КАКТИН

Ген, кодирующий белок у человека

Кактин, также известный как антиген почечной карциномы NY-REN-24, представляет собой белок , который у людей кодируется геном CACTIN . [ ^{5] [6] [7]}

^[8] При активации Toll-сигнализации грамположительными и грамотрицательными бактериями, кактин в цитозоле связывается с кактусом и опосредует высвобождение Dif и Dorsal из кактуса, что позволяет им перемещаться в ядро ​​и активировать гены AMP.

Кактин был первоначально идентифицирован у дрозофилы (плодовых мушек). Ген кактина является продуктом, участвующим в регуляции врожденной иммунной системы . Он действует как отрицательный регулятор толл-подобного рецептора , регуляторного фактора интерферона (IRF) и канонических сигнальных путей NF-kappa-B . ^[9]

Структура

Длина полноразмерного белка кактина составляет 3150 п.н. с N-концом из 356–547 остатков и доменом в C-конце из 731–855 остатков. ^[10]

Распределение видов и тканей

Этот белок находится во многих органах и тканях всех позвоночных, однако он также был обнаружен в растениях, простейших и грибах. Место, где наблюдается самая высокая концентрация гена кактина, находится в семенниках самцов и в селезенке. Ген кактина в этой конкретной области, такой как семенники, обеспечивает активность связывания РНК. Было также обнаружено, что этот белок участвует в других процессах, таких как клеточный ответ от цитокинов и отрицательная сигнальная трансдукция (отрицательные обратные петли). ^[11]

В растениях

В растениях какцин связан с белками SR, локализованными в ядерных спеклах . ^[12] Растительные и человеческие клетки имеют одни и те же сплайсосомные белки, которые включают удаление интронов для формирования зрелой информационной РНК.

Ссылки

1. GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000105298 – Ensembl , май 2017 г.
2. GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000034889 – Ensembl , май 2017 г.
3. "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
4. "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
5. Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшенного построения библиотеки дробовика». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–113. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID  8619474.
6. Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W и др. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование ДНК». Genome Research . 7 (4): 353–358. doi :10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146 . PMID  9110174. 
7. "Ген Энтреза: C19orf29 хромосома 19 открытая рамка считывания 29".
8. Jo YH, Kim YJ, Park KB, Seong JH, Kim SG, Park S и др. (апрель 2017 г.). «TmCactin играет важную роль в грамотрицательной и положительной бактериальной инфекции, регулируя экспрессию 7 генов AMP у Tenebrio molitor». Scientific Reports . 7 (1): 46459. Bibcode :2017NatSR...746459J. doi :10.1038/srep46459. PMC 5394457 . PMID  28418029. 
9. "Ген CACTIN - GeneCards | Белок CATIN | Антитело CATIN". www.genecards.org . Получено 03.03.2022 .
10. Zhang S, Shi L, Yang QH, Dong XH, Chi SY, Liu HY, Tan BP (декабрь 2014 г.). «Молекулярная характеристика и функциональный анализ гена кактина из Litopenaeus vannamei». Fish & Shellfish Immunology . 41 (2): 608–617. Bibcode :2014FSI....41..608Z. doi :10.1016/j.fsi.2014.10.014. PMID  25462455.
11. "CACTIN кактин, субъединица комплекса сплайсосомы C [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 24.04.2022 .
12. Baldwin KL, Dinh EM, Hart BM, Masson PH (апрель 2013 г.). «CACTIN — это важный ядерный белок Arabidopsis, который может быть связан с эукариотической сплайсосомой». FEBS Letters . 587 (7): 873–879. Bibcode : 2013FEBSL.587..873B. doi : 10.1016/j.febslet.2013.02.041 . PMID  23454656. S2CID  10857716.

Дальнейшее чтение

• Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V и др. (ноябрь 1999 г.). «Антигены, распознаваемые аутологичными антителами у пациентов с почечно-клеточной карциномой». International Journal of Cancer . 83 (4): 456–464. doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19991112)83:4<456::AID-IJC4>3.0.CO;2-5 . PMID  10508479.
• Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (апрель 2002 г.). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа». РНК . 8 (4): 426–439. doi :10.1017/S1355838202021088. PMC  1370266 . PMID  11991638.
• Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (январь 2004 г.). «Анализ высокопроизводительной дрожжевой двухгибридной системы и ее использование для прогнозирования функции внутриклеточных белков, закодированных в области MHC класса III человека». Genomics . 83 (1): 153–167. doi :10.1016/S0888-7543(03)00235-0. PMID  14667819.
• Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ и др. (июнь 2004 г.). «Характеристика транскриптома проливает свет на сигнальные сети, которые контролируют рост и дифференцировку эмбриональных стволовых клеток человека». Nature Biotechnology . 22 (6): 707–716. doi :10.1038/nbt971. PMID  15146197. S2CID  27764390.
• Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, et al. (август 2004 г.). «Крупномасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (33): 12130–12135. Bibcode : 2004PNAS..10112130B. doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC  514446. PMID  15302935 .