stringtranslate.com

кривая Карлсона

Общая стоимость секвенирования генома человека с течением времени, рассчитанная NHGRI .

Кривая Карлсона — это термин, описывающий скорость секвенирования ДНК или стоимость секвенированного основания как функцию времени. [1] Это биотехнологический эквивалент закона Мура . Карлсон предсказал, что время удвоения технологий секвенирования ДНК (измеренное по стоимости и производительности) будет по крайней мере таким же быстрым, как закон Мура. [2]

История

Термин был введен журналом The Economist [3] и назван в честь автора Роба Карлсона. [1]

Кривые Карлсона иллюстрируют быстрое (в некоторых случаях выше экспоненциального роста ) снижение стоимости и повышение производительности различных технологий, включая секвенирование ДНК, синтез ДНК и ряд физических и вычислительных инструментов, используемых в производстве белков и определении структур белков .

Секвенирование нового поколения

Цех секвенирования в BGI Hong Kong, где представлены секвенаторы Illumina Hiseq 2000

Закон Мура начал существенно нарушаться в январе 2008 года, когда центры перешли от секвенирования по Сэнгеру к более новым технологиям секвенирования ДНК: [4] секвенирование 454 со средней длиной прочтения = 300-400 оснований (в 10 раз) секвенирование Illumina и SOLiD со средней длиной прочтения = 50-100 оснований (в 30 раз).

Ссылки

  1. ^ Роберт Х. Карлсон (апрель 2011 г.). Биология — это технология: обещание, опасность и новый бизнес инженерной жизни. Кембридж, Массачусетс: Издательство Гарвардского университета .
  2. ^ Роберт Карлсон (сентябрь 2003 г.). «Темпы и распространение биологических технологий». Биобезопасность и биотерроризм: стратегия, практика и наука биологической защиты . 1 (3: 203–214): 203–214. doi :10.1089/153871303769201851. PMID  15040198.
  3. ^ "Жизнь 2.0". The Economist. 31 августа 2006 г.
  4. ^ «Расходы на секвенирование ДНК». Национальный институт исследований генома человека .