stringtranslate.com

Хламидии (род)

Хламидии — род патогенных грамотрицательных бактерий , являющихся облигатными внутриклеточными паразитами . Хламидийные инфекции являются наиболее распространенными бактериальными заболеваниями, передающимися половым путем, у людей и основной причиной инфекционной слепоты во всем мире. [1]

Виды включают Chlamydia trachomatis (возбудитель человека), Ch. suis (воздействует только на свиней ) и Ch. muridarum (поражает только мышей и хомяков ). [2] Люди в основном заражаются Ch. трахоматис , гл. pneumoniae , Ch. абортус и Ch. пситачи . [3]

Классификация

Из-за уникального цикла развития хламидий они были таксономически выделены в отдельный порядок. [4] Хламидии относятся к порядку Chlamydiales, семейству Chlamydiaceae. [ нужна цитата ]

В начале 1990-х годов было известно шесть видов хламидий . В результате масштабного переописания порядка Chlamydiales в 1999 году с использованием новых на тот момент методов анализа ДНК три вида были выделены из рода Chlamydia и реклассифицированы в недавно созданный тогда род Chlamydophila , а также добавлены три новых вида к этому роду. . [5] В 2001 году многие бактериологи категорически возражали против реклассификации, [6] хотя в 2006 году некоторые ученые все еще поддерживали отличие Chlamydophila . [7] В 2009 году достоверность Chlamydophila была оспорена новыми методами анализа ДНК, что привело к предложению «воссоединить Chlamydiaceae в единый род Chlamydia ». [8] Судя по всему, это было принято сообществом, [9] [10] доведя число (действительных) видов хламидий до 9. Многие вероятные виды были впоследствии изолированы, но никто не удосужился назвать их. В 2013 г. был добавлен 10-й вид Ch. ibidis , известный только по дикому священному ибису во Франции. [11] Еще два вида были добавлены в 2014 г. (но подтверждены в 2015 г.): Ch. avium , поражающий голубей и попугаев, и Ch. Gallinacea, поражающая кур, цесарок и индеек. [3] Гл. abortus был добавлен в 2015 году, а вид Chlamydophila был реклассифицирован. [6] Ряд новых видов первоначально были классифицированы как аберрантные штаммы Ch. пситачи [3]

Геномы

Виды Chlamydia имеют геномы длиной от 1,0 до 1,3 мегабаз . [12] Большинство из них кодируют от ~900 до 1050 белков. [13]  Некоторые виды также содержат ДНК-плазмиды или фаговые геномы (см. Таблицу). Элементарное тельце содержит РНК-полимеразу, ответственную за транскрипцию ДНК-генома после проникновения в цитоплазму клетки-хозяина и начала цикла роста. В этих тельцах находятся рибосомы и рибосомальные субъединицы. [14]

Таблица 1. Особенности генома отдельных видов и штаммов хламидий . MoPn является патогеном мышей, а штамм «D» — патогеном человека. Около 80% генов Ch. trachomatis и Ch. pneumoniae являются ортологами. Адаптировано по материалам Read et al. 2000 [13]

Цикл развития

Хламидии могут встречаться в форме элементарного тельца и сетчатого тела. Элементарное тело — это нереплицирующаяся инфекционная частица, которая высвобождается при разрыве инфицированных клеток. Он отвечает за способность бактерий передаваться от человека к человеку и аналогичен споре . Элементарное тело может иметь диаметр от 0,25 до 0,30 мкм. Эта форма покрыта жесткой клеточной стенкой (отсюда и объединяющая форма хламида- в названии рода). Элементарное тело индуцирует собственный эндоцитоз при воздействии на клетки-мишени. Одна фаголизосома обычно производит около 100–1000 элементарных тел. [ нужна цитата ]

Хламидии могут также иметь форму сетчатого тела, которое на самом деле является внутрицитоплазматической формой, активно участвующей в процессе репликации и роста этих бактерий. Сетчатое тело немного крупнее элементарного тела и может достигать в диаметре до 0,6 мкм при минимальном диаметре 0,5 мкм. Он не имеет клеточной стенки. При окраске йодом сетчатые тельца выглядят как включения в клетке. Геном ДНК, белки и рибосомы сохраняются в сетчатом теле. Это происходит в результате цикла развития бактерий. Ретикулярное тельце — это, по сути, структура, в которой геном хламидий транскрибируется в РНК, синтезируются белки и реплицируется ДНК. Сетчатое тело делится путем бинарного деления с образованием частиц, которые после синтеза внешней клеточной стенки развиваются в новое потомство инфекционных элементарных тел. Слияние длится около трех часов, а инкубационный период может достигать 21 дня. После деления сетчатое тело снова превращается в элементарную форму и высвобождается клеткой путем экзоцитоза . [4]

Исследования цикла роста Ch. trachomatis и Ch. psittaci в культурах клеток in vitro показывают, что инфекционное элементарное тельце (EB) развивается в неинфекционное сетчатое тельце (RB) внутри цитоплазматической вакуоли инфицированной клетки. После попадания элементарного тела в инфицированную клетку наступает 20-часовая фаза затмения, в течение которой инфекционная частица развивается в сетчатое тело. Выход элементарных тел хламидий максимален через 36–50 часов после заражения. [14]

Гистоны, подобные белкам HctA и HctB, играют роль в контроле дифференциации между двумя типами клеток. Экспрессия HctA жестко регулируется и подавляется небольшой некодирующей РНК IhtA до поздней редифференцировки RB в EB. [15] РНК IhtA консервативна у всех видов Chlamydia . [16]

Патология

Большинство хламидийных инфекций не вызывают симптомов. [17] Симптоматические инфекции часто включают ощущение жжения при мочеиспускании, а также боль и дискомфорт в животе или гениталиях. [18] Всем людям, вступавшим в половую связь с потенциально инфицированными людьми, может быть предложен один из нескольких тестов для диагностики этого заболевания. [ нужна ссылка ] Тесты амплификации нуклеиновых кислот (NAAT), которые включают полимеразную цепную реакцию (ПЦР), транскрипционно-опосредованную амплификацию (ТМА), лигазную цепную реакцию (LCR) и амплификацию смещения цепи (SDA), являются наиболее широко используемыми диагностическими методами. тест на хламидиоз . [19]

Эволюция

Недавние филогенетические исследования показали, что хламидии, вероятно, имеют общего предка с цианобактериями , группой, содержащей эндосимбионтного предка хлоропластов современных растений , следовательно, хламидии сохраняют необычные растительноподобные черты, как генетически , так и физиологически . В частности, фермент L,L-диаминопимелатаминотрансфераза , связанный с выработкой лизина в растениях, также связан со строительством хламидийного пептидогликана , необходимого для деления. [20] Генетическая кодировка ферментов удивительно схожа у растений, цианобактерий и хламидий , что свидетельствует о близком общем происхождении. [21]

Филогения

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Дрю, В. Лоуренс (2004). «Хламидии». В Райане, Кеннете; Рэй, К. Джордж (ред.). Медицинская микробиология Шерриса (PDF) (4-е изд.). МакГроу Хилл. стр. 463–470. ISBN 978-0-8385-8529-0.
  2. ^ Уорд М. «Диаграмма таксономии». Chlamydiae.com . Архивировано из оригинала 18 сентября 2010 г. Проверено 28 октября 2008 г.
  3. ^ abc Джозеф, SJ; и другие. (2015), «Геномика Chlamydiaceae выявляет межвидовую примесь и недавнюю эволюцию Chlamydia abortus, заражающую низшие виды млекопитающих и человека», Genome Biol Evol , 7 (11): 3070–3084, doi : 10.1093/gbe/evv201, PMC 4994753 , PMID  26507799. 
  4. ^ ab "Chlamydia trachomatis". Архивировано из оригинала 2 июля 2010 года . Проверено 18 июня 2010 г.
  5. ^ Эверетт К.Д., Буш Р.М., Андерсен А.А. (апрель 1999 г.). «Исправленное описание порядка Chlamydiales, предложение Parachlamydiaceae семейства nov. и Simkaniaceae семейства nov., каждый из которых содержит один монотипический род, пересмотренная таксономия семейства Chlamydiaceae, включающая новый род и пять новых видов, а также стандарты для идентификации организмы». Межд. Дж. Сист. Бактериол . 49 (2): 415–40. дои : 10.1099/00207713-49-2-415 . ПМИД  10319462.
  6. ^ аб Парте, АК «Хламидиоз». ЛПСН .
  7. ^ Гриффитс Э., Вентреска М.С., Гупта Р.С. (2006). «BLAST-скрининг геномов хламидий для выявления сигнатурных белков, уникальных для групп видов Chlamydiales, Chlamydiaceae, Chlamydophila и Chlamydia». БМК Геномика . 7:14 . дои : 10.1186/1471-2164-7-14 . ПМЦ 1403754 . ПМИД  16436211. 
  8. ^ Стивенс Р.С., Майерс Г., Эппингер М., Бавойл П.М. (март 2009 г.). «Расхождение без различий: решены филогенетика и таксономия хламидий». ФЭМС Иммунол. Мед. Микробиол . 55 (2): 115–9. дои : 10.1111/j.1574-695X.2008.00516.x . ПМИД  19281563.
  9. ^ Греуб, Гилберт (1 ноября 2010 г.). «Подкомитет Международного комитета по систематике прокариот по таксономии хламидий, протокол первого закрытого заседания, 21 марта 2009 г., Литл-Рок, Арканзас, США». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 60 (11): 2691–2693. дои : 10.1099/ijs.0.028225-0 . ПМИД  21048221.
  10. ^ Бальзамо, Дж; и другие. (2017), «Сборник мер по контролю инфекции Chlamydia psittaci среди людей (орнитоз) и домашних птиц (птичий хламидиоз), 2017» (PDF) , J Avian Med Surg , 31 (3): 262–282, doi : 10.1647/ 217-265 , PMID  28891690, S2CID  26000244.
  11. ^ Воримор, Фабьен; Ся, Жу-цзин; Хуот-Кризи, Хизер; Бастиан, Сюзанна; Деруйтер, Люси; Пассет, Энн; Саксе, Конрад; Бавоил, Патрик; Майерс, Гарри; Ларукау, Карин (20 сентября 2013 г.). «Выделение нового вида хламидий от дикого священного ибиса (Threskiornis aethiopicus) - Chlamydia ibidis». ПЛОС ОДИН . 8 (9). е74823. Бибкод : 2013PLoSO...874823V. дои : 10.1371/journal.pone.0074823 . ПМЦ 3779242 . ПМИД  24073223. 
  12. ^ «Бактериальные геномы EMBL» . Проверено 19 января 2012 г.
  13. ^ аб Рид, Т.Д.; Брунэм, Колорадо; Шен, К.; Гилл, СР; Гейдельберг, Дж. Ф.; Уайт, О.; Хикки, ЕК; Петерсон, Дж.; Аттербек, Т. (15 марта 2000 г.). «Последовательности генома Chlamydia trachomatis MoPn и Chlamydia pneumoniae AR39». Исследования нуклеиновых кислот . 28 (6): 1397–1406. дои : 10.1093/нар/28.6.1397. ISSN  1362-4962. ПМК 111046 . ПМИД  10684935. 
  14. ^ аб Беккер, Йехиэль (1996). «Хламидии». В Бароне С. (ред.). Медицинская микробиология (4-е изд.). Медицинский филиал Техасского университета в Галвестоне. ISBN 0-9631172-1-1. ПМИД  21413294.
  15. ^ Гришабер, Н.А.; Гришабер, СС; Фишер, скорая помощь; Хакштадт, Т (2006). «Маленькая РНК ингибирует трансляцию гистоноподобного белка Hc1 в Chlamydia trachomatis». Мол. Микробиол . 59 (2): 541–50. дои : 10.1111/j.1365-2958.2005.04949.x. PMID  16390448. S2CID  11872982.
  16. ^ Таттерсолл, Дж; Рао, Г.В.; Рунак, Дж; Хакштадт, Т; Гришабер, СС; Гришабер, Н.А. (2012). «Ингибирование трансляции белка цикла развития HctA с помощью малой РНК IhtA сохраняется у хламидий». ПЛОС ОДИН . 7 (10): е47439. Бибкод : 2012PLoSO...747439T. дои : 10.1371/journal.pone.0047439 . ПМЦ 3469542 . ПМИД  23071807. 
  17. ^ «Защита от хламидиоза» . Проверено 1 августа 2010 г.
  18. ^ «Хламидиоз». Всемирная организация здравоохранения . 17 июля 2023 г. Проверено 25 декабря 2023 г.
  19. ^ «Факты о хламидиях». Европейский центр профилактики и контроля заболеваний . Проверено 25 декабря 2023 г.
  20. ^ Лихти, GW; Куру, Э.; Холл, Э.; Калинда, А.; Брун, Ю.В.; ВанНьевенце, М.; Маурелли, AT (февраль 2014 г.). «Новый метод метаболической маркировки клеточной стенки обнаруживает пептидогликан в Chlamydia trachomatis». Природа . 506 (7489): 507–510. дои : 10.1038/nature12892. ISSN  1476-4687. ПМЦ 3997218 . ПМИД  24336210. 
  21. ^ Маккой А.Дж., Адамс Н.Е., Хадсон А.О., Гилварг С., Леустек Т., Маурелли А.Т. (2006). «L,L-диаминопимелатаминотрансфераза, трансферментный фермент, общий для хламидий и растений для синтеза диаминопимелата/лизина». Учеб. Натл. акад. наук. США . 103 (47): 17909–14. Бибкод : 2006PNAS..10317909M. дои : 10.1073/pnas.0608643103 . ПМЦ 1693846 . ПМИД  17093042. 
  22. ^ "ЛТП" . Проверено 20 ноября 2023 г.
  23. ^ "Дерево LTP_all в формате Ньюика" . Проверено 20 ноября 2023 г.
  24. ^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
  25. ^ "Выпуск GTDB 08-RS214" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
  26. ^ "bac120_r214.sp_label". База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
  27. ^ «История таксона». База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

дальнейшее чтение