В иммунологии конформационный эпитоп представляет собой последовательность субъединиц (обычно аминокислот ), составляющих антиген , которые вступают в прямой контакт с рецептором иммунной системы .
Антиген — это любое вещество, которое иммунная система может распознать как чужеродное. Антигены — это обычно белки , которые слишком велики, чтобы целиком связываться с любым рецептором, поэтому только определенные сегменты, которые образуют антиген, связываются с определенным рецептором. Такие сегменты называются эпитопами . Аналогично, только паратоп рецептора контактирует с эпитопом.
Белки состоят из повторяющихся азотсодержащих субъединиц, называемых аминокислотами , которые в природе не существуют в виде прямых цепей , а в виде сложенных завитков со сложными петлями. Последнее известно как третичная структура белка. Таким образом, всякий раз, когда рецептор взаимодействует с непереваренным антигеном, поверхностные аминокислоты, которые вступают в контакт, могут не быть непрерывными друг с другом, если белок раскручен. Такие прерывистые аминокислоты, которые объединяются в трехмерную конформацию и взаимодействуют с паратопом рецептора, называются конформационными эпитопами. Напротив, если антиген переваривается, образуются небольшие сегменты, называемые пептидами , которые связываются с молекулами главного комплекса гистосовместимости , а затем позже с рецепторами Т-клеток через аминокислоты, которые непрерывны в линию. Они известны как линейные эпитопы . [1]