Кубок Кипра 1948–49 годов был 12-м изданием Кубка Кипра. Всего в соревновании приняли участие 8 клубов. Он начался 13 марта 1949 года с четвертьфиналов и завершился 19 июня 1949 года финалом-переигровкой, который состоялся на стадионе GSP. «Анортосис» выиграл свой первый трофей Кубка Кипра, обыграв в финале АПОЭЛ со счетом 3–0.
В Кубке Кипра 1948–49 годов приняли участие все команды Первого дивизиона Кипра .
Соревнование состояло из трех раундов на выбывание. Во всех раундах каждый матч проводился в формате одного матча и на домашнем поле одной из двух команд в соответствии с результатами жеребьевки. Каждый победитель матча проходил в следующий раунд. Если матч заканчивался вничью, назначалось дополнительное время. Если матч заканчивался вничью, назначалась переигровка.
Прекращено на 87-й минуте из-за драк между игроками и толпой.