Ген, кодирующий белок у вида Homo sapiens
Субъединица бета-фактора связывания ядра — это белок , который у людей кодируется геном CBFB . [ 5] [6]
Белок, кодируемый этим геном, является бета-субъединицей гетеродимерного связывающего ядро фактора транскрипции, принадлежащего к семейству факторов транскрипции PEBP2/CBF, который управляет множеством генов, специфичных для кроветворения (например, RUNX1 ) и остеогенеза (например, RUNX2 ). Бета-субъединица является не связывающей ДНК регуляторной субъединицей; она аллостерически усиливает связывание ДНК альфа-субъединицей, поскольку комплекс связывается с основным сайтом различных усилителей и промоторов, включая вирус лейкемии мышей, усилитель полиомавируса, усилители рецепторов Т-клеток и промоторы GM-CSF. Альтернативный сплайсинг генерирует два варианта мРНК, каждый из которых кодирует отдельный карбоксильный конец. В некоторых случаях перицентрическая инверсия хромосомы 16 [inv(16)(p13q22)] приводит к образованию химерного транскрипта, состоящего из N-конца фактора связывания ядра бета в слиянии с C-концевой частью тяжелой цепи гладкомышечного миозина 11. Эта хромосомная перестройка связана с острым миелоидным лейкозом подтипа M4Eo. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие различные изоформы. [7]
Мутации в CBFB связаны со случаями рака молочной железы . [8]
Острый миелоидный лейкоз, связанный с основным связывающим фактором, — это рак, связанный с генетическими изменениями в гене CBF. Чаще всего он вызывается инверсией определенного участка хромосомы 16; однако он также может быть вызван транслокацией между копиями хромосомы 16. Перестройки вызывают образование CBF, но с нарушенной функцией. Это препятствует правильной дифференциации клеток крови, что приводит к образованию миелобластов . [9]
Ссылки
- ^ abc GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000067955 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ abc GRCm38: Ensembl выпуск 89: ENSMUSG00000031885 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ "Human PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ "Mouse PubMed Reference:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Лю П., Тарле С.А., Хаджра А., Клэкстон Д.Ф., Марлтон П., Фридман М., Сицилиано М.Дж., Коллинз Ф.С. (сентябрь 1993 г.). «Слияние транскрипционного фактора CBF бета/PEBP2 бета и тяжелой цепи миозина при остром миелолейкозе». Наука . 261 (5124) (опубликовано 20 августа 1993 г.): 1041–4. Бибкод : 1993Sci...261.1041L. дои : 10.1126/science.8351518. ISSN 0036-8075. PMID 8351518. S2CID 13278253. Викиданные Q24311601.
- ^ Liu P, Seidel N, Bodine D, Speck N, Tarle S, Collins FS (ноябрь 1995 г.). «Острый миелоидный лейкоз с Inv (16) производит химерный фактор транскрипции с хвостом тяжелой цепи миозина». Cold Spring Harb Symp Quant Biol . 59 : 547–53. doi :10.1101/sqb.1994.059.01.061. PMID 7587111.
- ^ «Ген Энтреза: фактор связывания ядра CBFB, бета-субъединица».
- ^ The Cancer Genome Atlas Network (2012). «Комплексные молекулярные портреты опухолей молочной железы человека». Nature . 490 (7418). Nature Publishing Group: 61–70. Bibcode :2012Natur.490...61T. doi :10.1038/nature11412. PMC 3465532 . PMID 23000897.
- ^ "CBFB Gene." Genetics Home Reference. Национальная медицинская библиотека США, 10 сентября 2015 г. Интернет. 27 сентября 2015 г.
Внешние ссылки
Дальнейшее чтение
- Hart SM, Foroni L (2003). «Гены основного фактора связывания и лейкемия человека». Haematologica . 87 (12): 1307–23. PMID 12495904.
- Bae SC, Takahashi E, Zhang YW и др. (1995). «Клонирование, картирование и экспрессия PEBP2 alpha C, третьего гена, кодирующего домен Runt млекопитающих». Gene . 159 (2): 245–8. doi :10.1016/0378-1119(95)00060-J. PMID 7622058.
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к облегчению открытия генов». Genome Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548.
- Хиллер Л. Д., Леннон Г., Беккер М. и др. (1997). «Создание и анализ 280 000 экспрессируемых человеком последовательностей». Genome Res . 6 (9): 807–28. doi : 10.1101/gr.6.9.807 . PMID 8889549.
- Hajra A, Collins FS (1 ноября 1996 г.). «Retraction: Structure of the Leukemia-Associated Human CBFB Gene». Genomics (на английском и английском языках). 38 (1): 107. doi :10.1006/GENO.1996.0603. ISSN 0888-7543. PMID 9064279. Wikidata Q56607463.
- Chiba N, Watanabe T, Nomura S и др. (1997). «Зависимая от дифференциации экспрессия и четкая субклеточная локализация продукта протоонкогена PEBP2beta/CBFbeta в развитии мышц». Oncogene . 14 (21): 2543–52. doi : 10.1038/sj.onc.1201109 . PMID 9191054.
- Tanaka Y, Watanabe T, Chiba N и др. (1997). «Продукт протоонкогена, PEBP2beta/CBFbeta, в основном локализуется в цитоплазме и имеет сродство к структурам цитоскелета». Oncogene . 15 (6): 677–83. doi :10.1038/sj.onc.1201235. PMID 9264408. S2CID 7192875.
- Kitabayashi I, Ida K, Morohoshi F, et al. (1998). "Лейкемический слитый белок AML1-MTG8 образует комплекс с новым членом семейства MTG8(ETO/CDR), MTGR1". Mol. Cell. Biol . 18 (2): 846–58. doi :10.1128/MCB.18.2.846. PMC 108796. PMID 9447981 .
- Levanon D, Goldstein RE, Bernstein Y, et al. (1998). «Транскрипционная репрессия AML1 и LEF-1 опосредована корепрессорами TLE/Groucho». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (20): 11590–5. Bibcode :1998PNAS...9511590L. doi : 10.1073/pnas.95.20.11590 . PMC 21685 . PMID 9751710.
- Kogan SC, Lagasse E, Atwater S и др. (1998). «Слияние PEBP2betaMYH11, созданное Inv(16)(p13;q22) при миелоидной лейкемии, нарушает созревание нейтрофилов и способствует гранулоцитарной дисплазии». Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 95 (20): 11863–8. Bibcode :1998PNAS...9511863K. doi : 10.1073/pnas.95.20.11863 . PMC 21731 . PMID 9751756.
- Goger M, Gupta V, Kim WY и др. (1999). «Молекулярные данные об остром лейкозе, связанном с PEBP2/CBF beta-SMMHC, полученные на основе структуры PEBP2/CBF beta». Nat. Struct. Biol . 6 (7): 620–3. doi :10.1038/10664. PMID 10404215. S2CID 13114284.
- Lutterbach B, Hou Y, Durst KL, Hiebert SW (1999). "Inv(16) кодирует транскрипционный корепрессор острого миелоидного лейкоза 1". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (22): 12822–7. Bibcode :1999PNAS...9612822L. doi : 10.1073/pnas.96.22.12822 . PMC 23113 . PMID 10536006.
- Warren AJ, Bravo J, Williams RL , Rabbitts TH (2000). «Структурная основа гетеродимерного взаимодействия между факторами транскрипции, связанными с острым лейкозом AML1 и CBFbeta». The EMBO Journal . 19 (12): 3004–15. doi :10.1093/emboj/19.12.3004. PMC 203359. PMID 10856244 .
- Kanto S, Chiba N, Tanaka Y и др. (2000). «Химерный белок PEBP2beta/CBF beta-SMMHC локализуется как в клеточной мембране, так и в ядерных субфракциях лейкозных клеток, несущих хромосомную инверсию 16». Leukemia . 14 (7): 1253–9. doi :10.1038/sj.leu.2401821. PMID 10914550. S2CID 22471555.
- O'Reilly J, Chipper L, Springall F, Herrmann R (2000). "Уникальная структурная аномалия хромосомы 16, приводящая к транскрипту слияния CBF beta-MYH11 у пациента с острым миелоидным лейкозом, FAB M4". Cancer Genet. Cytogenet . 121 (1): 52–5. doi :10.1016/S0165-4608(00)00235-1. PMID 10958941.
- Bravo J, Li Z, Speck NA, Warren AJ (2001). «Связанный с лейкемией комплекс AML1 (Runx1)--CBF бета функционирует как молекулярный зажим, индуцированный ДНК». Nat. Struct. Biol . 8 (4): 371–8. doi :10.1038/86264. PMID 11276260. S2CID 23570097.
- Бэкстрём С., Вольф-Ватц М., Грундстрём К. и др. (2002). «Домен RUNX1 Runt при разрешении 1,25 А: структурный переключатель и специфически связанные ионы хлорида модулируют связывание ДНК». J. Mol. Biol . 322 (2): 259–72. doi :10.1016/S0022-2836(02)00702-7. PMID 12217689.