Кэти Х. Ву

Американский учёный-компьютерщик

Кэти Х. Ву — профессор кафедры Эдварда Г. Джефферсона и директор Центра биоинформатики и вычислительной биологии (CBCB) в Университете Делавэра . Она также является директором Ресурса информации о белках (PIR) и Северо-восточного координационного комитета по биоинформатике, а также внештатным профессором Медицинского центра Джорджтаунского университета . ^[1]

Ранняя жизнь и образование

У — средний ребёнок из пяти дочерей и сына в семье. Она с отличием закончила Национальный тайваньский университет и проявила талант к науке, логике и вычислениям. Её отец был инженером-авиаконструктором . ^[2] Она получила степень бакалавра наук в области фитопатологии в Национальном тайваньском университете в 1978 году, степень магистра наук в области фитопатологии в Университете Пердью в 1982 году и степень доктора наук в том же университете в 1984 году. Затем она получила степень постдокторанта в области молекулярной биологии в Университете штата Мичиган в 1986 году и степень магистра наук в области компьютерных наук в Техасском университете (UT) в Тайлере в 1989 году. ^[1]

Карьера

В 1989 году Ву завершила свою диссертацию по использованию искусственных нейронных сетей для классификации белков и получила высшее образование. Ее научный руководитель Джордж М. Уитсон III, председатель кафедры компьютерных наук в Техасском университете, нанял ее после того, как она окончила университет в 1989 году. Затем она преподавала компьютерные науки в качестве доцента на кафедре компьютерных наук в Техасском университете в Тайлере с 1989 по 1994 год. Она также работала доцентом с 1990 по 1994 год, доцентом с 1994 по 1998 год и профессором с 1998 по 1999 год в Центре здоровья Техасского университета в Тайлере. Она проводила исследования в колледже медицинских наук Техасского университета в Тайлере под руководством профессора эпидемиологии и биоматематики Джерри МакКларти. Она проводила исследования в области биоинформатики с 1990 года и разработала несколько систем и баз данных классификации белков. Она также управляла крупными программными проектами и проектами баз данных, возглавляя усилия по биоинформатике Protein Information Resource (PIR) с 1999 года, и стала директором PIR и вице-президентом Национального фонда биомедицинских исследований, Вашингтон, округ Колумбия, с 2001 по 2002 год. С 2001 года по настоящее время она является профессором кафедры биохимии и молекулярной биологии и директором PIR Georgetown University Medical Center (GUMC). В настоящее время она также является профессором кафедры онкологии и членом Lombardi Comprehensive Cancer Center , GUMC с 2002 года. В 2009 году Ву была принята на должность заведующей кафедрой биоинформатики и вычислительной биологии имени Эдварда Г. Джефферсона в Университете Делавэра (UD). ^{[1] [3]}

Награды предоставлены

• 2020 г. — член Ассоциации вычислительной техники (ACM) ^[4]
• Июль 2012 г. — июнь 2017 г. — 1144726, NSF/DGE, IGERT: Системная биология клеток в инженерных средах (SBE2). Роль: со-исследователь
• Сентябрь 2011 г. — август 2015 г. — 2R01GM080646-06 и 3R01GM80646-07S1, NIH/NIGMS, PRO: Онтология белков в открытых биомедицинских онтологиях. Роль: PI
• Июль 2011 г. — июнь 2015 г. — 1062520, NSF/DBI, разработка ABI: интегративная биоинформатика для обнаружения знаний сетей PTM. Роль: PI
• Сентябрь 2011 г. — август 2014 г. — DOE/FOA-0000368, Экспериментальные системно-биологические подходы к производству биоэнергии на основе клостридий. Роль: со-исполнитель
• Ноябрь 2009 г. — февраль 2014 г. — 8P20GM103446, NIH/NIGMS, Делавэр, INBRE. Должность: главный директор по биоинформатике.
• Август 2010 г. - 2013 г. - 1G08 LM010720-01, NIH/NLM, Связывание интеллектуального анализа текста и интеллектуального анализа данных для обнаружения биомедицинских знаний. Роль: PI
• Сентябрь 2010 г. — июль 2013 г. — 1U41HG006104-01, NIH/NHGRI, UniProt: Централизованный ресурс последовательности и функции белка. Роль: со-исполнитель
• Сентябрь 2009 г. — август 2012 г. — DBI-0850319, NSF/DBI, Связывание интеллектуального анализа текста с онтологией и системной биологией. Роль: PI
• Июнь 2011 г. — май 2012 г. — 1137427, NSF/IIS, III: Small: Инициатива «Женщины в биоинформатике» на ACM BCB 2011. Роль: со-исполнитель
• Сентябрь 2009 г. — апрель 2012 г. — 3R01GM080646-04S2, NIH/NIGMS, Pro: Онтология белков в открытых биомедицинских онтологиях. Роль: PI ^[5]

Книги и публикации

Книги

• Биоинформатика для сравнительной протеомики (методы в молекулярной биологии), 19 ноября 2010 г., Кэти Х. Ву (редактор), Чумин Чен (редактор), ISBN  978-1607619765
• Computational Biology and Genome Informatics, февраль 2003 г., Кэти Х. Ву (автор), Пол П. Ванг (автор), Джейсон Т. Л. Ванг (редактор), ISBN 978-9812382573 
• Нейронные сети и геномная информатика, том 1 (Методы вычислительной биологии и биохимии), 5 октября 2000 г., CH Wu (редактор), JW McLarty (редактор), ISBN 978-0080428000 ^[1] 

Публикации

• UniProt: центр информации о белках. UniProt Consortium. Nucleic Acids Res. 28 января;43 (выпуск базы данных) (2015)
• Suzek, BE; Wang, Y; Huang, H; McGarvey, PB; Wu, CH (2014). «Кластеры UniRef: комплексная и масштабируемая альтернатива для улучшения поиска сходства последовательностей». Биоинформатика . 31 (6): 926–32. doi :10.1093/bioinformatics/btu739. PMC  4375400 . PMID  25398609.
• Натале, округ Колумбия; Ариги, Китай; Блейк, Дж.А.; Балт, CJ; Кристи, КР; Коварт, Дж; Д'Эстахио, П; Диль, AD; Драбкин, HJ; Хелфер, О; Хуанг, Х; Маски, AM; Рен, Дж; Робертс, Невада; Росс, К; Руттенберг, А; Шамовский, В; Смит, Б; Йеррамалла, MS; Чжан, Дж; Аль Джанахи, А; Челен, я; Ган, К; Льв, М; Шустер-Лезель, Э; Ву, CH (2014). «Онтология белков: контролируемая структурированная сеть белковых объектов». Нуклеиновые кислоты Рез . 42 (Проблема с базой данных): D415–21. дои : 10.1093/nar/gkt1173. ПМЦ  3964965 . PMID  24270789.
• Uniprot, Консорциум (2014). «Деятельность в Universal Protein Resource (UniProt)». Nucleic Acids Res . 42 (выпуск базы данных): D191–8. doi :10.1093/nar/gkt1140. PMC  3965022. PMID  24253303 .^[3]

Ссылки

1. "Центр биоинформатики и вычислительной биологии" . Получено 15 февраля 2015 г.
2. "Кэти Ву на перепутье" . Получено 15 февраля 2015 г.
3. "Информационный ресурс о белках, Кэти Х. Ву, доктор философии." Получено 15 февраля 2015 г.
4. "ACM Fellows" (PDF) . Уведомления Американского математического общества . 68 : 832.
5. "Справочник Университета Делавэра, Кэти Ву, Гранты". Архивировано из оригинала 2015-04-02 . Получено 15 февраля 2015 .

Внешние ссылки

• Информационный ресурс о белках
• Центр биоинформатики и вычислительной биологии, Университет Делавэра