stringtranslate.com

Аспергилл

Aspergillus ( / ˌ æ s p ər ˈ ɪ l ə s / ) —род, состоящий из нескольких сотенплесневых грибов, встречающихся в различных климатических зонах по всему миру.

Aspergillus был впервые каталогизирован в 1729 году итальянским священником и биологом Пьером Антонио Микели . Рассматривая грибы под микроскопом, Микели вспомнил о форме аспергиллума ( окропитель святой воды), от латинского spargere (окроплять), и назвал род соответствующим образом. [2] [3] Aspergillum — это бесполая спорообразующая структура, общая для всех видов Aspergillus ; известно также, что около трети видов имеют половую стадию. [4] Хотя некоторые виды Aspergillus известны тем, что вызывают грибковые инфекции, другие имеют коммерческое значение.

Таксономия

Разновидность

В марте 2010 года род Aspergillus охватывал 837 видов грибов. [5] Известные виды, отнесенные к роду Aspergillus, включают:

Внутренняя таксономия

Обширный род Aspergillus в настоящее время делится на шесть подродов , многие из которых далее подразделяются на 27 секций . [6]

Рост и распространение

Аспергилл на томате в деталях

Aspergillus определяется как группа конидиальных грибов, то есть грибов в бесполом состоянии. Однако известно, что некоторые из них имеют телеоморф ( половое состояние) в Ascomycota . Согласно ДНК-доказательствам, все члены рода Aspergillus являются членами типа Ascomycota . [ необходима цитата ]

Представители рода обладают способностью расти там, где существует высокое осмотическое давление (высокая концентрация сахара, соли и т. д.). Виды Aspergillus являются высокоаэробными и встречаются почти во всех богатых кислородом средах, где они обычно растут как плесень на поверхности субстрата в результате высокого напряжения кислорода. Обычно грибы растут на богатых углеродом субстратах, таких как моносахариды (например, глюкоза ) и полисахариды (например, амилоза ). Виды Aspergillus являются распространенными загрязнителями крахмалистых продуктов (например, хлеба и картофеля) и растут на многих растениях и деревьях. [ необходима цитата ]

В дополнение к росту на источниках углерода, многие виды Aspergillus демонстрируют олиготрофию , когда они способны расти в средах с дефицитом питательных веществ или в средах с полным отсутствием ключевых питательных веществ. Aspergillus niger является ярким примером этого; его можно обнаружить растущим на влажных стенах, как основной компонент плесени . [ необходима цитата ]

Несколько видов Aspergillus , включая A. niger и A. fumigatus , легко колонизируют здания, [7] предпочитая теплые и сырые или влажные помещения, такие как ванные комнаты и вокруг оконных рам . [8]

Аспергиллы обнаружены в миллионах подушек. [9]

Коммерческое значение

Различные виды грибов Penicillium , Aspergillus и другие, растущие в аксенической культуре
Историческая модель Aspergillus , Ботанический музей Грайфсвальда

Виды Aspergillus важны с медицинской и коммерческой точки зрения. Некоторые виды могут вызывать инфекции у людей и других животных. Некоторые инфекции, обнаруженные у животных, изучались годами, в то время как другие виды, обнаруженные у животных, были описаны как новые и специфичные для исследуемого заболевания, а другие были известны как названия, уже используемые для таких организмов, как сапрофиты . Более 60 видов Aspergillus являются патогенами, значимыми с медицинской точки зрения. [10] У людей обнаружен ряд заболеваний, таких как инфекция наружного уха, поражения кожи и язвы, классифицируемые как мицетомы . [ необходима ссылка ]

Другие виды важны в коммерческой микробной ферментации. Например, алкогольные напитки, такие как японское сакэ , часто производятся из риса или других крахмалистых ингредиентов (например, маниока ), а не из винограда или соложеного ячменя. Типичные микроорганизмы, используемые для производства алкоголя, такие как дрожжи рода Saccharomyces , не могут ферментировать эти крахмалы. Поэтому плесень коджи , такая как Aspergillus oryzae , используется для первого расщепления крахмалов на более простые сахара. [11]

Представители этого рода также являются источниками натуральных продуктов , которые могут быть использованы при разработке лекарств для лечения заболеваний человека. [12] Известно, что Aspergillus spp. вырабатывают антрахинон, который имеет коммерческое значение из-за своих антибактериальных и противогрибковых свойств. [13]

Возможно, самое большое применение Aspergillus niger — это в качестве основного источника лимонной кислоты ; на этот организм приходится более 99% мирового производства лимонной кислоты, или более 1,4 миллиона тонн (>1,5 миллиона тонн США) в год. [ требуется ссылка ] A. niger также обычно используется для производства собственных и чужеродных ферментов , включая глюкозооксидазу , лизоцим и лактазу . [14] В этих случаях культура редко выращивается на твердом субстрате, хотя это все еще распространенная практика в Японии, но чаще выращивается как погруженная культура в биореакторе . Таким образом, можно строго контролировать наиболее важные параметры и достигать максимальной производительности. Этот процесс также значительно упрощает отделение важного химического вещества или фермента от среды и, следовательно, является гораздо более экономически эффективным.

Исследовать

Четыре трехдневные колонии Aspergillus . По часовой стрелке от верхнего левого угла: лабораторный штамм A. nidulans ; аналогичный штамм с мутацией в гене-маркере yA , участвующем в зеленой пигментации; штамм A. oryzae, используемый при ферментации сои; A. oryzae RIB40
Сканирование Aspergillus , выполненное при 235-кратном увеличении под сканирующим электронным микроскопом.

A. nidulans ( Emericella nidulans ) использовался в качестве исследовательского организма в течение многих лет и был использован Гвидо Понтекорво для демонстрации парасексуальности у грибов. Недавно A. nidulans был одним из первых организмов, геном которого был секвенирован исследователями из Института Брода . По состоянию на 2008 год, еще семь видов Aspergillus имели свои геномы секвенированы: промышленно полезные A. niger (два штамма), A. oryzae и A. terreus , а также патогены A. clavatus , A. fischerianus ( Neosartorya fischeri ), A. flavus и A. fumigatus (два штамма). [15] A. fischerianus почти никогда не является патогенным, но очень тесно связан с распространенным патогеном A. fumigatus ; он был секвенирован частично, чтобы лучше понятьпатогенность A. fumigatus . [16]

Половое размножение

Из 250 видов аспергиллов около 64% ​​не имеют известного полового состояния. [17] Однако многие из этих видов, вероятно, имеют пока не идентифицированную половую стадию. [17] Половое размножение происходит двумя принципиально разными способами у грибов. Это ауткроссинг (у гетероталличных грибов), при котором две разные особи вносят ядра, и самооплодотворение или самоопыление (у гомоталличных грибов), при котором оба ядра происходят от одной и той же особи. В последние годы половые циклы были обнаружены у многочисленных видов, ранее считавшихся бесполыми. Эти открытия отражают недавнее экспериментальное внимание к видам, имеющим особое значение для человека. [ необходима ссылка ]

A. fumigatus — наиболее распространенный вид, вызывающий заболевания у людей с иммунодефицитом . В 2009 году было показано, что A. fumigatus имеет гетероталличный, полностью функциональный половой цикл. [18] Для возникновения секса необходимы изоляты комплементарных типов спаривания .

A. flavus является основным производителем канцерогенных афлатоксинов в сельскохозяйственных культурах по всему миру. Он также является оппортунистическим патогеном человека и животных , вызывая аспергиллез у лиц с ослабленным иммунитетом. В 2009 году было обнаружено, что половое состояние этого гетероталличного грибка возникает, когда штаммы противоположных типов спаривания культивируются вместе в соответствующих условиях. [19]

A. lentulus — это оппортунистический патоген человека, вызывающий инвазивный аспергиллез с высоким уровнем смертности . В 2013 году было обнаружено, что A. lentulus имеет гетероталличную функциональную систему полового размножения. [20]

A. terreus обычно используется в промышленности для производства важных органических кислот и ферментов, и был первоначальным источником для препарата, снижающего уровень холестерина, ловастатина . В 2013 году было обнаружено, что A. terreus способен к половому размножению, когда штаммы противоположных типов спаривания скрещивались в соответствующих условиях культивирования. [21]

Эти результаты, полученные в отношении видов Aspergillus , согласуются с накопленными доказательствами, полученными в результате исследований других видов эукариот , что пол, вероятно, присутствовал у общего предка всех эукариот . [22] [23]

A. nidulans , гомоталличный гриб, способен к самооплодотворению. Самооплодотворение включает в себя активацию тех же путей спаривания, которые характерны для пола у скрещивающихся видов, то есть самооплодотворение не обходит необходимые пути для скрещивания полов, а вместо этого требует активации этих путей в пределах одной особи. [24]

Среди тех видов Aspergillus , которые демонстрируют половой цикл, подавляющее большинство в природе являются гомоталличными (самооплодотворяющимися). [25] Это наблюдение предполагает, что виды Aspergillus, как правило, могут сохранять пол, хотя гомоталличное самооплодотворение производит небольшую генетическую изменчивость . A. fumigatus , гетероталличный (ауткроссинг) гриб, который встречается в областях с сильно различающимся климатом и средой, также демонстрирует небольшую генетическую изменчивость как в пределах географических регионов, так и в глобальном масштабе, [26] снова предполагая, что пол, в данном случае ауткроссинговый пол, может сохраняться даже при небольшой генетической изменчивости.

Геномика

Одновременная публикация трех рукописей генома Aspergillus в журнале Nature в декабре 2005 года определила этот род как ведущий род нитчатых грибов для сравнительных геномных исследований. Как и большинство крупных геномных проектов, эти усилия были результатом сотрудничества между крупным центром секвенирования и соответствующим сообществом ученых. Например, Институт исследований генома (TIGR) работал с сообществом A. fumigatus . A. nidulans был секвенирован в Институте Брода. A. oryzae был секвенирован в Японии в Национальном институте передовой промышленной науки и технологий . Объединенный институт генома Министерства энергетики опубликовал данные о последовательности штамма A. niger , продуцирующего лимонную кислоту . TIGR, теперь переименованный в Институт Дж. Крейга Вентера , в настоящее время возглавляет проект по геному A. flavus . [27]

Aspergillus характеризуется высоким уровнем генетического разнообразия и, используя дивергенцию первичноротых в качестве масштаба, столь же разнообразен, как и тип позвоночных, хотя как межвидовая, так и внутривидовая структура генома относительно пластична. [28] Геномы некоторых видов Aspergillus , таких как A. flavus и A. oryzae , более богаты и примерно на 20% больше, чем у других, таких как A. nidulans и A. fumigatus . Несколько механизмов могли бы объяснить эту разницу, хотя комбинация сегментной дупликации, дупликации генома и горизонтального переноса генов, действующих по частям, хорошо поддерживается. [29]

Размеры генома для секвенированных видов Aspergillus варьируются от примерно 29,3 Мб для A. fumigatus до 37,1 Мб для A. oryzae , в то время как число предсказанных генов варьируется от примерно 9926 для A. fumigatus до примерно 12 071 для A. oryzae . Размер генома штамма A. niger , продуцирующего фермент , имеет промежуточный размер и составляет 33,9 Мб. [3]

Возбудители болезней

Некоторые виды Aspergillus вызывают серьезные заболевания у людей и животных. Наиболее распространенными патогенными видами являются A. fumigatus и A. flavus , которые производят афлатоксин, который является как токсином, так и канцерогеном и может загрязнять продукты питания, такие как орехи. Наиболее распространенными видами, вызывающими аллергические заболевания, являются A. fumigatus и A. clavatus . Другие виды важны как сельскохозяйственные патогены. Aspergillus spp. вызывают заболевания многих зерновых культур, особенно кукурузы , а некоторые варианты синтезируют микотоксины , включая афлатоксин. Aspergillus может вызывать неонатальные инфекции . [30]

Инфекции, вызываемые A. fumigatus (наиболее распространенный вид), являются первичными легочными инфекциями и могут потенциально перерасти в быстро некротизирующую пневмонию с потенциалом распространения. Организм можно отличить от других распространенных плесневых инфекций по тому факту, что он принимает форму плесени как в окружающей среде, так и в хозяине (в отличие от Candida albicans , которая является диморфной плесенью в окружающей среде и дрожжами в организме). [ необходима цитата ]

Аспергиллез

Аспергиллез легких

Аспергиллез — это группа заболеваний, вызываемых Aspergillus . Наиболее распространенным видом среди инфекций околоносовых пазух, связанных с аспергиллезом, является A. fumigatus . [31] Симптомы включают лихорадку, кашель, боль в груди или одышку, которые также наблюдаются при многих других заболеваниях, поэтому диагностика может быть затруднена. Обычно восприимчивы только пациенты с уже ослабленной иммунной системой или страдающие другими заболеваниями легких . [ необходима цитата ]

У людей основными формами заболеваний являются: [32] [33]

Грибковые инфекции от спор Aspergillus остаются одной из теорий болезней и преждевременной смерти некоторых ранних египтологов и исследователей гробниц. Древние споры, которые росли на остатках пищевых приношений и мумиях, запечатанных в гробницах и камерах, могли быть разнесены ветром и вдохнуты археологами, что в конечном итоге связано с понятием проклятия фараонов . [34]

Аспергиллез дыхательных путей также часто наблюдается у птиц, а некоторые виды Aspergillus , как известно, заражают насекомых. [10]

Большинство людей вдыхают аспергиллы в легкие каждый день [35] , но, как правило, аспергиллезом заболевают только люди с ослабленным иммунитетом . [35]

Смотрите также

Ссылки

  1. ^ «Синонимия. Текущее название: Aspergillus P. Micheli ex Haller, Hist. Strip. Helv. (Bernae) 3: 113 (1768)» . Вид Фунгорум . Проверено 10 октября 2023 г.
  2. ^ Andrade-Filho Jde S, Pena GP (сентябрь–октябрь 2010 г.). «Аналогии в медицине: грибок и литургия». Rev Inst Med Trop Sao Paulo . 52 (5): 288. doi : 10.1590/s0036-46652010000500014 . PMID  21049237.
  3. ^ ab Bennett JW (2010). «Обзор рода Aspergillus ».Aspergillus : Молекулярная биология и геномика . Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-53-0.
  4. ^ Geiser DM (2009). "Половые структуры у Aspergillus: морфология, значение и геномика". Medical Mycology . 47. 47 (Suppl 1): S21-6. doi :10.1080/13693780802139859. PMID  18608901.
  5. ^ Hawksworth DL (апрель 2011 г.). «Название видов Aspergillus: прогресс в направлении одного названия для каждого вида». Medical Mycology . 49 Suppl 1 (S1): S70-6. doi : 10.3109/13693786.2010.504753 . PMID  20718610.
  6. ^ Хубракен Дж., Кочубе С., Визаги СМ, ​​Юлмаз Н., Ван XC, Мейер М., Краак Б., Хубка В., Бенш К., Самсон Р.А., Фрисвад Дж.К. (2020). «Классификация Aspergillus, Penicillium, Talaromyces и родственных родов (Eurotiales): обзор семейств, родов, подродов, разделов, серий и видов». Исследования по микологии . 95 : 5–169. doi : 10.1016/j.simyco.2020.05.002. ПМЦ 7426331 . ПМИД  32855739. 
  7. ^ Latgé JP (апрель 1999). «Aspergillus fumigatus и аспергиллез». Clinical Microbiology Reviews . 12 (2): 310–50. doi :10.1128/CMR.12.2.310. PMC 88920. PMID 10194462  . 
  8. ^ "Что такое споры грибов?". Университет Вустера . Получено 6 августа 2019 г.
  9. ^ "Подушки: Горячая грядка грибковых спор". Science Daily . Архивировано из оригинала 2017-10-08 . Получено 2017-05-08 .
  10. ^ ab Thom C, Church M (1926). Aspergilli . Балтимор: The Williams & Wilkins Company.
  11. ^ Spiegel A (8 апреля 2014 г.). «Используете ли вы правильный соевый соус? Вот как это выяснить». The Huffington Post . Архивировано из оригинала 2017-08-06 . Получено 2017-07-29 . ...чтобы приготовить соевый соус, сначала нужно добавить плесень аспергилла к соевым бобам и зернам, чтобы получить смесь, называемую кодзи.
  12. ^ US 6069146, Феникал, Уильям; Дженсен, Пол Р. и Ченг, Син К., «Галимид, цитотоксический морской натуральный продукт и его производные», опубликовано 30 мая 2000 г., передано регентам Калифорнийского университета 
  13. ^ Тома, Мария Афроз; Назир, КХМ Назмул Хуссейн; Махмуд, Мд Мукет; Мишра, Правин; Али, Мд Коусер; Кабир, Аджран; Шахид, Мд Ахосанул Хак; Сиддик, Махбубул Пратик; Алим, Мд Абдул (2021). «Выделение и идентификация натурального красителя, продуцирующего почвенный Aspergillus niger из Бангладеш, и извлечение пигмента». Продукты питания . 10 (6): 1280. doi : 10.3390/foods10061280 . PMC 8227025. PMID  34205202 . 
  14. ^ "Уведомление GRAS для кислой лактазы из Aspergillus oryzae, экспрессируемой в Aspergillus niger". Управление по контролю за продуктами питания и лекарственными средствами . Архивировано из оригинала 2016-03-23 . Получено 2016-03-17 .Раздел 2.
  15. ^ Wortman JR, Gilsenan JM, Joardar V, Deegan J, Clutterbuck J, Andersen MR и др. (март 2009 г.). «Обновление аннотации генома Aspergillus nidulans 2008 г.: совместные усилия». Fungal Genetics and Biology . 46. 46 Suppl 1 (1): S2-13. doi :10.1016/j.fgb.2008.12.003. PMC 2826280 . PMID  19146970. 
  16. ^ "Descriptions – Aspergillus Comparative". Broad Institute . Архивировано из оригинала 22 ноября 2009 года . Получено 2009-10-15 .
  17. ^ ab Dyer PS, O'Gorman CM (декабрь 2011 г.). «Грибковая сексуальная революция: Aspergillus и Penicillium показывают путь». Current Opinion in Microbiology . 14 (6): 649–54. doi :10.1016/j.mib.2011.10.001. PMID  22032932.
  18. ^ O'Gorman CM, Fuller H, Dyer PS (январь 2009). «Открытие полового цикла у условно-патогенного грибка Aspergillus fumigatus». Nature . 457 (7228): 471–4. Bibcode :2009Natur.457..471O. doi :10.1038/nature07528. PMID  19043401. S2CID  4371721.
  19. ^ Horn BW, Moore GG, Carbone I (2009). «Половое размножение Aspergillus flavus». Mycologia . 101 (3): 423–9. doi :10.3852/09-011. PMID  19537215. S2CID  20648447.
  20. ^ Swilaiman SS, O'Gorman CM, Balajee SA, Dyer PS (июль 2013 г.). «Открытие полового цикла у Aspergillus lentulus, близкого родственника A. fumigatus». Eukaryotic Cell . 12 (7): 962–9. doi :10.1128/EC.00040-13. PMC 3697472. PMID  23650087 . 
  21. ^ Арабатзис М, Велеграки А (2013). «Половое размножение у условно-патогенного человека Aspergillus terreus». Mycologia . 105 (1): 71–9. doi :10.3852/11-426. PMID  23074177. S2CID  9584227.
  22. ^ Malik SB, Pightling AW, Stefaniak LM, Schurko AM, Logsdon JM (август 2007 г.). «Расширенный перечень консервативных мейотических генов свидетельствует о наличии пола у Trichomonas vaginalis». PLOS ONE . 3 (8): e2879. Bibcode : 2008PLoSO...3.2879M. doi : 10.1371/journal.pone.0002879 . PMC 2488364. PMID  18663385 . 
  23. ^ Heitman J, Sun S, James TY (2013). «Эволюция полового размножения грибов». Mycologia . 105 (1): 1–27. doi :10.3852/12-253. PMID  23099518. S2CID  18167947.
  24. ^ Paoletti M, Seymour FA, Alcocer MJ, Kaur N, Calvo AM, Archer DB, Dyer PS (август 2007 г.). «Тип спаривания и генетическая основа самофертильности у модельного гриба Aspergillus nidulans». Current Biology . 17 (16): 1384–9. Bibcode : 2007CBio...17.1384P. doi : 10.1016/j.cub.2007.07.012 . PMID  17669651. S2CID  17068935.
  25. ^ Дайер PS, О'Горман CM (январь 2012 г.). «Половое развитие и скрытая сексуальность у грибов: взгляд из видов Aspergillus». FEMS Microbiology Reviews . 36 (1): 165–92. doi : 10.1111/j.1574-6976.2011.00308.x . PMID  22091779.
  26. ^ Rydholm C, Szakacs G, Lutzoni F (апрель 2006 г.). «Низкая генетическая изменчивость и отсутствие обнаруживаемой популяционной структуры у aspergillus fumigatus по сравнению с близкородственными видами Neosartorya». Eukaryotic Cell . 5 (4): 650–7. doi : 10.1128 /EC.5.4.650-657.2006. PMC 1459663. PMID  16607012. 
  27. ^ Мачида М., Гоми К., ред. (2010).Aspergillus : Молекулярная биология и геномика . Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-53-0.
  28. ^ Gibbons JG, Rokas A (январь 2013 г.). «Функция и эволюция генома Aspergillus». Trends in Microbiology . 21 (1): 14–22. doi :10.1016/j.tim.2012.09.005. PMC 3534798. PMID  23084572 . 
  29. ^ Khaldi N, Wolfe KH (август 2008 г.). Gadagkar S (ред.). "Неуловимое происхождение дополнительных генов в Aspergillus oryzae". PLOS ONE . 3 (8): e3036. Bibcode : 2008PLoSO...3.3036K. doi : 10.1371/journal.pone.0003036 . PMC 2515630. PMID  18725939 . 
  30. ^ Cloherty J (2012). Руководство по уходу за новорожденными . Филадельфия: Wolters Kluwer Health/Lippincott Williams & Wilkins. ISBN 978-1-60831-777-6; Доступ предоставлен Питтсбургским университетом.{{cite book}}: CS1 maint: постскриптум ( ссылка )
  31. ^ Бозкурт М.К., Озчелик Т., Сайдам Л., Кутлуай Л. (2008). «[Случай изолированного аспергиллеза гайморовой пазухи]». Кулак Бурун Богаз Ихтисас Дергиси (на турецком языке). 18 (1): 53–5. ПМИД  18443405.
  32. ^ "Аспергиллез". MedScape. Архивировано из оригинала 2014-02-23 . Получено 2014-06-29 .
  33. ^ Wilson WR, Sande MA, Drew WL, ред. (2001). Современная диагностика и лечение инфекционных заболеваний . Lange Medical Books/McGraw-Hill.
  34. ^ Ди Паоло Н., Гварниери А., Гарози Г., Сакки Г., Манджаротти А.М., Ди Паоло М. (1994). «Вдыхание микотоксинов приводит к острой почечной недостаточности». Нефрология, Диализ, Трансплантация . 9 (Приложение 4): 116–20. ПМИД  7800243.
  35. ^ ab "Аспергиллез | Типы грибковых заболеваний | Грибковые заболевания | CDC". www.cdc.gov . 2021-05-10 . Получено 2022-09-02 .

Дальнейшее чтение

Внешние ссылки