Дифференциально метилированные регионы (DMR) — это геномные регионы с различным статусом метилирования ДНК в разных биологических образцах, которые рассматриваются как возможные функциональные регионы, участвующие в регуляции транскрипции генов . Биологическими образцами могут быть разные клетки/ткани в пределах одного и того же индивидуума, одна и та же клетка/ткань в разное время, клетки/ткани от разных индивидуумов, даже разные аллели в одной и той же клетке. [1]
ДНК в основном метилирована в сайте CpG , который представляет собой цитозин, за которым следует гуанин . «P» относится к фосфатному линкеру между ними. DMR обычно включает смежные сайты или группу сайтов, расположенных близко друг к другу, которые имеют разные паттерны метилирования в разных образцах. Островки CpG , по-видимому, неметилированы в большинстве нормальных тканей, однако они сильно метилированы в раковых тканях. [1]
Существует несколько различных типов DMR. Они включают тканеспецифический DMR (tDMR), раковоспецифический DMR (cDMR), стадии развития (dDMR), репрограммирующий-специфический DMR (rDMR), аллель-специфический DMR (AMR) и стареющий-специфический DMR (aDMR). [1] Метилирование ДНК связано с дифференциацией и пролиферацией клеток . [2]