Кенархей

Род архей

Ценархеум — монотипический род архейсемейства Ценархеевые . ^[2] Морские археи Cenarchaeum symbiosum являются психрофильными и обитают в морских губках. ^[3] Cenarchaeum symbiosum первоначально был обнаружен как основной симбиотический микроорганизм, обитающий внутри (он является эндосимбионтом ) губки Axinella mexicana . ^[3] Он повсеместно обнаруживается в мировом океане в более низких концентрациях, в то время как в некоторых родах морских губок он является одним из наиболее распространенных членов микробиома. Последовательность и разнообразие его генома были подробно исследованы с целью обнаружения уникальных продуктов метаболизма и его роли в активности по окислению аммиака.

Геном

Длина генома C. symbiosum оценивается в 2,02 миллиона пар оснований с прогнозируемым количеством генов 2011 года. ^[4]

Экология

Cenarchaeum symbiosum — психрофильный организм, способный выживать и размножаться при низких температурах, обычно в пределах 7–19 градусов Цельсия. C. symbiosum имеет симбиотические отношения с некоторыми видами губок, обычно обитающими на глубине 10–20 метров, обычно недалеко от Калифорнии.

Рекомендации

1. "Cenarchaeum Preston, Wu, Molinski & De Long, 1996" . Глобальный информационный фонд по биоразнообразию . Проверено 28 апреля 2024 г.
2. См. веб-страницу NCBI, посвященную Кенархею. Данные извлечены из «Ресурсов таксономии NCBI». Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 г.
3. Престон CM, Ву К.Ю., Молински Т.Ф., Де Лонг Э.Ф. (1996). «Психрофильный кренархеон обитает в морской губке: Cenarchaeum symbiosum gen. nov., sp. nov.». Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (13): 6241–6246. Бибкод : 1996PNAS...93.6241P. дои : 10.1073/pnas.93.13.6241 . ПМК 39006 . ПМИД  8692799. 
4. "Cenarchaeum symbiosum (Cenarchaeum symbiosum) Геномный браузерный шлюз" . Геномный браузерный шлюз . Проверено 25 мая 2011 г.

дальнейшее чтение

• Амин, Шейди А; Моффетт, Джеймс В.; Мартенс-Хаббена, Вильм; Жако, Джереми Э; Хан, Ян; Девол, Аллан; Ингаллс, Анитра Э; Шталь, Дэвид А; Армбруст, Восточная Вирджиния (ноябрь 2013 г.). «Потребность в меди археи, окисляющей аммиак, Nitrosopumilus maritimus SCM1 и значение нитрификации в морской среде». Лимнология и океанография . 58 (6): 2037–2045. Бибкод : 2013LimOc..58.2037A. дои : 10.4319/lo.2013.58.6.2037. S2CID  86826960.
• Гарсия-Бонилья Э., Брандао ПФБ, Перес Т., Хунка Х. (2018), «Стабильный и обогащенный Cenarchaeum symbiosum и некультивируемые бетапротеобактерии HF1 в микробиоме средиземноморской губки Haliclona fulva (Demospongiae: Haplosclerida)», Микробная экология , 77 , Springer Science and Business Media LLC: 25–36, номер номера : 10.1007/s00248-018-1201-5, PMID  29766224.
• Халлам, Стивен Дж; Константинидис, Константинос Т; Патнэм, Ник; Шлепер, Криста; Ватанабэ, Ёичи; Сугахара, Дзюнъити; Престон, Кристина; де ла Торре, Хосе; Ричардсон, Пол М; Делонг, Эдвард (28 ноября 2006 г.). «Геномный анализ некультивируемого морского кренархеота Cenarchaeum symbiosum». Труды Национальной академии наук . 103 (48): 18296–18301. Бибкод : 2006PNAS..10318296H. дои : 10.1073/pnas.0608549103 . ПМЦ  1643844 . ПМИД  17114289.
• Цинь В., Чжэн Ю., Чжао Ф., Ван Ю., Уракава Х., Мартенс-Хаббена В., Лю Х., Хуан Х., Чжан Х., Накагава Т. ., Менде, Д.Р., Боллманн, А., Ван, Б., Чжан, Ю., Амин, С.А., Нильсен, Дж.Л., Мори, К., Такахаши, Р., Вирджиния Армбруст, Э., Винклер, М.- К.Х., Делонг, Э.Ф., Ли, М., Ли, П.-Х., Чжоу, Дж., Чжан, К., Чжан, Т., Шталь, Д.А., Ингаллс, А.Е. (2020), «Альтернативные стратегии питательных веществ Карта сбора и сохранения энергии в биогеографии морских архей, окисляющих аммиак», The ISME Journal , 14 (10), Oxford University Press (OUP): 2595–2609, Bibcode : 2020ISMEJ..14.2595Q, doi : 10.1038/s41396- 020-0710-7, PMID  32636492
• Шлепер, Криста; Суонсон, Рональд В.; Матур, Эрик Дж.; Делонг, Эдвард Ф. (декабрь 1997 г.). «Характеристика ДНК-полимеразы некультивируемого психрофильного архея Cenarchaeum symbiosum». Журнал бактериологии . 179 (24): 7803–7811. дои : 10.1128/jb.179.24.7803-7811.1997. ЧВК  179745 . ПМИД  9401041.
• Свон, Брэндон К.; Мартинес-Гарсия, Мануэль; Чаффин, Марк Д.; Моррисон, Хилари Г.; Филд, Эрин К.; Поултон, Николь Дж.; Масланд, Э. Дэшил П.; Харрис, Кристофер С.; Щирба, Александр; Чейн, Патрик С.Г.; Корень, Сергей; Войке, Таня; Степанаускас, Рамунас; и другие. (17 апреля 2014 г.). «Геномное и метаболическое разнообразие морской группы I Thaumarchaeota в мезопелагии двух субтропических круговоротов». ПЛОС ОДИН . 9 (4): е95380. Бибкод : 2014PLoSO...995380S. дои : 10.1371/journal.pone.0095380 . ПМЦ  3990693 . ПМИД  24743558.
• Алвес, Р. Дж. Е., Мин, Б. К., Урих, Т., Хеселер, А. фон, Шлепер, К. (2018), «Объединение глобальной филогении и распределения в окружающей среде архей, окисляющих аммиак, на основе генов amoA», Nature Communications , 9 , Springer Science and Business Media LLC: 1517, Bibcode : 2018NatCo...9.1517A, doi : 10.1038/s41467-018-03861-1, PMC  5904100 , PMID  29666365