stringtranslate.com

Гаплогруппа E-M215

Географическое распространение гаплогруппы E1b1b Y-хромосомы

E-M215 , также известный как E1b1b-M215 , представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы человека . E-M215 имеет две базальные ветви: E-M35 и E-M281. E-M35 в основном распространен в Северной Африке и на Африканском Роге , реже встречается на Ближнем Востоке , в Европе и Южной Африке . E-M281 встречается с низкой частотой в Эфиопии .

Происхождение

Карта происхождения E1b1b1

Происхождение E-M215 было датировано Кручиани в 2007 году примерно 22 400 лет назад в Восточной Африке . [3] [Примечание 1]

Древняя ДНК

По данным Лазаридиса и др. (2016), натуфийские скелетные останки из древнего Леванта преимущественно содержали гаплогруппу Y-ДНК E1b1b. Из пяти натуфийских образцов, проанализированных на предмет отцовских линий, три принадлежали к субкладам E1b1b1b2(xE1b1b1b2a,E1b1b1b2b), E1b1(xE1b1a1,E1b1b1b1) и E1b1b1b2(xE1b1b1b2a,E1b1b1b2b) (60%). Гаплогруппа E1b1b также обнаруживалась с умеренной частотой среди окаменелостей из последующей докерамической неолитической культуры B, при этом субклады E1b1b1 и E1b1b1b2 (xE1b1b1b2a, E1b1b1b2b) наблюдались в двух из семи образцов PPNB (~ 29%). Ученые предполагают, что ранние левантийские земледельцы, возможно, распространились на юг, в Восточную Африку, принося с собой западно-евразийские и базально-евразийские предковые компоненты, отдельные от тех, которые позже прибыли в Северную Африку.

Кроме того, гаплогруппа E1b1b1 была обнаружена в древней египетской мумии, раскопанной на археологическом памятнике Абусир-эль-Мелек в Среднем Египте, который датируется периодом между поздним Новым царством и римской эрой . [6] Окаменелости на иберомаврском стоянке Ифри Н'Амр Оу Мусса в Марокко , датированные примерно 5000 годом до нашей эры, также несли гаплотипы, относящиеся к субкладу E1b1b1b1a (E-M81). Эти древние люди несли автохтонный геномный компонент Магриби, который достигает максимума среди современных жителей Северной Африки , что указывает на то, что они были предками популяций в этом районе. [7] Гаплогруппа E1b1b также наблюдалась в древних окаменелостях гуанчей , раскопанных на Гран-Канарии и Тенерифе на Канарских островах , которые были датированы радиоуглеродом между 7 и 11 веками нашей эры. Особи-носители клады, которые были проанализированы на наличие отцовской ДНК, были захоронены на территории Тенерифе, при этом все эти экземпляры оказались принадлежащими к субкладу E1b1b1b1a1 или E-M183 (3/3; 100%). [8]

Лоосдрехт и др. (2018) проанализировали полногеномные данные семи древних иберомавров из Голубиной пещеры недалеко от Тафоральта на востоке Марокко. Окаменелости были напрямую датированы периодом от 15 100 до 13 900 лет назад. Ученые обнаружили, что пять экземпляров мужского пола с достаточной сохранностью ядерной ДНК принадлежали к субкладу E1b1b1a1 (M78), причем один скелет нес родительскую линию E1b1b1a1b1 к E-V13, другой экземпляр мужского пола принадлежал к E1b1b (M215*). [9]

Распределение

В Африке E-M215 наиболее часто встречается на Африканском Роге и в Северной Африке , особенно в странах Сомали и Марокко , откуда за последние тысячелетия он распространился на юг до Южной Африки и на север, в Западную Азию и Европу . особенно Средиземноморье и Балканы ). [10] [11] [12] [13] E-M281 был найден в Эфиопии . [11]

Почти все мужчины E-M215 также состоят в E-M35. В 2004 году было обнаружено, что M215 старше M35, когда были обнаружены люди, у которых есть мутация M215, но нет мутации M35. [10] В 2013 году Ди Кристофаро и др. (2013) обнаружили у одного человека в Хорасане, на северо-востоке Ирана, положительный результат на M215, но отрицательный результат на M35. [14]

Географическое распространение гаплогрупп Y-хромосомы избранных популяций Африки, Ближнего Востока и Европы. [15]

E-M215 и E-M35 довольно распространены среди говорящих на афроазиатском языке . Лингвистическая группа и носители линии Е-М35 с высокой вероятностью возникли и рассеялись вместе из афроазиатской урхеймата . [16] Среди населения с афро-азиатскоязычным прошлым значительная часть еврейских мужских линий принадлежит к E-M35. [17] Гаплогруппа E-M35 , на которую приходится примерно от 18% [11] до 20% [18] [19] ашкенази и от 8,6% [20] до 30% [11] сефардских Y-хромосом, по-видимому, является одной из них . из основных основополагающих линий еврейского населения. [21] [Примечание 2]

Ассоциация Э-М215 с выносливостью

Моран и др. (2004) заметили, что среди клад Y-ДНК (отцовских) элитных спортсменов на выносливость в Эфиопии гаплогруппа E3b1 отрицательно коррелирует с элитными спортивными показателями выносливости, [22] тогда как гаплогруппы E* , E3* , K*(xP) , [22] и J*(xJ2) встречались значительно чаще среди элитных спортсменов, занимающихся выносливостью. [22]

Субклады

Э-М35

Гаплогруппа E-M35 является субкладом E-M215.

Э-М281

Гаплогруппа E-M281 является субкладом E-M215.

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в научной литературе существовало как минимум семь систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В таблице ниже собраны все эти работы, относящиеся к знаковому дереву YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему старую опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

Научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

Обсуждение

E-M215 и E1b1b1 - это общепринятые в настоящее время названия, найденные в предложениях Консорциума Y-хромосомы (YCC) для клад, определяемых мутациями M215 и M35 соответственно, которые также могут называться E-M215 и E-M35. [23] Номенклатура E3b (E-M215) и E3b1 (E-M35) соответственно были именами, определенными YCC, которые использовались для обозначения тех же гаплогрупп в старой литературе с разветвлением E-M35 как отдельный субклад E-M215 в 2004 году. [ 10] До 2002 года эти гаплогруппы не обозначались единым образом, как и их связь с другими родственными кладами в гаплогруппе E и гаплогруппе DE . Но в нестандартной или более старой терминологии E-M215, например, примерно такой же, как «гаплотип V», который до сих пор используется в таких публикациях, как Gérard et al. (2006). [24]

Филогенетические деревья

Кладограмма с основными субкладами:

Следующее филогенетическое дерево основано на дереве YCC 2008 и последующих опубликованных исследованиях, обобщенных ISOGG. В него входят все известные субклады по состоянию на июнь 2015 г. (Тромбетта и др., 2015) [25] [23] [24]

Смотрите также

Генетика

Субклады Y-ДНК E

Основополагающее дерево Y-ДНК

Примечания

  1. ^ Кручиани и др. (2004): «Несколько наблюдений указывают на Восточную Африку как на родину гаплогруппы E3b — то есть, она имела (1) наибольшее количество различных клад E3b (таблица 1), (2) высокую частоту этой гаплогруппы и высокую микросателлитное разнообразие и, наконец, (3) исключительное присутствие недифференцированной парагруппы E3b* ». Как упоминалось выше, «E3b» — старое название E-M215. Семино и др. (2004): «Этот вывод дополнительно подтверждается наличием дополнительной линейной диверсификации Hg E и самой высокой частотой E-P2* и E-M35* в одном и том же регионе. Распространение E-P2*, по-видимому, ограничивается восточным регионом. Африканские народы. Линия E-M35* показывает самую высокую частоту (19,2%) у эфиопских оромо, но с более широким ареалом распространения, чем E-P2*». Для E-M215 Cruciani et al. (2007) снизили свою оценку до 22 400 с 25 600 в Cruciani et al. (2004), повторно калибруя те же данные.
  2. ^ «Парагруппа E-M35 * и гаплогруппа J-12f2a * соответствуют критериям основных линий-основателей AJ, поскольку они широко распространены как в популяциях AJ, так и в популяциях Ближнего Востока, и встречаются с гораздо меньшей частотой в европейских нееврейских популяциях». Бехар и др. (2004)

Рекомендации

  1. ^ аб Тромбетта 2015.
  2. ^ Хабер М., Джонс А.Л., Коннел Б.А., Асан, Арсьеро Э., Хуанмин Ю., Томас М.Г., Сюэ Ю., Тайлер-Смит С. (июнь 2019 г.). «Редкая глубоко укоренившаяся африканская гаплогруппа Y-хромосомы D0 и ее значение для расселения современного человека за пределы Африки». Генетика . 212 (4): 1421–1428. дои : 10.1534/genetics.119.302368 . ПМК 6707464 . ПМИД  31196864. 
  3. ^ аб Кручиани и др. (2007)
  4. ^ "E-M215 YTree" .
  5. ^ Кручиани и др. (2004).
  6. ^ Шунеманн, Верена Дж.; и другие. (2017). «Геномы древнеегипетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримские периоды». Природные коммуникации . 8 : 15694. Бибкод : 2017NatCo...815694S. doi : 10.1038/ncomms15694. ПМЦ 5459999 . ПМИД  28556824. 
  7. ^ Фрегель; и другие. (2018). «Древние геномы из Северной Африки свидетельствуют о доисторических миграциях в Магриб как из Леванта, так и из Европы». bioRxiv 10.1101/191569 . 
  8. ^ Родригес-Варела; и другие. (2017). «Геномный анализ человеческих останков доевропейских завоеваний с Канарских островов показывает близкое родство с современными жителями Северной Африки». Современная биология . 27 (1–7): 3396–3402.e5. дои : 10.1016/j.cub.2017.09.059 . hdl : 2164/13526 . ПМИД  29107554.
  9. ^ Ван Де Лоосдрехт, Марике; Бузуггар, Абдельджалил; Хамфри, Луиза; Пост, Козимо; Бартон, Ник; Аксиму-Петри, Айинуэр; Никель, Биргит; Нагель, Сара; Тальби, Эль-Хасан; Эль-Хаджрауи, Мохаммед Абдельджалил; Амзази, Саид; Юблин, Жан-Жак; Паабо, Сванте; Шиффельс, Стефан; Мейер, Матиас; Хаак, Вольфганг; Чон, Чунгвон; Краузе, Йоханнес (4 мая 2018 г.). «Плейстоценовые геномы Северной Африки связывают человеческие популяции Ближнего Востока и Африки к югу от Сахары». Наука . 360 (6388): 548–552. Бибкод : 2018Sci...360..548В. дои : 10.1126/science.aar8380 . PMID  29545507. S2CID  206666517.
  10. ^ abc Cruciani et al. (2004)
  11. ^ abcd Семино и др. (2004)
  12. ^ Россер и др. (2000)
  13. ^ Фирасат и др. (2006)
  14. ^ Ди Кристофаро, Джули; и другие. (18 октября 2013 г.). «Афганский Гиндукуш: где сходятся потоки генов Евразийского субконтинента». ПЛОС ОДИН . 8 (10): е76748. Бибкод : 2013PLoSO...876748D. дои : 10.1371/journal.pone.0076748 . ISSN  1932-6203. OCLC  5534533323. PMC 3799995 . PMID  24204668. S2CID  16455960. 
  15. ^ Бадро, Даниэль А.; Дуэи, Бушра; Хабер, Марк; Юханна, Соня С.; Саллум, Анжелика; Гассибе-Саббах, Мишелла; Джонсруд, Брайан; Хазен, Жорж; Матису-Смит, Элизабет; Сория-Эрнанц, Дэвид Ф.; Уэллс, Р. Спенсер; Тайлер-Смит, Крис; Платт, Дэниел Э.; Заллуа, Пьер А.; Консорциум, The Genographic (30 января 2013 г.). «Генетика Y-хромосомы и мтДНК выявляет значительные различия в сходстве современного населения Ближнего Востока с населением Европы и Африки». ПЛОС ОДИН . 8 (1): e54616. Бибкод : 2013PLoSO...854616B. дои : 10.1371/journal.pone.0054616 . ISSN  1932-6203. ПМЦ 3559847 . ПМИД  23382925. 
  16. ^ Эрет, Кейта и Ньюман (2004); Кейта и Бойс (2005); Кейта (2008).
  17. ^ Бехар и др. (2003)
  18. ^ Бехар и др. (2004)
  19. ^ Шен и др. (2004)
  20. ^ Адамс и др. (2008)
  21. ^ Небель и др. (2001)
  22. ^ abc Моран, Колин Н.; и другие. (2004). «Гаплогруппы Y-хромосомы элитных эфиопских бегунов на выносливость». Генетика человека . 115 (6): 492–7. дои : 10.1007/s00439-004-1202-y. PMID  15503146. S2CID  13960753 . Проверено 6 февраля 2017 г.
  23. ^ аб Карафет и др. (2008)
  24. ^ Консорциум ab Y-хромосомы "YCC" (2002)
  25. ^ ИЗОГГ (2011)
  26. ^ abc ISOGG 2015

Библиография

Источники таблиц преобразования