия, Purificación; Морейра, Дэвид (11 марта 2024 г.), Филогеномика нуклеоморфов предполагает глубокое и древнее происхождение криптофитных пластид внутри Rhodophyta, doi : 10.1101/2024.03.10.584144 , получено 8 июня 2024 г.
  46. ^ Шён, Макс Э.; Златогурский, Василий В.; Сингх, Рохан П.; Пуарье, Камилла; Вилкен, Сюзанна; Матур, Варша; Штрассерт, Юрген Ф. Х.; Пинхасси, Джароне; Уорден, Александра З.; Килинг, Патрик Дж.; Эттема, Тийс Дж. Г.; Видеман, Джереми Г.; Берки, Фабьен (17 ноября 2021 г.). «Геномика отдельных клеток показывает, что пикозоа, лишенные пластид, являются близкими родственниками красных водорослей». Nature Communications . 12 (1): 6651. Bibcode :2021NatCo..12.6651S. doi :10.1038/s41467-021-26918-0. PMC 8599508 . PMID  34789758. 
  47. ^ Raven, John A. (2013). «Клетки внутри клеток: симбиоз и продолжающаяся фаготрофия». Current Biology . 23 (12): R530–R531. Bibcode : 2013CBio...23.R530R. doi : 10.1016/j.cub.2013.05.006 . PMID  23787050.
  48. ^ Бок, Николас А.; Шарве, Софи; Бернс, Джон; Гьялтшен, Янгшо; Розенберг, Андрей; Дюамель, Соланж; Ким, Ынсу (2021). «Экспериментальная идентификация и прогнозирование in silico бактериофагии у зеленых водорослей». Журнал ISME . 15 (7): 1987–2000. Bibcode : 2021ISMEJ..15.1987B. doi : 10.1038/s41396-021-00899-w. PMC 8245530. PMID  33649548 . 
  49. ^ Qiu, Huan; Yoon, Hwan Su; Bhattacharya, Debashish (2013). «Водорослевые эндосимбионты как векторы горизонтального переноса генов у фотосинтетических эукариот». Frontiers in Plant Science . 4 : 366. doi : 10.3389/fpls.2013.00366 . PMC 3777023. PMID  24065973 . 
  50. ^ Андерссон, Ян О.; Роджер, Эндрю Дж. (2002). «Ген цианобактерий у нефотосинтезирующих простейших – раннее приобретение хлоропластов у эукариот?». Current Biology . 12 (2): 115–119. Bibcode : 2002CBio...12..115A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00649-2 . PMID  11818061. S2CID  18809784.
  51. ^ Килинг, Патрик Дж. (2010). «Эндосимбиотическое происхождение, диверсификация и судьба пластид». Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 365 (1541): 729–748. doi :10.1098/rstb.2009.0103. PMC 2817223. PMID  20124341 . 
  52. ^ Стадничук, ИН; Кузнецов, ВВ (2021). «Эндосимбиотическое происхождение хлоропластов в эволюции растительных клеток». Российский журнал физиологии растений . 68 (1): 1–16. doi :10.1134/S1021443721010179. S2CID  255012748.
  53. ^ Бенгтсон, Стефан; Саллстедт, Тереза; Беливанова, Венета; Уайтхаус, Мартин (2017). «Трехмерное сохранение клеточных и субклеточных структур предполагает возраст красных водорослей кроновой группы 1,6 миллиарда лет». PLOS Biology . 15 (3): e2000735. doi : 10.1371/journal.pbio.2000735 . PMC 5349422 . PMID  28291791. 
  54. ^ Чэнь, К.; Мяо, Л.; Чжао, Ф.; Чжу, М. (2023). "Углеродистые макроископаемые из раннемезопротерозойской формации Гаоючжуан в хребте Яньшань, Северный Китай". Precambrian Research . 392 . 107074. Bibcode :2023PreR..39207074C. doi :10.1016/j.precamres.2023.107074.
  55. ^ Javaux, Emmanuelle J.; Knoll, Andrew H.; Walter, Malcolm R. (2004). «Доказательства эукариотического разнообразия в океанах среднего протерозоя, полученные с помощью ТЭМ». Geobiology . 2 (3): 121–132. Bibcode : 2004Gbio....2..121J. doi : 10.1111/j.1472-4677.2004.00027.x. S2CID  53600639.
  56. ^ Юн, Хван Су; Хакетт, Джеремия Д.; Чинилья, Клаудия; Пинто, Габриэле; Бхаттачарья, Дебашиш (2004). «Молекулярная хронология происхождения фотосинтезирующих эукариот». Молекулярная биология и эволюция . 21 (5): 809–818. дои : 10.1093/molbev/msh075 . ПМИД  14963099.
  57. ^ Баттерфилд, Николас Дж. (2000). " Bangiomorpha pubescens n. gen., n. sp.: значение для эволюции пола, многоклеточности и мезопротерозойской/неопротерозойской радиации эукариот". Палеобиология . 26 (3): 386–404. Bibcode : 2000Pbio...26..386B. doi : 10.1666/0094-8373(2000)026<0386:BPNGNS>2.0.CO;2. S2CID  36648568.

Внешние ссылки